兩種特色油料植物的油脂代謝和NBS類抗病相關(guān)基因的鑒定與分析
發(fā)布時(shí)間:2022-02-04 21:50
植物種子油是人類營養(yǎng)所需脂肪酸的重要來源,是食品、醫(yī)藥、化工和生物燃油等工業(yè)的優(yōu)質(zhì)原料。大豆、油菜等普通油料作物的種子油主要由棕櫚酸、硬脂酸、油酸、亞油酸和亞麻酸等5種脂肪酸組成。與之不同的是,一些未完全馴化的植物種子能高水平積累具有獨(dú)特營養(yǎng)和工業(yè)應(yīng)用價(jià)值的珍稀脂肪酸。野生植物斑鳩菊(Verrnonia galamensis)種子油中富含斑鳩菊酸(順-12,13-環(huán)氧-順-9-十八碳烯酸,vernolic acid),這種天然環(huán)氧脂肪酸可用于制造高分子聚合物、塑料、尼龍、粘合劑、油漆和生物農(nóng)藥等高值工業(yè)品。亞麻薺(Camelina sativa)種子油富含ω-3脂肪酸,這種對(duì)人類大腦和心血管系統(tǒng)極為有益的健康型脂肪酸可用于功能食品、保健醫(yī)藥品和其它化工品加工中。此外,亞麻薺的抗病、蟲、雜草及逆境能力極強(qiáng)。這兩種特色油料植物已被認(rèn)為是具有廣闊開發(fā)應(yīng)用前景的新型工業(yè)油料作物。深入解析這些珍稀脂肪酸的生物合成和調(diào)控機(jī)制,以及特有農(nóng)藝性狀的遺傳基礎(chǔ),可為這兩種特色油料植物的遺傳改良、栽培馴化、基于種子油脂高附加值產(chǎn)品的研發(fā)和商業(yè)化提供科學(xué)參考。為解析斑鳩菊種子高水平合成積累珍稀斑鳩菊酸的分子機(jī)...
【文章來源】:山西農(nóng)業(yè)大學(xué)山西省
【文章頁數(shù)】:61 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖2-1斑鳩菊4個(gè)樣品的總RNA電泳圖??Fig.2-1?Total?RNA?isolated?from?four?samples?of?V.galamensis??
從圖2-2可以看出,顏色越深,表明該位置的堿基Q值就越大,圖中若上方的顏色越深,??說明斑鳩菊測(cè)序數(shù)據(jù)的質(zhì)量就越好。??Quality?Distribution??40?—??■?:?l?;???.*?丨丨曬_■嚴(yán)■■??30?■?■??〇>??I??圣20??"ro??a??10??0????^???±?^??〇?50?1?00?1?50?200?250??Cycle?Number??圖2-2測(cè)序堿基質(zhì)量分布圖??Fig.2-2?Distribution?of?base?quality?value??轉(zhuǎn)錄組文庫的cDNA是被隨機(jī)打斷的,由于其隨機(jī)性和堿基間的互補(bǔ)性,理論上來??講每個(gè)測(cè)序循環(huán)過程中堿基“G”和“C”、“T”和“A”的含量應(yīng)分別對(duì)等,且整個(gè)測(cè)序過程中??其含量應(yīng)呈水平趨勢(shì)。從T01樣品中堿基含量分布情況來看(圖2-3),雖然在整體上??堿基對(duì)的含量比較對(duì)等,但序列前端的部分堿基分布波動(dòng)較大,或許是因?yàn)檗D(zhuǎn)錄組測(cè)序??過程中所用的合成酶對(duì)Reads前端的堿基存有明顯偏好性而導(dǎo)致|871。??Base?Distribution??so?????.??A??T??40?C??〇??t30?i,?f?丨??i?W"??1?I??10?-??
