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玉米螟的分子連接性指數(shù)模糊聚類分析

發(fā)布時間:2021-12-23 10:48
  玉米螟危害多種作物,對我國玉米產(chǎn)量與質(zhì)量的影響尤為明顯,我國作為農(nóng)業(yè)大國,防治玉米螟至關重要。為進一步研究不同種類玉米螟生長發(fā)育歷程及習性,以達到更好地防治效果,利用遺傳多樣性分析和分子連接性指數(shù)模糊聚類方法對不同地理位置和不同寄主的玉米螟進行生物進化研究,分析玉米螟基于不同地理位置和不同寄主2種情況是否各自存在生物型分類。結果表明,在不同地理位置上玉米螟存在生物型分類,而在不同寄主上玉米螟不存在生物型分類。這一研究成果為玉米螟的分類研究和玉米螟防治提供了一種有效的方法。

【文章來源】: 江蘇農(nóng)業(yè)科學. 2020,48(06)

【文章頁數(shù)】:7 頁

【文章目錄】:
1 材料與方法
    1.1 樣本獲取
    1.2 數(shù)據(jù)獲取
        1.2.1 試驗器材與試劑
        1.2.2 基因提取
        1.2.2 引物設計與PCR擴增
    1.3 玉米螟遺傳研究
        1.3.1 采自不同地理位置的玉米螟種群遺傳研究
        1.3.2 采自不同寄主的玉米螟種群遺傳研究
    1.4 堿基飽和度檢驗
    1.5 聚類分析
        1.5.1 分子連接性指數(shù)
        1.5.2 提取DNA序列的特征向量并標準化
            (1)隨機在16種堿基對中選取堿基CG,計算每條序列堿基對CG的中心位置。
            (2)定義各序列每個堿基對CG的中心位置為變量L,則
            (3)構建變量L的支化度序列L1—L2—L3—…—Ln,計算δn
            (4)計算各序列的分子連接性指數(shù)(xp),構建特征向量。
        1.5.3 模糊相似矩陣的建立
        1.5.4 模糊等價矩陣的構建
2 結論與討論


【參考文獻】:
期刊論文
[1]玉米螟綜合防治技術 [J]. 劉明華,黃巧云.  上海農(nóng)業(yè)科技. 2018(06)
[2]中國稈野螟屬昆蟲線粒體COⅠ基因遺傳多樣性及其分子系統(tǒng)學研究(鱗翅目:草螟科) [J]. 楊瑞生,王振營,何康來,白樹雄,姜義仁.  南京農(nóng)業(yè)大學學報. 2011(05)

博士論文
[1]氟苯蟲酰胺和NK130102對亞洲玉米螟的分子作用機理研究[D]. 崔麗.中國農(nóng)業(yè)科學院. 2014

碩士論文
[1]分子連接性指數(shù)計算軟件制作及應用[D]. 單俐經(jīng).華東理工大學. 2011



本文編號:3548335

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