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小麥3B染色體重測序及節(jié)節(jié)麥抗條銹病分析

發(fā)布時間:2021-12-18 18:31
  普通小麥“中國春”作為小麥研究的模式被全世界廣泛運用于小麥遺傳學和基因組學研究。國際小麥基因組測序聯盟采用對“中國春”的單條染色體和染色體臂進行物理作圖和測序的策略,完成了小麥基因組草圖拼接!爸袊骸被蚪M序列草圖的公布,為我們在基因組水平上全面比較不同小麥材料間的遺傳變異提供了基礎。本研究對六倍體小麥3B染色體重測序,并與“中國春”基因組序列比對,揭示了序列變異和基因型特異序列及其分布特征,主要研究結果總結如下:(1)通過染色體流式分選和高通量測序,獲得了普通小麥-斯卑爾脫小麥衍生系“CRNIL1A”3B染色體的原始測序數據(36.6 Gb)。過濾后,87.9%的高質量“CRNIL1A”3B序列成功匹配到“中國春”3B染色體分子全序列;(2)同時,發(fā)現大約8.3 Mb的“CRNIL1A”序列不存在于“中國春”基因組中。通過PCR擴增對部分特異序列進行了驗證,通過遺傳圖譜連鎖分析,證實所驗證的11條特異序列都是屬于“CRNIL1A”3B染色體序列!癈RNIL1A”特異序列的功能主要涉及新陳代謝、細胞進程、分子錨定以及細胞壁組分;(3)利用來自全球亞洲、歐洲、美洲和非洲四個區(qū)域的22... 

【文章來源】:四川農業(yè)大學四川省 211工程院校

【文章頁數】:99 頁

【學位級別】:博士

【部分圖文】:

小麥3B染色體重測序及節(jié)節(jié)麥抗條銹病分析


圖2-1?“CRNIL1A”?3B染色體測序數據與“中國春”測序數據比較后的分類

序列,“中國春”,全基因組,序列


擴增出不同大小的PCR片段,并進一步對兩個分離群體的所有后代進行試驗驗??證。遺傳連鎖分析表明這些引物所對應的“CRNIL1A”特異contigs序列全部定??位于3B染色體上(

序列,重組自交系群體,序列,類型


650?bp??罨??圖2-2?“CRNIL1A”特異contigs序列在“CRNIL1A”和“中國春”全基因組??DNA中的PCR驗證。??Figure?2-2.?Validation?of?CRNIL1?A-specific?contigs?against?CRNIL1A?(1A)?and??Chinese?Spring?(CS)?by?PCR?amplification.?M?=?marker;?1?=?contig」0984;?2?=?contig_55;??3?=?contig—14304;?4?=?contig_18594;?5?=?contig_2968;?6?=?contig_4048-l;?and?7?=?contig_7552.??使用這34對在“CRNILl?A”中得到目標大。校茫移蔚囊,對兩個分離??群體的親本材料進行PCR擴增。其中,有11對引物能在兩個群體的親本材料中??擴增出不同大小的PCR片段,并進一步對兩個分離群體的所有后代進行試驗驗??證。遺傳連鎖分析表明這些引物所對應的“CRNIL1A”特異contigs序列全部定??位于3B染色體上(圖2-3

【參考文獻】:
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本文編號:3542957

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