四川省獼猴桃潰瘍病菌遺傳多樣性及變異分析
發(fā)布時間:2021-12-29 07:36
獼猴桃潰瘍病是一種嚴(yán)重危害獼猴桃生長的細(xì)菌性病害,其主要的致病菌為丁香假單胞桿菌獼猴桃致病變種(Pseudomonas syringae pv.actinidiae,Psa)。由于病原菌自身的變異、相互間的基因交流、外界環(huán)境的影響以及寄主的相互作用等因素導(dǎo)致病原菌的遺傳信息發(fā)生變化,使病害的流行及控制變得更為復(fù)雜。四川省作為獼猴桃種植大省,面臨著潰瘍病更為流行及蔓延的形勢。本研究針對獼猴桃主要產(chǎn)區(qū)的獼猴桃潰瘍病菌進(jìn)行分離鑒定,進(jìn)而研究其遺傳多樣性,主要結(jié)論如下。(1)本研究首次從廣元、成都、邛崍、雅安等獼猴桃主要產(chǎn)區(qū)采集疑似獼猴桃潰瘍病樣品142份,通過分離培養(yǎng)鑒定獲得77個Psa菌株,和3個假單胞屬菌株(Pseudomonas),不同病原菌形態(tài)具有細(xì)微差異。(2)通過BOX-PCR和EIRC-PCR對80個菌株進(jìn)行了遺傳多樣性分析。在相似系數(shù)分別為0.631和0.661時,兩種方法均將80個菌株聚為6類,聚類結(jié)果與菌株地理分布呈一定相關(guān)性。(3)通過對11個VNTR位點的多態(tài)性分析表明,1個為輕微變異位點,5個為中度變異位點,5個為高度變異位點,在相似系數(shù)為0.778時,該方法將80...
【文章來源】: 四川農(nóng)業(yè)大學(xué)四川省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:86 頁
【文章目錄】:
摘要
abstract
1 前言
1.1 文獻(xiàn)綜述
1.1.1 獼猴桃潰瘍病研究現(xiàn)狀
1.1.2 獼猴桃潰瘍病病原菌的研究概況
1.1.3 獼猴桃潰瘍病群體遺傳多樣研究
1.1.4 遺傳變異研究方法
1.1.5 獼猴桃潰瘍病病原菌致病性測定研究
1.2 研究目的與意義
2 材料與方法
2.1 菌株采集
2.2 技術(shù)路線
2.3 試驗試劑與儀器
2.3.1 試驗試劑
2.3.2 試驗儀器
2.4 試驗方法
2.4.1 病原細(xì)菌的分離培養(yǎng)
2.4.2 單菌落PCR
2.4.3 病原菌的純化及DNA提取
2.4.4 BOX-PCR和EIRC-PCR擴增
2.4.5 MLVA的分子分型研究
2.4.6 遺傳變異分析
2.4.7 代表性菌株的致病性測定
3 結(jié)果與分析
3.1 樣品采集
3.2 獼猴桃潰瘍病菌的分離培養(yǎng)及分子鑒定
3.2.1 獼猴桃潰瘍病菌的分離培養(yǎng)
3.2.2 分子鑒定
3.3 基于BOX-PCR和EIRC-PCR的遺傳多樣性分析
3.3.1 BOX-PCR擴增結(jié)果
3.3.2 EIRC-PCR擴增結(jié)果
3.4 MLVA分子分型研究
3.4.1 VNTR多態(tài)性位點篩選
3.4.2 毛細(xì)管電泳結(jié)果
3.4.3 VNTR多態(tài)性位點的多態(tài)性信息含量分析及PIC值計算
3.4.4 UPGMA聚類分析
3.5 基于持家基因序列的遺傳變異分析
3.5.1 持家基因序列獲得
3.5.2 系統(tǒng)發(fā)育樹的構(gòu)建
3.5.3 同義突變與非同義突變(不同持家基因選擇壓力分析)
3.5.4 中性檢驗
3.5.5 基因流和遺傳分化的統(tǒng)計分析
3.6 致病性測定
4 結(jié)論與討論
參考文獻(xiàn)
致謝
附錄
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]酶聯(lián)免疫吸附反應(yīng)對獼猴桃潰瘍病菌效應(yīng)子Hopz5多克隆抗體的特性分析 [J]. 胡月,陳航,楊巽喆,李慶,楊輝. 生物技術(shù)通報. 2018(01)
