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葡萄蠶豆萎蔫病毒熒光定量PCR檢測(cè)及對(duì)寄主的影響研究

發(fā)布時(shí)間:2021-12-23 02:54
  我國(guó)葡萄面積達(dá)1 080余萬畝,居世界第二位。葡萄病毒病發(fā)生普遍,嚴(yán)重影響葡萄產(chǎn)量和品質(zhì)。葡萄蠶豆萎蔫病毒(grapevine fabavirus,GFabV)是2016年新報(bào)道的葡萄病毒,普遍發(fā)生于各個(gè)葡萄產(chǎn)區(qū)。本研究針對(duì)GFabV分子檢測(cè)方法欠缺、危害性不清等問題,擴(kuò)增獲得了我國(guó)首個(gè)GFabV全基因組序列,在此基礎(chǔ)上,建立了高靈敏的熒光定量PCR檢測(cè)技術(shù),并初步明確了GFab V對(duì)葡萄的危害性,主要結(jié)果如下:采用小RNA測(cè)序方法從‘香妃’葡萄中鑒定出GFabV,并通過PCR和RACE方法擴(kuò)增獲得GFabV XF分離株基因組RNA1和RNA2的完整核苷酸序列。XF分離株基因組RNA1和RNA2的大小分別為5 822和3 134個(gè)核苷酸(nt),與其他GFabV分離物同源性進(jìn)行比對(duì),結(jié)果表明,RNA1的核苷酸(nt)和氨基酸(aa)同源性分別為81.7?82.8%和92.0?94.2%,RNA2分別為76.4?82.8%和89.2?96.1%。對(duì)國(guó)內(nèi)外GFabV分離物序列進(jìn)行系統(tǒng)進(jìn)化分析,顯示XF形成一個(gè)獨(dú)立的進(jìn)化分支。此外,分析了來源于GFabV小干擾RNA(vsiRNA)的長(zhǎng)度及在... 

【文章來源】:中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京市

【文章頁(yè)數(shù)】:59 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

葡萄蠶豆萎蔫病毒熒光定量PCR檢測(cè)及對(duì)寄主的影響研究


侵染葡萄的DNA病毒Fig1-1DNAvirusesinfectinggrapes

侵染,葡萄,病毒,緒論


中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院碩士學(xué)位論文第一章緒論2圖1-2侵染葡萄的單鏈RNA病毒Fig1-2Single-strandedRNAvirusesinfectinggrapes

葡萄,病毒,侵染


中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院碩士學(xué)位論文第一章緒論3圖1-3侵染葡萄的雙鏈RNA病毒Fig1-3Double-strandedRNAvirusesinfectinggrapes1.2葡萄蠶豆萎蔫病毒Fabavirus屬的病毒種類多、寄主范圍廣,能侵染萵苣、菠菜、辣椒、豌豆等一些蔬菜和經(jīng)濟(jì)作物,造成嚴(yán)重危害(FERRERetal.,2008)。洪健等(2014)報(bào)道稱Fabavirus屬已有5個(gè)確定種,分別被命名為蠶豆萎蔫病毒1號(hào)(BBWV-1)、蠶豆萎蔫病毒2號(hào)(BBWV-2)、葫蘆輕型花葉病毒(CuMMV)、龍膽屬花葉病毒(GeMV)和野芝麻輕型花葉病毒(LMMV)。最近,在表現(xiàn)病毒病癥狀的櫻桃和桃樹上也報(bào)道了兩種新的Fabavirus病毒,分別被命名為李屬病毒F(PrunusvirusF,PrVF)和桃裂果伴隨病毒(Peachcrackingfruitassociatedvirus,PCFaV)(VILLAMORetal.,2017;HEetal.,2017)。葡萄蠶豆萎蔫病毒(Grapevinefabavirus,GFabV)是AlRWAHNIHetal.(2016)從兩個(gè)日本鮮食葡萄‘黑色甜菜’(Vitisviniferacv.BlackBeet)和‘長(zhǎng)野紫峰’(Vitisviniferacv.NaganoPurple)上鑒定出的一種新的葡萄病毒,被歸類為Secoviridae家族中Fabavirus的新成員。迄今為止,該病毒已在北美、印度、中國(guó)、韓國(guó)和日本發(fā)現(xiàn)(FANetal.,2017;JOetal.,2017;CHIAKIetal.,2020)。先前的研究表明,感染GFabV的‘貝達(dá)’葡萄和‘陽光玫瑰’葡萄表現(xiàn)葉片褪綠畸形的癥狀(FANetal.,2019)。日本學(xué)者CHIAKIetal(2019)報(bào)道了“陽光玫瑰”母本樹攜帶葡萄蠶豆萎蔫病毒、葡萄雙生病毒A、啤酒花矮化類病毒和葡萄黃斑類病毒1等病毒和類病毒。由于生產(chǎn)中陽光玫瑰繁殖材料均來源于母本樹,因此導(dǎo)致了田間栽植的陽光玫瑰普遍帶毒。最近,對(duì)中國(guó)不同葡萄品種和地區(qū)的GFabV分離株的檢測(cè)和遺傳多樣性的研究表明,中國(guó)22個(gè)省和地區(qū)的11個(gè)省存在GFabV,感染率達(dá)19.1%,不同來

