小麥品種YacoS成株期抗條銹病主效QTL定位及小麥抗赤霉病基因Fhb1的分子檢測(cè)
發(fā)布時(shí)間:2022-02-10 20:55
小麥條銹病是由真菌條形柄銹菌引起的一種主要分布于濕冷環(huán)境的世界級(jí)小麥病害,嚴(yán)重威脅著小麥安全生產(chǎn)。盡管施用殺菌劑可以在一定程度上控制條銹病的發(fā)生,但這種方法既造成了環(huán)境污染、又增加了成本。而種植抗病品種一直是一種經(jīng)濟(jì)環(huán)保的方法。一般小種專化型的抗病基因具有很強(qiáng)的;剐,能快速而準(zhǔn)確的識(shí)別細(xì)菌侵染并引發(fā)細(xì)胞死亡,也即通過(guò)細(xì)胞過(guò)敏性壞死來(lái)抑制病菌生長(zhǎng)繁殖,這符合典型的基因?qū)驅(qū)W說(shuō)。然而由于大面積小種;共』虻氖褂,導(dǎo)致病菌的變異被定向選擇而使基因失去抗病性。成株期抗病一般是由多個(gè)基因控制的,這種基因多樣性盡管在面對(duì)某個(gè)小種時(shí)單個(gè)基因起的作用小,但是對(duì)于某種病菌的多個(gè)小種這類基因會(huì)表現(xiàn)出持久抗性。多個(gè)基因主導(dǎo)的成株期抗性中每個(gè)基因所起到的作用大小也不一樣,其中作用最大的基因稱之為主效抗病基因。小麥赤霉病抗擴(kuò)展主效基因Fhb1存在于蘇麥三號(hào)、翻山小麥、望水白等中國(guó)小麥品種中。然而,它在我國(guó)小麥后備品種中的存在與否還不明確。小麥抗赤霉病基因Fhb1分子檢測(cè)體系有助于我們了解該抗病基因在我國(guó)小麥品種(系)中的存在情況。對(duì)小麥品種的應(yīng)用和推廣有重要的參考價(jià)值。小麥品種Yaco"S"自2008...
【文章來(lái)源】:西北農(nóng)林科技大學(xué)陜西省211工程院校985工程院校教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:55 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
F2和F3群體成株期的反應(yīng)型和最大嚴(yán)重度分布
第二章小麥品種Yaco"S"成株期抗條銹病主效QTL定位19表2-3群體抗條銹性表型分析Table2-3AnalysisofresistanceinpopulationTraitNameSampleSizeMeanVarianceStdErrorMinimumMaximumW-testP值14YLIT1844.93.51.91.58.50.8928014YLMDS18432.6915.730.311000.7582015TSIT1766.13.11.8290.9247015TSMDS17643.9508.322.53950.9543015YLIT1805.23.41.91.58.50.9129015YLMDS18038.8530.423.051000.890602.3.3差異SNP的染色體分布對(duì)抗、感池進(jìn)行90KSNP芯片掃描之后發(fā)現(xiàn):在抗感池之間共有649個(gè)SNP有多態(tài)性。根據(jù)90KSNP的染色體參考位置,其中239個(gè)位于2B染色體上,約占總差異SNP的37%,其余染色體上最多的只有67個(gè)(圖2-2,a)。然而由于所開(kāi)發(fā)出的SNP芯片在各個(gè)染色體上的SNP分布及其不均勻,尤其是D染色體組上的SNP明顯低于A和B染色體組,所以又對(duì)親本和抗感池進(jìn)行小麥660KSNP芯片的掃描。依據(jù)660KSNP的染色體參考位置,分別統(tǒng)計(jì)抗感池間在各染色體上多態(tài)性的SNP數(shù),親本之間相對(duì)應(yīng)染色體上的多態(tài)性SNP數(shù)。計(jì)算抗感池間的多態(tài)性SNP數(shù)與親本間的多態(tài)性SNP之間的比值,從而可以一定程度上減弱因染色體上SNP數(shù)分布的差異造成的影響,結(jié)果表明2B染色體上與抗條銹性狀相關(guān)的SNP數(shù)也是遠(yuǎn)遠(yuǎn)多于其余染色體的(圖2-2,b)。2B染色體上很可能存在抗條銹基因。圖2-2抗感池和親本在90K和660KSNP芯片之間多態(tài)SNP的染色體分布Figure2-2(a)ThedifferenceofSNPsbetweenbulksdistributedon21chromosomesusing90Kchip.(b)TheproportionofonechromosomeSNPbetweenbulksandparentsusing660Kchip.Blackandwhitecolumnsindicatethedifferentconsensusgroupmap,respectively.
