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Bin標(biāo)記和QTL對(duì)玉米大斑病全基因組選擇預(yù)測(cè)精度的影響研究

發(fā)布時(shí)間:2022-01-10 22:23
  玉米(Zea mays L.)是禾本科玉米屬一年生植物,有很強(qiáng)的適應(yīng)能力,引入中國(guó)時(shí)被作為“救荒植物”。玉米現(xiàn)在已經(jīng)成為最重要的經(jīng)濟(jì)作物之一,在國(guó)際糧食市場(chǎng)上有很重要的地位。在我國(guó)玉米是重要的糧飼作物,種植面積廣并且產(chǎn)量高,在生活生產(chǎn)等方面有著不可或缺的作用。近年來(lái)玉米大斑。∟orthern Corn Leaf Blight,NCLB)頻繁爆發(fā),對(duì)玉米的產(chǎn)量影響嚴(yán)重。玉米大斑病是由斑剛毛座腔菌(Setosphaeria turcica)引起的玉米生長(zhǎng)過(guò)程中主要病害之一,該性狀由少數(shù)主效基因和大量微效基因控制。全基因組選擇(Genomic Selection,GS)育種技術(shù)可以有效的對(duì)于微效多基因控制的復(fù)雜數(shù)量性狀進(jìn)行預(yù)測(cè),作為有效的分子育種手段現(xiàn)已逐漸應(yīng)用于植物育種中。全基因組選擇的預(yù)測(cè)精度是田間測(cè)定的表型值和全基因組預(yù)測(cè)獲得的基因組估計(jì)育種值的相關(guān)系數(shù),為全基因組選擇效率的衡量標(biāo)準(zhǔn)。本研究利用三個(gè)雙單倍體群體,對(duì)玉米大斑病進(jìn)行全基因組選擇的精度研究,使用軟件Icimapping對(duì)冗余標(biāo)記進(jìn)行刪除,獲得Bin標(biāo)記。通過(guò)Bin標(biāo)記構(gòu)建遺傳圖譜進(jìn)行玉米大斑病QTL定位,檢測(cè)Bin標(biāo)記的顯... 

【文章來(lái)源】:沈陽(yáng)農(nóng)業(yè)大學(xué)遼寧省

【文章頁(yè)數(shù)】:60 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

Bin標(biāo)記和QTL對(duì)玉米大斑病全基因組選擇預(yù)測(cè)精度的影響研究


三個(gè)雙單倍體群體玉米大斑病的表型分布

分布圖,玉米大斑病,加性效應(yīng),分布圖


沈陽(yáng)農(nóng)業(yè)大學(xué)碩士學(xué)位論文3.4 DH 群體玉米大斑病性狀的 QTL 定位使用軟件 QTL Icimapping 4.1 的 Bip 功能,根據(jù) Bin 標(biāo)記構(gòu)建的遺傳圖譜進(jìn)行 QTL定位。在 Pop1 群體中,檢測(cè)到 2 個(gè)與性狀相關(guān)的 QTL,分別位于 5 號(hào)和 8 號(hào)染色體上,且分別命名為 qD1nclb5-1 和 qD1nclb8-1。qD1nclb5-1 的表型貢獻(xiàn)率為 14.97%,位置在230cM 處,左標(biāo)記是 S5_70062311,右標(biāo)記是 S5_70870437,LOD 值為 6.32,加性效應(yīng)為 0.12, 說(shuō)明對(duì) 玉米大斑病抗性起 作用的等位基因是 LA POSTA SEQ. C7F64-2-6-2-2-B-B-B 提供的,qD1nclb8-1 的表型貢獻(xiàn)率為 12.88%,位置在 207cM 處,左標(biāo)記是 S8_123055339,右標(biāo)記是 S8_124465177,LOD 值為 5.62,加性效應(yīng)為-0.11,說(shuō)明對(duì)玉米大斑病抗性起作用的等位基因是 CML-459 提供的。Pop1 群體的玉米大斑病抗性 QTL 定位結(jié)果如圖 3.2。

分布圖,玉米大斑病,加性效應(yīng),表型遺傳


第三章 結(jié)果與分析作用的等位基因是 DTPYC9-F46-1-2-1-2-B-B-B 提供的,qD2nclb2-1 解釋了表型遺傳變異的 8.31%,位置在 662cM 處,左標(biāo)記是 S2_9353182,右標(biāo)記是 S2_9011310,LOD 值為 3.10,加性效應(yīng)為-0.083,說(shuō)明對(duì)玉米大斑病抗性起作用的等位基因是 CML-459 提供的,qD2nclb5-1 解釋了表型遺傳變異的 16.56%,位置在 230cM 處,左標(biāo)記是S5_211682662,右標(biāo)記是 S5_212613330,LOD 值為 5.98,加性效應(yīng)為-0.12,說(shuō)明對(duì)玉米大斑病抗性起作用的等位基因是 CML-459 提供的,qD2nclb9-1 解釋了表型遺傳變異的 10.94%,位置在 93cM 處,左標(biāo)記是 S9_147737386,右標(biāo)記是 S9_147470512,LOD值為 4.27,加性效應(yīng)為-0.095,說(shuō)明對(duì)玉米大斑病抗性起作用的等位基因是 CML-459 提供的。Pop2 群體的玉米大斑病抗性 QTL 定位結(jié)果如圖 3.3。

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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博士論文
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[2]玉米高密度重組圖譜構(gòu)建及耐旱相關(guān)性狀的遺傳解析[D]. 李春輝.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2015
[3]玉米自交系大斑病抗性及出苗率的回交改良研究[D]. 喬善寶.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009

碩士論文
[1]基于三個(gè)RIL群體的玉米穗柄長(zhǎng)QTL定位分析[D]. 賀文姝.沈陽(yáng)農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[2]大白菜高密度Bin-marker圖譜構(gòu)建及開(kāi)花時(shí)間的QTL定位[D]. 劉靜.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2016
[3]玉米(Zea MaysL.)穗行數(shù)主效QTL定位及近等基因系構(gòu)建[D]. ADA MENIE NELLY SANDRINE.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[4]不同品種玉米植株在成熟過(guò)程中營(yíng)養(yǎng)價(jià)值變化規(guī)律及青貯利用價(jià)值的研究[D]. 王洋.中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué) 2005
[5]玉米DH群體的遺傳分析及QTL定位初探[D]. 宋煒.河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2005



本文編號(hào):3581527

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