水稻抗白葉枯病基因Xa23啟動(dòng)子變異及功能標(biāo)記
發(fā)布時(shí)間:2021-11-24 18:31
Xa23是廣譜強(qiáng)效的水稻抗白葉枯病顯性基因,其與等位感病基因xa23功能差異在于啟動(dòng)子上的被水稻白葉枯病菌無毒效應(yīng)因子avrXa23能識(shí)別激活28 bp核心序列(EBEavr Xa23),開發(fā)其功能標(biāo)記能夠加快水稻育種進(jìn)程。本研究檢測(cè)43份國外野生稻、7份代表性常規(guī)稻的Xa23啟動(dòng)子,利用生物信息軟件Vector NTI對(duì)啟動(dòng)子上游200 bp序列進(jìn)行分析。結(jié)果表明,只有9份普通野生稻,2份常規(guī)稻能擴(kuò)增出啟動(dòng)子上游約200 bp序列,檢出率只有22.0%,說明Xa23不廣泛存在于水稻中;進(jìn)一步的序列分析顯示,EBEavr Xa23序列存在豐富的變異,其等位序列至少存在7種單倍型,但EBEavr Xa23只存在水稻CBB23中。最后,依據(jù)EBEavr Xa23序列開發(fā)了Xa23顯性功能標(biāo)記,經(jīng)驗(yàn)證該標(biāo)記能明確區(qū)分水稻是否攜Xa23基因。本研究將有助于進(jìn)一步研究Xa23進(jìn)化機(jī)制及分子標(biāo)記輔助選擇育種。
【文章來源】:分子植物育種. 2020,18(21)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:7 頁
【部分圖文】:
Xa23啟動(dòng)子擴(kuò)增
Xa23啟動(dòng)子序列比較分析
本研究材料采用攜抗病Xa23基因的水稻CB-B23 (Xa23)及攜感病等位xa23的水稻JG30 (xa23)外,用于Xa23啟動(dòng)子測(cè)序擴(kuò)增的還有31個(gè)國外普通野生稻、12個(gè)國內(nèi)普通野生稻(以采集地命名)及7個(gè)常見水稻品種‘IR24’、‘日本晴’、‘9311’、‘臺(tái)北309 (TP309)’及攜單一抗白葉枯病基因材料IRBB21(Xa21)、IRBB27 (Xa27)、IRBB5 (xa5)(表1)。3.2 Xa23啟動(dòng)子PCR擴(kuò)增
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]近30年來我國水稻主要品種更新?lián)Q代歷程淺析[J]. 曾波. 作物雜志. 2018(03)
[2]水稻抗白葉枯病基因Xa23的EST標(biāo)記及其在分子育種上的利用[J]. 王春連,戚華雄,潘海軍,李進(jìn)波,樊穎倫,章琦,趙開軍. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2005(10)
[3]水稻抗白葉枯病基因Xa23的PCR分子標(biāo)記定位及輔助選擇[J]. 潘海軍,王春連,趙開軍,章琦,樊穎倫,周少川,朱立煌. 作物學(xué)報(bào). 2003(04)
[4]攜有抗白葉枯病新基因Xa23水稻近等基因系的構(gòu)建及應(yīng)用(英文)[J]. 章琦,王春連,趙開軍,楊文才,喬楓,周永力,江祺祥,劉古春. 中國水稻科學(xué). 2002(03)
[5]普通野生稻的抗水稻白葉枯病(Xanthomonas oryzaepv.oryzae)新基因Xa-23(t)的鑒定和分子標(biāo)記定位[J]. 章琦,趙炳宇,趙開軍,王春連,楊文才,林世成,闕更生,周永力,李道遠(yuǎn),陳成斌,朱立煌. 作物學(xué)報(bào). 2000(05)
[6]水稻白葉枯病抗性基因的研究與分子育種[J]. 翟文學(xué),朱立煌. 生物工程進(jìn)展. 1999(06)
博士論文
[1]水稻抗白葉枯病基因Xa23的進(jìn)化機(jī)制及XA23與HR功能相關(guān)的重要氨基酸的分析[D]. 崔華.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2018
本文編號(hào):3516534
【文章來源】:分子植物育種. 2020,18(21)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:7 頁
【部分圖文】:
Xa23啟動(dòng)子擴(kuò)增
Xa23啟動(dòng)子序列比較分析
本研究材料采用攜抗病Xa23基因的水稻CB-B23 (Xa23)及攜感病等位xa23的水稻JG30 (xa23)外,用于Xa23啟動(dòng)子測(cè)序擴(kuò)增的還有31個(gè)國外普通野生稻、12個(gè)國內(nèi)普通野生稻(以采集地命名)及7個(gè)常見水稻品種‘IR24’、‘日本晴’、‘9311’、‘臺(tái)北309 (TP309)’及攜單一抗白葉枯病基因材料IRBB21(Xa21)、IRBB27 (Xa27)、IRBB5 (xa5)(表1)。3.2 Xa23啟動(dòng)子PCR擴(kuò)增
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]近30年來我國水稻主要品種更新?lián)Q代歷程淺析[J]. 曾波. 作物雜志. 2018(03)
[2]水稻抗白葉枯病基因Xa23的EST標(biāo)記及其在分子育種上的利用[J]. 王春連,戚華雄,潘海軍,李進(jìn)波,樊穎倫,章琦,趙開軍. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2005(10)
[3]水稻抗白葉枯病基因Xa23的PCR分子標(biāo)記定位及輔助選擇[J]. 潘海軍,王春連,趙開軍,章琦,樊穎倫,周少川,朱立煌. 作物學(xué)報(bào). 2003(04)
[4]攜有抗白葉枯病新基因Xa23水稻近等基因系的構(gòu)建及應(yīng)用(英文)[J]. 章琦,王春連,趙開軍,楊文才,喬楓,周永力,江祺祥,劉古春. 中國水稻科學(xué). 2002(03)
[5]普通野生稻的抗水稻白葉枯病(Xanthomonas oryzaepv.oryzae)新基因Xa-23(t)的鑒定和分子標(biāo)記定位[J]. 章琦,趙炳宇,趙開軍,王春連,楊文才,林世成,闕更生,周永力,李道遠(yuǎn),陳成斌,朱立煌. 作物學(xué)報(bào). 2000(05)
[6]水稻白葉枯病抗性基因的研究與分子育種[J]. 翟文學(xué),朱立煌. 生物工程進(jìn)展. 1999(06)
博士論文
[1]水稻抗白葉枯病基因Xa23的進(jìn)化機(jī)制及XA23與HR功能相關(guān)的重要氨基酸的分析[D]. 崔華.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2018
本文編號(hào):3516534
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