都出現(xiàn),對(duì)于IT和MDS這兩種抗性指標(biāo)都在同一位點(diǎn)。在楊凌種植的F2,能解釋IT表型變異的35.9%,LOD值為16.7,解釋MDS表型變異的43.9%,LOD值為23.5;在天水種植的F3,能解釋IT表型變異的17.3%,LOD值為7.3,解釋MDS表型變異的19.7%,LOD值為8.2;在楊凌種植的F3,能解釋IT表型變異的36.5%,LOD值為17.0,解釋MDS表型變異的51.9%,LOD值為27.6(表2-3)。該抗條銹病主效基因Qyryac.nwafu-2BS的LOD的峰值位于兩KASP標(biāo)記BS00022657_51和IACX6411/BobWhite_c22503_605(共分離標(biāo)記)之間,遺傳距離為1.3cM(圖2-3;圖2-4)。圖2-3Yaco"S"成株抗條銹基因在染色體2B上遺傳連鎖圖和基因定位Figure2-3Adult-plantresistance(APR)QTLonchromosomes2BS(Qyryac.nwafu-2BS),identifiedusinginclusivecompositeintervalmappingwiththeMDSandITdata.
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]小麥抗條銹病已知基因?qū)χ袊?guó)當(dāng)前流行小種的有效性分析[J]. 曾慶東,沈川,袁鳳平,王琪琳,吳建輝,薛文波,詹剛明,姚石,陳偉,黃麗麗,韓德俊,康振生. 植物病理學(xué)報(bào). 2015(06)
[2]隴南不同區(qū)域內(nèi)兩個(gè)小麥品種上條銹菌群體的毒性分析[J]. 王付平,詹剛明,魏國(guó)榮,黃麗麗,康振生,韓青梅. 麥類作物學(xué)報(bào). 2014(08)
[3]中國(guó)小麥條銹病綜合治理理論與實(shí)踐[J]. 陳萬(wàn)權(quán),康振生,馬占鴻,徐世昌,金社林,姜玉英. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2013(20)
[4]Genetic Analysis and Molecular Mapping of a Stripe Rust Resistance Gene YrH9014 in Wheat Line H9014-14-4-6-1[J]. MA Dong-fang,HOU Lu,TANG Ming-shuang,WANG Hai-ge,LI Qiang,JING Jin-xue. Journal of Integrative Agriculture. 2013(04)
[5]Mapping of Quantitative Trait Loci for Adult Plant Resistance to Stripe Rust in German Wheat Cultivar Ibis[J]. BAI Bin1,2,3,REN Yan2,XIA Xian-chun2,DU Jiu-yuan3,ZHOU Gang3,WU Ling4,ZHU Hua-zhong4,HE Zhong-hu2,5 and WANG Cheng-she1 1 State Key Laboratory of Crop Stress Biology in Arid Areas/College of Agronomy,Northwest A & F University,Yangling 712100,P.R.China 2 Institute of Crop Sciences,National Wheat Improvement Center/The National Key Facility for Crop Gene Resources and Genetic Improvement,Chinese Academy of Agricultural Sciences,Beijing 100081,P.R.China 3 Wheat Research Institute,Gansu Academy of Agricultural Sciences,Lanzhou 730070,P.R.China 4 Crop Research Institute,Sichuan Academy of Agricultural Sciences,Chengdu 610066,P.R.China 5 CIMMYT China Office/Chinese Academy of Agricultural Sciences,Beijing 100081,P.R.China. Journal of Integrative Agriculture. 2012(04)
[6]2008-2009年甘肅省小麥條銹菌生理小種監(jiān)測(cè)結(jié)果[J]. 賈秋珍,金社林,曹世勤,駱惠生,黃瑾,張勃,金明安. 植物保護(hù). 2011(04)
[7]“西北-華北-長(zhǎng)江中下游”條銹病流行區(qū)系當(dāng)前小麥品種(系)抗條銹病性評(píng)價(jià)[J]. 韓德俊,王琪琳,張立,魏國(guó)榮,曾慶東,趙杰,王曉杰,黃麗麗,康振生. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2010(14)