[2]獼猴桃潰瘍病菌實時熒光定量PCR檢測方法的建立和應(yīng)用 [J]. 謝錦添,俞超,譚志文,吳月燕,馬立孟. 中國南方果樹. 2017(06)
[3]獼猴桃潰瘍病病菌新篩選方法與菌種鑒定 [J]. 田璨熙,宋金秋,向曉寒,崔麗紅. 西南農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2017(11)
[4]四川省獼猴桃潰瘍病發(fā)生現(xiàn)狀及綠色防控技術(shù)體系的建立 [J]. 馬利,尹勇,封傳紅,任小平,龔國淑,陳華保,莊啟國,涂美艷,王華. 中國植保導(dǎo)刊. 2017(11)
[5]淺談周至縣獼猴桃潰瘍病綜合防治技術(shù) [J]. 袁香麗. 農(nóng)民致富之友. 2016(20)
[6]秦嶺北麓獼猴桃主產(chǎn)區(qū)潰瘍病病原菌的分離與鑒定 [J]. 井趙斌,楊宏勃,楊玉旺,沈靜,周素敏,顏瑞莉,徐明. 西北林學(xué)院學(xué)報. 2016(05)
[7]四種殺菌劑防治獼猴桃潰瘍病的效果及田間應(yīng)用技術(shù) [J]. 秦虎強,趙志博,高小寧,王強,杜培龍,黃麗麗. 植物保護(hù)學(xué)報. 2016(02)
[8]獼猴桃凍害預(yù)防及災(zāi)后挽救建議 [J]. 涂美艷,江國良,陳棟,孫淑霞,李靖. 四川農(nóng)業(yè)科技. 2016(03)
[9]陜西省獼猴桃細(xì)菌性潰瘍病菌(Pseudomonas syringae pv.actinidiae)Rep-PCR的遺傳多樣性分析 [J]. 高小寧,鄭州,趙志博,秦虎強,黃麗麗. 果樹學(xué)報. 2016(03)
[10]獼猴桃潰瘍病菌漆酶基因的克隆與功能分析 [J]. 劉普,胡家勇,何蓉,朱立武. 生物學(xué)雜志. 2015(01)
博士論文
[1]煙草脈帶花葉病毒、蕪菁花葉病毒和馬鈴薯Y病毒的遺傳結(jié)構(gòu)分析[D]. 張成玲.山東農(nóng)業(yè)大學(xué). 2010
碩士論文
[1]獼猴桃潰瘍病抗性材料評價及其親緣關(guān)系的ISSR聚類分析[D]. 劉娟.四川農(nóng)業(yè)大學(xué). 2015
[2]應(yīng)用GFPuv標(biāo)記技術(shù)研究獼猴桃潰瘍病菌在組織中的侵染擴展動態(tài)[D]. 黃其玲.西北農(nóng)林科技大學(xué). 2013
[3]炭疽芽孢桿菌MLVA分子分型研究[D]. 吳松羽.南昌大學(xué). 2011
本文編號:3555686
【文章來源】: 四川農(nóng)業(yè)大學(xué)四川省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:86 頁
【文章目錄】:
摘要
abstract
1 前言
1.1 文獻(xiàn)綜述
1.1.1 獼猴桃潰瘍病研究現(xiàn)狀
1.1.2 獼猴桃潰瘍病病原菌的研究概況
1.1.3 獼猴桃潰瘍病群體遺傳多樣研究
1.1.4 遺傳變異研究方法
1.1.5 獼猴桃潰瘍病病原菌致病性測定研究
1.2 研究目的與意義
2 材料與方法
2.1 菌株采集
2.2 技術(shù)路線
2.3 試驗試劑與儀器
2.3.1 試驗試劑
2.3.2 試驗儀器
2.4 試驗方法
2.4.1 病原細(xì)菌的分離培養(yǎng)
2.4.2 單菌落PCR
2.4.3 病原菌的純化及DNA提取
2.4.4 BOX-PCR和EIRC-PCR擴增
2.4.5 MLVA的分子分型研究
2.4.6 遺傳變異分析
2.4.7 代表性菌株的致病性測定
3 結(jié)果與分析
3.1 樣品采集
3.2 獼猴桃潰瘍病菌的分離培養(yǎng)及分子鑒定
3.2.1 獼猴桃潰瘍病菌的分離培養(yǎng)
3.2.2 分子鑒定