從圖2-2可以看出,顏色越深,表明該位置的堿基Q值就越大,圖中若上方的顏色越深,??說明斑鳩菊測(cè)序數(shù)據(jù)的質(zhì)量就越好。??Quality?Distribution??40?—??■?:?l?;???.*?丨丨曬_■嚴(yán)■■??30?■?■??〇>??I??圣20??"ro??a??10??0????^???±?^??〇?50?1?00?1?50?200?250??Cycle?Number??圖2-2測(cè)序堿基質(zhì)量分布圖??Fig.2-2?Distribution?of?base?quality?value??轉(zhuǎn)錄組文庫的cDNA是被隨機(jī)打斷的,由于其隨機(jī)性和堿基間的互補(bǔ)性,理論上來??講每個(gè)測(cè)序循環(huán)過程中堿基“G”和“C”、“T”和“A”的含量應(yīng)分別對(duì)等,且整個(gè)測(cè)序過程中??其含量應(yīng)呈水平趨勢(shì)。從T01樣品中堿基含量分布情況來看(圖2-3),雖然在整體上??堿基對(duì)的含量比較對(duì)等,但序列前端的部分堿基分布波動(dòng)較大,或許是因?yàn)檗D(zhuǎn)錄組測(cè)序??過程中所用的合成酶對(duì)Reads前端的堿基存有明顯偏好性而導(dǎo)致|871。??Base?Distribution??so?????.??A??T??40?C??〇??t30?i,?f?丨??i?W"??1?I??10?-??
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]斑鳩菊果實(shí)中總黃酮的提取工藝研究[J]. 孫美利,李蕾,王和宇,張晶,徐暾海,劉銅華. 世界科學(xué)技術(shù)-中醫(yī)藥現(xiàn)代化. 2015(05)
[2]‘紅陽’獼猴桃全基因組NBS-LRR類基因家族的生物信息學(xué)分析[J]. 文歡,劉永立. 果樹學(xué)報(bào). 2015(03)
[3]斑鳩菊屬藥用植物化學(xué)成分研究[J]. 孫美利,李蕾,張舒媛,薛峰,張晶,徐暾海,劉銅華. 長(zhǎng)春中醫(yī)藥大學(xué)學(xué)報(bào). 2014(03)
[4]番茄NBS-LRR抗病基因家族全基因組分析[J]. 劉云飛,萬紅建,韋艷萍,李志邈,葉青靜,王榮青,阮美穎,姚祝平,周國治,楊悅儉. 核農(nóng)學(xué)報(bào). 2014(05)
[5]植物NBS-LRR抗病基因的結(jié)構(gòu)、功能、進(jìn)化起源及其應(yīng)用[J]. 劉云飛,萬紅建,李志邈,葉青靜,王榮青,阮美穎,姚祝平,周國治,韋艷萍,楊悅儉. 分子植物育種. 2014(02)
[6]基于油桐種子3個(gè)不同發(fā)育時(shí)期轉(zhuǎn)錄組的油脂合成代謝途徑分析[J]. 陳昊,蔣桂雄,龍洪旭,譚曉風(fēng). 遺傳. 2013(12)
[7]甘藍(lán)型油菜BnDGAT1基因表達(dá)的特異性分析[J]. 馬燕斌,吳霞,王霞,杜春芳,孫璇,王新勝,范建春,李燕娥. 西北植物學(xué)報(bào). 2013(10)
[8]小桐子磷脂二酰甘油;D(zhuǎn)移酶(JcPDAT1)cDNA的克隆與功能鑒定[J]. 徐榮華,邱麗俊,陽天泉,王如玲,田波,劉愛忠. 中國油料作物學(xué)報(bào). 2013(02)
[9]植物油脂合成代謝及調(diào)控的研究進(jìn)展[J]. 周丹,趙江哲,柏楊,張群,井文,章文華. 南京農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2012(05)
[10]高通量測(cè)序技術(shù)及其應(yīng)用[J]. 王興春,楊致榮,王敏,李瑋,李生才. 中國生物工程雜志. 2012(01)
博士論文
[1]大豆與煙草棕櫚油酸代謝工程[D]. 薛金愛.山西農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[2]超積累東南景天轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析與ZIP家族基因功能研究[D]. 高峻.浙江大學(xué) 2013
[3]植物環(huán)丙烯脂肪酸合成的研究[D]. 焦曉明.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2013
碩士論文
[1]油桐種子油體發(fā)育規(guī)律和FADX、PDAT1基因克隆表達(dá)[D]. 李虹俠.中國科學(xué)院研究生院(武漢植物園) 2015
[2]核桃胚脂肪積累期轉(zhuǎn)錄組分析[D]. 張楠.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[3]紫蘇種子油脂代謝及限速酶DGAT1基因的表達(dá)分析[D]. 張玲慧.山西農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[4]毒根斑鳩菊與疏花衛(wèi)矛化學(xué)成分的研究[D]. 于瑞同.青島科技大學(xué) 2013
[5]基于轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的茯苓酸生物合成途徑研究[D]. 陳杰.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[6]EPA合成相關(guān)酶基因?qū)γ藁ǖ倪z傳轉(zhuǎn)化[D]. 桂麗娟.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[7]蓖麻FAH12、FAD2與FAE1基因干擾載體的構(gòu)建與高油酸蓖麻的遺傳轉(zhuǎn)化[D]. 邢超.湖南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[8]油桐FAD2與DGAT2基因的功能分析[D]. 崔琴琴.中國林業(yè)科學(xué)研究院 2013
[9]人參根、莖、葉轉(zhuǎn)錄組測(cè)序及差異表達(dá)基因分析[D]. 林艷玲.長(zhǎng)春中醫(yī)藥大學(xué) 2013
[10]石油沖擊與石油戰(zhàn)略的國際比較[D]. 楊坤.西南財(cái)經(jīng)大學(xué) 2012
本文編號(hào):3614003
【文章來源】:山西農(nóng)業(yè)大學(xué)山西省
【文章頁數(shù)】:61 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖2-1斑鳩菊4個(gè)樣品的總RNA電泳圖??Fig.2-1?Total?RNA?isolated?from?four?samples?of?V.galamensis??