[8]2002年我國(guó)小麥條銹病發(fā)生回顧[J]. 萬(wàn)安民,趙中華,吳立人. 植物保護(hù). 2003(02)
[9]中國(guó)小麥抗赤霉病育種研究進(jìn)展[J]. 姚金保,陸維忠. 江蘇農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2000(04)
[10]小麥抗稈銹病基因推導(dǎo)的計(jì)算機(jī)程序及應(yīng)用[J]. 朱桂清,曹遠(yuǎn)銀,姚平,王小奇,劉維志,王鐵梁,朱慶順. 沈陽(yáng)農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 1998(03)
碩士論文
[1]含抗條銹病和Sec-1基因的小麥—黑麥小片段易位系的創(chuàng)制及分子細(xì)胞遺傳學(xué)鑒定[D]. 葉健.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2007
本文編號(hào):3619516
【文章來(lái)源】:西北農(nóng)林科技大學(xué)陜西省211工程院校985工程院校教育部直屬院校
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【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
F2和F3群體成株期的反應(yīng)型和最大嚴(yán)重度分布
第二章小麥品種Yaco"S"成株期抗條銹病主效QTL定位19表2-3群體抗條銹性表型分析Table2-3AnalysisofresistanceinpopulationTraitNameSampleSizeMeanVarianceStdErrorMinimumMaximumW-testP值14YLIT1844.93.51.91.58.50.8928014YLMDS18432.6915.730.311000.7582015TSIT1766.13.11.8290.9247015TSMDS17643.9508.322.53950.9543015YLIT1805.23.41.91.58.50.9129015YLMDS18038.8530.423.051000.890602.3.3差異SNP的染色體分布對(duì)抗、感池進(jìn)行90KSNP芯片掃描之后發(fā)現(xiàn):在抗感池之間共有649個(gè)SNP有多態(tài)性。根據(jù)90KSNP的染色體參考位置,其中239個(gè)位于2B染色體上,約占總差異SNP的37%,其余染色體上最多的只有67個(gè)(圖2-2,a)。然而由于所開(kāi)發(fā)出的SNP芯片在各個(gè)染色體上的SNP分布及其不均勻,尤其是D染色體組上的SNP明顯低于A和B染色體組,所以又對(duì)親本和抗感池進(jìn)行小麥660KSNP芯片的掃描。依據(jù)660KSNP的染色體參考位置,分別統(tǒng)計(jì)抗感池間在各染色體上多態(tài)性的SNP數(shù),親本之間相對(duì)應(yīng)染色體上的多態(tài)性SNP數(shù)。計(jì)算抗感池間的多態(tài)性SNP數(shù)與親本間的多態(tài)性SNP之間的比值,從而可以一定程度上減弱因染色體上SNP數(shù)分布的差異造成的影響,結(jié)果表明2B染色體上與抗條銹性狀相關(guān)的SNP數(shù)也是遠(yuǎn)遠(yuǎn)多于其余染色體的(圖2-2,b)。2B染色體上很可能存在抗條銹基因。圖2-2抗感池和親本在90K和660KSNP芯片之間多態(tài)SNP的染色體分布Figure2-2(a)ThedifferenceofSNPsbetweenbulksdistributedon21chromosomesusing90Kchip.(b)TheproportionofonechromosomeSNPbetweenbulksandparentsusing660Kchip.Blackandwhitecolumnsindicatethedifferentconsensusgroupmap,respectively.
都出現(xiàn),對(duì)于IT和MDS這兩種抗性指標(biāo)都在同一位點(diǎn)。在楊凌種植的F2,能解釋IT表型變異的35.9%,LOD值為16.7,解釋MDS表型變異的43.9%,LOD值為23.5;在天水種植的F3,能解釋IT表型變異的17.3%,LOD值為7.3,解釋MDS表型變異的19.7%,LOD值為8.2;在楊凌種植的F3,能解釋IT表型變異的36.5%,LOD值為17.0,解釋MDS表型變異的51.9%,LOD值為27.6(表2-3)。該抗條銹病主效基因Qyryac.nwafu-2BS的LOD的峰值位于兩KASP標(biāo)記BS00022657_51和IACX6411/BobWhite_c22503_605(共分離標(biāo)記)之間,遺傳距離為1.3cM(圖2-3;圖2-4)。圖2-3Yaco"S"成株抗條銹基因在染色體2B上遺傳連鎖圖和基因定位Figure2-3Adult-plantresistance(APR)QTLonchromosomes2BS(Qyryac.nwafu-2BS),identifiedusinginclusivecompositeintervalmappingwiththeMDSandITdata.