3.3 基于BOX-PCR和EIRC-PCR的遺傳多樣性分析
3.3.1 BOX-PCR擴增結(jié)果
3.3.2 EIRC-PCR擴增結(jié)果
3.4 MLVA分子分型研究
3.4.1 VNTR多態(tài)性位點篩選
3.4.2 毛細(xì)管電泳結(jié)果
3.4.3 VNTR多態(tài)性位點的多態(tài)性信息含量分析及PIC值計算
3.4.4 UPGMA聚類分析
3.5 基于持家基因序列的遺傳變異分析
3.5.1 持家基因序列獲得
3.5.2 系統(tǒng)發(fā)育樹的構(gòu)建
3.5.3 同義突變與非同義突變(不同持家基因選擇壓力分析)
3.5.4 中性檢驗
3.5.5 基因流和遺傳分化的統(tǒng)計分析
3.6 致病性測定
4 結(jié)論與討論
參考文獻(xiàn)
致謝
附錄
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]酶聯(lián)免疫吸附反應(yīng)對獼猴桃潰瘍病菌效應(yīng)子Hopz5多克隆抗體的特性分析 [J]. 胡月,陳航,楊巽喆,李慶,楊輝. 生物技術(shù)通報. 2018(01)
[2]獼猴桃潰瘍病菌實時熒光定量PCR檢測方法的建立和應(yīng)用 [J]. 謝錦添,俞超,譚志文,吳月燕,馬立孟. 中國南方果樹. 2017(06)
[3]獼猴桃潰瘍病病菌新篩選方法與菌種鑒定 [J]. 田璨熙,宋金秋,向曉寒,崔麗紅. 西南農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2017(11)
[4]四川省獼猴桃潰瘍病發(fā)生現(xiàn)狀及綠色防控技術(shù)體系的建立 [J]. 馬利,尹勇,封傳紅,任小平,龔國淑,陳華保,莊啟國,涂美艷,王華. 中國植保導(dǎo)刊. 2017(11)
[5]淺談周至縣獼猴桃潰瘍病綜合防治技術(shù) [J]. 袁香麗. 農(nóng)民致富之友. 2016(20)
[6]秦嶺北麓獼猴桃主產(chǎn)區(qū)潰瘍病病原菌的分離與鑒定 [J]. 井趙斌,楊宏勃,楊玉旺,沈靜,周素敏,顏瑞莉,徐明. 西北林學(xué)院學(xué)報. 2016(05)
[7]四種殺菌劑防治獼猴桃潰瘍病的效果及田間應(yīng)用技術(shù) [J]. 秦虎強,趙志博,高小寧,王強,杜培龍,黃麗麗. 植物保護(hù)學(xué)報. 2016(02)
[8]獼猴桃凍害預(yù)防及災(zāi)后挽救建議 [J]. 涂美艷,江國良,陳棟,孫淑霞,李靖. 四川農(nóng)業(yè)科技. 2016(03)
[9]陜西省獼猴桃細(xì)菌性潰瘍病菌(Pseudomonas syringae pv.actinidiae)Rep-PCR的遺傳多樣性分析 [J]. 高小寧,鄭州,趙志博,秦虎強,黃麗麗. 果樹學(xué)報. 2016(03)
[10]獼猴桃潰瘍病菌漆酶基因的克隆與功能分析 [J]. 劉普,胡家勇,何蓉,朱立武. 生物學(xué)雜志. 2015(01)
博士論文
[1]煙草脈帶花葉病毒、蕪菁花葉病毒和馬鈴薯Y病毒的遺傳結(jié)構(gòu)分析[D]. 張成玲.山東農(nóng)業(yè)大學(xué). 2010
碩士論文
[1]獼猴桃潰瘍病抗性材料評價及其親緣關(guān)系的ISSR聚類分析[D]. 劉娟.四川農(nóng)業(yè)大學(xué). 2015
[2]應(yīng)用GFPuv標(biāo)記技術(shù)研究獼猴桃潰瘍病菌在組織中的侵染擴展動態(tài)[D]. 黃其玲.西北農(nóng)林科技大學(xué). 2013
[3]炭疽芽孢桿菌MLVA分子分型研究[D]. 吳松羽.南昌大學(xué). 2011
本文編號:3555686
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