從圖2-2可以看出,顏色越深,表明該位置的堿基Q值就越大,圖中若上方的顏色越深,??說明斑鳩菊測(cè)序數(shù)據(jù)的質(zhì)量就越好。??Quality?Distribution??40?—??■?:?l?;???.*?丨丨曬_■嚴(yán)■■??30?■?■??〇>??I??圣20??"ro??a??10??0????^???±?^??〇?50?1?00?1?50?200?250??Cycle?Number??圖2-2測(cè)序堿基質(zhì)量分布圖??Fig.2-2?Distribution?of?base?quality?value??轉(zhuǎn)錄組文庫的cDNA是被隨機(jī)打斷的,由于其隨機(jī)性和堿基間的互補(bǔ)性,理論上來??講每個(gè)測(cè)序循環(huán)過程中堿基“G”和“C”、“T”和“A”的含量應(yīng)分別對(duì)等,且整個(gè)測(cè)序過程中??其含量應(yīng)呈水平趨勢(shì)。從T01樣品中堿基含量分布情況來看(圖2-3),雖然在整體上??堿基對(duì)的含量比較對(duì)等,但序列前端的部分堿基分布波動(dòng)較大,或許是因?yàn)檗D(zhuǎn)錄組測(cè)序??過程中所用的合成酶對(duì)Reads前端的堿基存有明顯偏好性而導(dǎo)致|871。??Base?Distribution??so?????.??A??T??40?C??〇??t30?i,?f?丨??i?W"??1?I??10?-??
從圖2-2可以看出,顏色越深,表明該位置的堿基Q值就越大,圖中若上方的顏色越深,??說明斑鳩菊測(cè)序數(shù)據(jù)的質(zhì)量就越好。??Quality?Distribution??40?—??■?:?l?;???.*?丨丨曬_■嚴(yán)■■??30?■?■??〇>??I??圣20??"ro??a??10??0????^???±?^??〇?50?1?00?1?50?200?250??Cycle?Number??圖2-2測(cè)序堿基質(zhì)量分布圖??Fig.2-2?Distribution?of?base?quality?value??轉(zhuǎn)錄組文庫的cDNA是被隨機(jī)打斷的,由于其隨機(jī)性和堿基間的互補(bǔ)性,理論上來??講每個(gè)測(cè)序循環(huán)過程中堿基“G”和“C”、“T”和“A”的含量應(yīng)分別對(duì)等,且整個(gè)測(cè)序過程中??其含量應(yīng)呈水平趨勢(shì)。從T01樣品中堿基含量分布情況來看(圖2-3),雖然在整體上??堿基對(duì)的含量比較對(duì)等,但序列前端的部分堿基分布波動(dòng)較大,或許是因?yàn)檗D(zhuǎn)錄組測(cè)序??過程中所用的合成酶對(duì)Reads前端的堿基存有明顯偏好性而導(dǎo)致|871。??Base?Distribution??so?????.??A??T??40?C??〇??t30?i,?f?丨??i?W"??1?I??10?-??
