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紫貂微衛(wèi)星位點(diǎn)的開(kāi)發(fā)及群體遺傳分析

發(fā)布時(shí)間:2022-01-01 10:48
  紫貂是典型的寒帶、亞寒帶哺乳動(dòng)物,曾是一種分布廣泛的物種。在我國(guó),共有4種紫貂亞種,主要分布于東北和西北地區(qū)人口稀少、氣候寒冷的針葉林地帶。由于紫貂皮毛異常珍貴,所以該物種經(jīng)常受到盜獵者的捕殺。再加上人類活動(dòng)導(dǎo)致的棲息地破碎化,使得紫貂生存面臨嚴(yán)峻的挑戰(zhàn)。本研究通過(guò)傳統(tǒng)方法(磁珠富集),開(kāi)發(fā)出紫貂基因組多態(tài)性微衛(wèi)星位點(diǎn)22個(gè)。同時(shí)利用紫貂基因組高通量測(cè)序數(shù)據(jù),開(kāi)發(fā)了16個(gè)四堿基多態(tài)性微衛(wèi)星位點(diǎn)。并且利用這16個(gè)四堿基位點(diǎn),對(duì)來(lái)自中國(guó)東北地區(qū)的三個(gè)紫貂種群(牡丹江-尚志種群、漠河種群、根河種群)49個(gè)個(gè)體進(jìn)行了遺傳多樣性和種群結(jié)構(gòu)分析。主要研究結(jié)果如下:1.通過(guò)構(gòu)建基因組文庫(kù),共挑取了2252個(gè)克隆,經(jīng)過(guò)陽(yáng)性克隆篩選(獲343個(gè))、測(cè)序(測(cè)序200個(gè)陽(yáng)性克隆)及引物檢測(cè)(共設(shè)計(jì)100對(duì)),獲得26對(duì)可以擴(kuò)增出清晰、單一,且與預(yù)期大小相符條帶的引物。利用22個(gè)紫貂樣品對(duì)以上引物進(jìn)行毛細(xì)管電泳檢測(cè),最終獲得22個(gè)多態(tài)性微衛(wèi)星位點(diǎn)。其等位基因數(shù)范圍是311個(gè),除了位點(diǎn)Mz24和Mz26的多態(tài)信息含量較低(0.25<PIC<0.5),其余所有位點(diǎn)的多態(tài)性都呈較高... 

【文章來(lái)源】:曲阜師范大學(xué)山東省

【文章頁(yè)數(shù)】:67 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

紫貂微衛(wèi)星位點(diǎn)的開(kāi)發(fā)及群體遺傳分析


紫貂的形態(tài)特征

紫貂,小興安嶺,阿爾泰山,大興安嶺


.2 紫貂在中國(guó)的地理分布區(qū)(① 阿爾泰山,② 大興安嶺,③ 小興安嶺,④ 長(zhǎng)白Fig. 1.2 The geographical distribution of sable in China群現(xiàn)狀的亞種劃分問(wèn)題較為復(fù)雜,目前多為大家所接受的是 Wozencraft 等[7]將亞種。在中國(guó),紫貂被劃分為四個(gè)亞種,分別是阿爾泰亞種(M. zibellina亞種(M. zibellina princeps),小興安嶺亞種(M. zibellina linkouensis)M. zibellina hamgyenensis)[5]。皮綿軟靈活, 底絨豐厚細(xì)密,毛色墨潤(rùn)有光澤,皮板輕薄且堅(jiān)韌,在中國(guó)。正是由于其質(zhì)優(yōu)物美,價(jià)值高昂,使得該物種面臨嚴(yán)峻的生存挑戰(zhàn)。盲目地追求高經(jīng)濟(jì)價(jià)值,過(guò)度地捕捉紫貂個(gè)體,導(dǎo)致其種群數(shù)量急劇下類活動(dòng)范圍的增大,人類干擾不斷擴(kuò)大,紫貂的棲息地范圍不斷縮小,其種群數(shù)量減少的重要原因。1989年,紫貂被中國(guó)政府列為國(guó)家一級(jí)保護(hù)泰地區(qū)紫貂種群數(shù)量尚不清晰,東北地區(qū)紫貂估計(jì)有6000只左右[9]。19

電泳圖,紫貂,總DNA,電泳圖


第二章 傳統(tǒng)方法(磁珠富集)開(kāi)發(fā)紫貂微衛(wèi)星標(biāo)記13圖2.1 部分紫貂樣品總DNA電泳圖(Marker 5000)Fig. 2.1 DNA electrophoretogram of partial sable samples2.2.2 酶切挑取6份優(yōu)質(zhì)DNA樣品,各取15μl混合。取85ul混合DNA與其他液體充分混合,置于37℃酶切1.5-2h。酶切體系為:混合DNA 85μl10×H buffer 10μlSau3AI 5μl總計(jì) 100μl酶切結(jié)束后65℃變性15min,以使限制酶失活;取5μl酶切液,使用1%瓊脂糖凝膠電泳檢驗(yàn)酶切結(jié)果。電泳圖見(jiàn)圖2.2。圖2.2 紫貂基因組經(jīng)酶切后凝膠電泳圖(兩側(cè)與中間均為Marker 2000)Fig. 2

【參考文獻(xiàn)】:
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[6]揚(yáng)子鱷微衛(wèi)星位點(diǎn)的篩選及其多態(tài)性分析[D]. 荊偉.浙江大學(xué) 2008
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本文編號(hào):3562217

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