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]小麥抗條銹病已知基因?qū)χ袊?guó)當(dāng)前流行小種的有效性分析[J]. 曾慶東,沈川,袁鳳平,王琪琳,吳建輝,薛文波,詹剛明,姚石,陳偉,黃麗麗,韓德俊,康振生. 植物病理學(xué)報(bào). 2015(06)
[2]隴南不同區(qū)域內(nèi)兩個(gè)小麥品種上條銹菌群體的毒性分析[J]. 王付平,詹剛明,魏國(guó)榮,黃麗麗,康振生,韓青梅. 麥類作物學(xué)報(bào). 2014(08)
[3]中國(guó)小麥條銹病綜合治理理論與實(shí)踐[J]. 陳萬(wàn)權(quán),康振生,馬占鴻,徐世昌,金社林,姜玉英. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2013(20)
[4]Genetic Analysis and Molecular Mapping of a Stripe Rust Resistance Gene YrH9014 in Wheat Line H9014-14-4-6-1[J]. MA Dong-fang,HOU Lu,TANG Ming-shuang,WANG Hai-ge,LI Qiang,JING Jin-xue. Journal of Integrative Agriculture. 2013(04)
[5]Mapping of Quantitative Trait Loci for Adult Plant Resistance to Stripe Rust in German Wheat Cultivar Ibis[J]. BAI Bin1,2,3,REN Yan2,XIA Xian-chun2,DU Jiu-yuan3,ZHOU Gang3,WU Ling4,ZHU Hua-zhong4,HE Zhong-hu2,5 and WANG Cheng-she1 1 State Key Laboratory of Crop Stress Biology in Arid Areas/College of Agronomy,Northwest A & F University,Yangling 712100,P.R.China 2 Institute of Crop Sciences,National Wheat Improvement Center/The National Key Facility for Crop Gene Resources and Genetic Improvement,Chinese Academy of Agricultural Sciences,Beijing 100081,P.R.China 3 Wheat Research Institute,Gansu Academy of Agricultural Sciences,Lanzhou 730070,P.R.China 4 Crop Research Institute,Sichuan Academy of Agricultural Sciences,Chengdu 610066,P.R.China 5 CIMMYT China Office/Chinese Academy of Agricultural Sciences,Beijing 100081,P.R.China. Journal of Integrative Agriculture. 2012(04)
[6]2008-2009年甘肅省小麥條銹菌生理小種監(jiān)測(cè)結(jié)果[J]. 賈秋珍,金社林,曹世勤,駱惠生,黃瑾,張勃,金明安. 植物保護(hù). 2011(04)
[7]“西北-華北-長(zhǎng)江中下游”條銹病流行區(qū)系當(dāng)前小麥品種(系)抗條銹病性評(píng)價(jià)[J]. 韓德俊,王琪琳,張立,魏國(guó)榮,曾慶東,趙杰,王曉杰,黃麗麗,康振生. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2010(14)
[8]2002年我國(guó)小麥條銹病發(fā)生回顧[J]. 萬(wàn)安民,趙中華,吳立人. 植物保護(hù). 2003(02)
[9]中國(guó)小麥抗赤霉病育種研究進(jìn)展[J]. 姚金保,陸維忠. 江蘇農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2000(04)
[10]小麥抗稈銹病基因推導(dǎo)的計(jì)算機(jī)程序及應(yīng)用[J]. 朱桂清,曹遠(yuǎn)銀,姚平,王小奇,劉維志,王鐵梁,朱慶順. 沈陽(yáng)農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 1998(03)
碩士論文
[1]含抗條銹病和Sec-1基因的小麥—黑麥小片段易位系的創(chuàng)制及分子細(xì)胞遺傳學(xué)鑒定[D]. 葉健.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2007
本文編號(hào):3619516
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