以49個全基因組序列已經(jīng)公布的真菌為研究對象,通過OrthoVenn2同源基因簇比對、BLASTp比對和關(guān)鍵詞搜索3種方法對G蛋白信號調(diào)控因子（regulators of G-protein signaling,RGS）同源基因進行比對分析,并結(jié)合SMART進行保守結(jié)構(gòu)域分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn),49個真菌中共有229個RGS蛋白,每種真菌中所含有RGS蛋白的數(shù)量范圍為3～9個,且死體營養(yǎng)型病原菌和半活體營養(yǎng)型病原菌的RGS蛋白數(shù)量高于活體營養(yǎng)型病原菌;根據(jù)RGS蛋白中保守結(jié)構(gòu)域進行分類,可以劃分為DEP-RGS、RGS-TM、PXA-RGS-PX、RGS、RGS-PAS-PAC、TM-RGS等6種,其中,具有RGS-PAS-PAC和TM-RGS這2種特殊保守結(jié)構(gòu)域的RGS蛋白主要集中在半活體營養(yǎng)型病原菌和死體營養(yǎng)型病原菌;進一步對229個RGS蛋白進行遺傳關(guān)系分析,發(fā)現(xiàn)具有同種保守結(jié)構(gòu)域的RGS蛋白親緣關(guān)系較近。上述研究結(jié)果表明植物病原絲狀真菌的寄生性與RGS蛋白數(shù)量和種類之間存在著一定的關(guān)聯(lián)性。 

【文章來源】：華中農(nóng)業(yè)大學學報. 2020,39(06)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：7 頁

【部分圖文】：

不同真菌中RGS蛋白數(shù)量對比分析

對49個真菌的229條RGS蛋白序列進行遺傳關(guān)系分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn),229個序列聚為6類,該結(jié)果與通過保守結(jié)構(gòu)域預測結(jié)果所分類別一致。其中類型Ⅰ、Ⅵ和Ⅲ親緣關(guān)系上較近,類型Ⅱ和Ⅳ在親緣關(guān)系上較近,Ⅴ類單獨為一支(圖3)。圖3 不同真菌中RGS蛋白序列之間的遺傳關(guān)系

不同真菌中RGS蛋白序列之間的遺傳關(guān)系

【參考文獻】：
期刊論文
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[2]植物病原絲狀真菌分泌蛋白及CAZymes的研究進展[J]. 韓長志,許僖.  南京林業(yè)大學學報(自然科學版). 2017(05)
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碩士論文
[1]稻瘟病菌RGS家族蛋白RGS結(jié)構(gòu)域的功能解析及Dynamin家族蛋白MoDnm2、MoDnm3的生物學功能研究[D]. 樂鑫怡.南京農(nóng)業(yè)大學 2017



本文編號：3621299