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Prevalence and genetic diversity of grapevine fabavirus isolates from different grapevine cultivars and regions in China[J]. FAN Xu-dong,ZHANG meng-yan,ZHANG Zun-ping,REN Fang,HU Guo-jun,DONG Ya-feng.  Journal of Integrative Agriculture. 2020(03)
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[4]葡萄病毒A實(shí)時(shí)熒光定量RT-PCR檢測(cè)技術(shù)的建立及應(yīng)用[J]. 任芳,董雅鳳,張尊平,范旭東,胡國(guó)君.  園藝學(xué)報(bào). 2018(11)
[5]葡萄扇葉病毒實(shí)時(shí)熒光定量RT-PCR檢測(cè)方法的建立及應(yīng)用[J]. 周俊,范旭東,董雅鳳,張尊平,胡國(guó)君,任芳,李正男.  園藝學(xué)報(bào). 2016(03)
[6]一種高效的蘋果褪綠葉斑病毒TaqMan探針實(shí)時(shí)熒光定量RT-PCR檢測(cè)方法[J]. 秦子禹,孫建設(shè),王娜,邵建柱.  植物保護(hù)學(xué)報(bào). 2015(04)
[7]ICTV第九次報(bào)告以來的植物病毒分類系統(tǒng)[J]. 洪健,周雪平.  植物病理學(xué)報(bào). 2014(06)
[8]葡萄病毒E分子檢測(cè)及基因序列分析[J]. 范旭東,董雅鳳,張尊平,任芳,胡國(guó)君,朱紅娟.  植物病理學(xué)報(bào). 2014(05)
[9]葡萄病毒分子檢測(cè)技術(shù)研究進(jìn)展[J]. 范旭東,董雅鳳,張尊平,任芳,胡國(guó)君,朱紅娟.  園藝學(xué)報(bào). 2014(05)
[10]我國(guó)部分地區(qū)沙地葡萄莖痘相關(guān)病毒分離物外殼蛋白序列變異分析[J]. 朱紅娟,胡國(guó)君,范旭東,張尊平,任芳,董雅鳳.  植物保護(hù)學(xué)報(bào). 2014(02)

博士論文
[1]引起葡萄卷葉及環(huán)斑癥狀的病毒種類鑒定及其分子特性研究[D]. 范旭東.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016

碩士論文
[1]沙地葡萄莖痘相關(guān)病毒PCR檢測(cè)及外殼蛋白基因變異分析[D]. 朱紅娟.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2014
[2]我國(guó)葡萄卷葉病病原分子檢測(cè)技術(shù)研究[D]. 裴光前.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2010
[3]葡萄病毒種類調(diào)查及葡萄斑點(diǎn)病毒檢測(cè)[D]. 劉永清.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2003



本文編號(hào):3547633

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