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]斑鳩菊果實(shí)中總黃酮的提取工藝研究[J]. 孫美利,李蕾,王和宇,張晶,徐暾海,劉銅華. 世界科學(xué)技術(shù)-中醫(yī)藥現(xiàn)代化. 2015(05)
[2]‘紅陽’獼猴桃全基因組NBS-LRR類基因家族的生物信息學(xué)分析[J]. 文歡,劉永立. 果樹學(xué)報(bào). 2015(03)
[3]斑鳩菊屬藥用植物化學(xué)成分研究[J]. 孫美利,李蕾,張舒媛,薛峰,張晶,徐暾海,劉銅華. 長(zhǎng)春中醫(yī)藥大學(xué)學(xué)報(bào). 2014(03)
[4]番茄NBS-LRR抗病基因家族全基因組分析[J]. 劉云飛,萬紅建,韋艷萍,李志邈,葉青靜,王榮青,阮美穎,姚祝平,周國治,楊悅儉. 核農(nóng)學(xué)報(bào). 2014(05)
[5]植物NBS-LRR抗病基因的結(jié)構(gòu)、功能、進(jìn)化起源及其應(yīng)用[J]. 劉云飛,萬紅建,李志邈,葉青靜,王榮青,阮美穎,姚祝平,周國治,韋艷萍,楊悅儉. 分子植物育種. 2014(02)
[6]基于油桐種子3個(gè)不同發(fā)育時(shí)期轉(zhuǎn)錄組的油脂合成代謝途徑分析[J]. 陳昊,蔣桂雄,龍洪旭,譚曉風(fēng). 遺傳. 2013(12)
[7]甘藍(lán)型油菜BnDGAT1基因表達(dá)的特異性分析[J]. 馬燕斌,吳霞,王霞,杜春芳,孫璇,王新勝,范建春,李燕娥. 西北植物學(xué)報(bào). 2013(10)
[8]小桐子磷脂二酰甘油;D(zhuǎn)移酶(JcPDAT1)cDNA的克隆與功能鑒定[J]. 徐榮華,邱麗俊,陽天泉,王如玲,田波,劉愛忠. 中國油料作物學(xué)報(bào). 2013(02)
[9]植物油脂合成代謝及調(diào)控的研究進(jìn)展[J]. 周丹,趙江哲,柏楊,張群,井文,章文華. 南京農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2012(05)
[10]高通量測(cè)序技術(shù)及其應(yīng)用[J]. 王興春,楊致榮,王敏,李瑋,李生才. 中國生物工程雜志. 2012(01)
博士論文
[1]大豆與煙草棕櫚油酸代謝工程[D]. 薛金愛.山西農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[2]超積累東南景天轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析與ZIP家族基因功能研究[D]. 高峻.浙江大學(xué) 2013
[3]植物環(huán)丙烯脂肪酸合成的研究[D]. 焦曉明.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2013
碩士論文
[1]油桐種子油體發(fā)育規(guī)律和FADX、PDAT1基因克隆表達(dá)[D]. 李虹俠.中國科學(xué)院研究生院(武漢植物園) 2015
[2]核桃胚脂肪積累期轉(zhuǎn)錄組分析[D]. 張楠.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[3]紫蘇種子油脂代謝及限速酶DGAT1基因的表達(dá)分析[D]. 張玲慧.山西農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[4]毒根斑鳩菊與疏花衛(wèi)矛化學(xué)成分的研究[D]. 于瑞同.青島科技大學(xué) 2013
[5]基于轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的茯苓酸生物合成途徑研究[D]. 陳杰.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[6]EPA合成相關(guān)酶基因?qū)γ藁ǖ倪z傳轉(zhuǎn)化[D]. 桂麗娟.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[7]蓖麻FAH12、FAD2與FAE1基因干擾載體的構(gòu)建與高油酸蓖麻的遺傳轉(zhuǎn)化[D]. 邢超.湖南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[8]油桐FAD2與DGAT2基因的功能分析[D]. 崔琴琴.中國林業(yè)科學(xué)研究院 2013
[9]人參根、莖、葉轉(zhuǎn)錄組測(cè)序及差異表達(dá)基因分析[D]. 林艷玲.長(zhǎng)春中醫(yī)藥大學(xué) 2013
[10]石油沖擊與石油戰(zhàn)略的國際比較[D]. 楊坤.西南財(cái)經(jīng)大學(xué) 2012
本文編號(hào):3614003
本文鏈接:http://sikaile.net/nykjlw/dzwbhlw/3614003.html
最近更新
教材專著