普通小麥“中國春”作為小麥研究的模式被全世界廣泛運用于小麥遺傳學(xué)和基因組學(xué)研究。國際小麥基因組測序聯(lián)盟采用對“中國春”的單條染色體和染色體臂進(jìn)行物理作圖和測序的策略,完成了小麥基因組草圖拼接。“中國春”基因組序列草圖的公布,為我們在基因組水平上全面比較不同小麥材料間的遺傳變異提供了基礎(chǔ)。本研究對六倍體小麥3B染色體重測序,并與“中國春”基因組序列比對,揭示了序列變異和基因型特異序列及其分布特征,主要研究結(jié)果總結(jié)如下:（1）通過染色體流式分選和高通量測序,獲得了普通小麥-斯卑爾脫小麥衍生系“CRNIL1A”3B染色體的原始測序數(shù)據(jù)（36.6 Gb）。過濾后,87.9%的高質(zhì)量“CRNIL1A”3B序列成功匹配到“中國春”3B染色體分子全序列;（2）同時,發(fā)現(xiàn)大約8.3 Mb的“CRNIL1A”序列不存在于“中國春”基因組中。通過PCR擴(kuò)增對部分特異序列進(jìn)行了驗證,通過遺傳圖譜連鎖分析,證實所驗證的11條特異序列都是屬于“CRNIL1A”3B染色體序列�！癈RNIL1A”特異序列的功能主要涉及新陳代謝、細(xì)胞進(jìn)程、分子錨定以及細(xì)胞壁組分;（3）利用來自全球亞洲、歐洲、美洲和非洲四個區(qū)域的22... 

【文章來源】：四川農(nóng)業(yè)大學(xué)四川省 211工程院校

【文章頁數(shù)】：99 頁

【學(xué)位級別】：博士

【部分圖文】：

圖２－１?“ＣＲＮＩＬ１Ａ”?３Ｂ染色體測序數(shù)據(jù)與“中國春”測序數(shù)據(jù)比較后的分類

擴(kuò)增出不同大小的ＰＣＲ片段，并進(jìn)一步對兩個分離群體的所有后代進(jìn)行試驗驗??證。遺傳連鎖分析表明這些引物所對應(yīng)的“ＣＲＮＩＬ１Ａ”特異ｃｏｎｔｉｇｓ序列全部定??位于３Ｂ染色體上（

６５０?ｂｐ??罨??圖２－２?“ＣＲＮＩＬ１Ａ”特異ｃｏｎｔｉｇｓ序列在“ＣＲＮＩＬ１Ａ”和“中國春”全基因組??ＤＮＡ中的ＰＣＲ驗證。??Ｆｉｇｕｒｅ?２－２．?Ｖａｌｉｄａｔｉｏｎ?ｏｆ?ＣＲＮＩＬ１?Ａ－ｓｐｅｃｉｆｉｃ?ｃｏｎｔｉｇｓ?ａｇａｉｎｓｔ?ＣＲＮＩＬ１Ａ?（１Ａ）?ａｎｄ??Ｃｈｉｎｅｓｅ?Ｓｐｒｉｎｇ?（ＣＳ）?ｂｙ?ＰＣＲ?ａｍｐｌｉｆｉｃａｔｉｏｎ．?Ｍ?＝?ｍａｒｋｅｒ；?１?＝?ｃｏｎｔｉｇ」０９８４；?２?＝?ｃｏｎｔｉｇ＿５５；??３?＝?ｃｏｎｔｉｇ—１４３０４；?４?＝?ｃｏｎｔｉｇ＿１８５９４；?５?＝?ｃｏｎｔｉｇ＿２９６８；?６?＝?ｃｏｎｔｉｇ＿４０４８－ｌ；?ａｎｄ?７?＝?ｃｏｎｔｉｇ＿７５５２．??使用這３４對在“ＣＲＮＩＬｌ?Ａ”中得到目標(biāo)大�。校茫移蔚囊铮瑢蓚�分離??群體的親本材料進(jìn)行ＰＣＲ擴(kuò)增。其中，有１１對引物能在兩個群體的親本材料中??擴(kuò)增出不同大小的ＰＣＲ片段，并進(jìn)一步對兩個分離群體的所有后代進(jìn)行試驗驗??證。遺傳連鎖分析表明這些引物所對應(yīng)的“ＣＲＮＩＬ１Ａ”特異ｃｏｎｔｉｇｓ序列全部定??位于３Ｂ染色體上（圖２－３

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]Genome-wide patterns of large-size presence/absence variants in sorghum[J]. Li-Min Zhang,Hong Luo,Zhi-Quan Liu,Yi Zhao,Jing-Chu Luo,Dong-Yun Hao,Hai-Chun Jing.  Journal of Integrative Plant Biology. 2014(01)
[2]Synthetic hexaploid wheat and its utilization for wheat genetic improvement in China[J]. Wuyun Yang a, Dengcai Liu b, e, Jun Li a, Lianquan Zhang b, Huiting Wei a, Xiaorong Hu a, Youliang Zheng b, Zhouhu He c, d, Yuchun Zou a a Crop Research Institute, Sichuan Academy of Agricultural Science, Chengdu 610066, China. b Triticeae Research Institute, Sichuan Agricultural University, Dujiangyan city, 611830, China c Institute of Crop Science/National Wheat Improvement Centre, Chinese Academy of Agricultural Sciences (CAAS), Beijing 100081, China d CIMMYT China Office, c/o CAAS, Beijing 100081, China e Northwest Plateau Institute of Biology, Chinese Academy of Sciences, Qinghai 810001, China.  遺傳學(xué)報. 2009(09)
[3]粗山羊草抗條銹病新基因YrY206遺傳分析和微衛(wèi)星標(biāo)記[J]. 張海泉,郎杰,馬淑琴,張寶石.  生物工程學(xué)報. 2008(08)
[4]細(xì)菌比較基因組學(xué)和進(jìn)化基因組學(xué)[J]. 周冬生,楊瑞馥.  微生物學(xué)雜志. 2003(05)
[5]創(chuàng)新誘發(fā)材料SY95-71選育和利用價值研究[J]. 舒煥麟,楊足君,李光蓉.  四川農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 1999(03)



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