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水稻抗白葉枯病基因Xa23啟動子變異及功能標記

發(fā)布時間:2021-11-24 18:31
  Xa23是廣譜強效的水稻抗白葉枯病顯性基因,其與等位感病基因xa23功能差異在于啟動子上的被水稻白葉枯病菌無毒效應因子avrXa23能識別激活28 bp核心序列(EBEavr Xa23),開發(fā)其功能標記能夠加快水稻育種進程。本研究檢測43份國外野生稻、7份代表性常規(guī)稻的Xa23啟動子,利用生物信息軟件Vector NTI對啟動子上游200 bp序列進行分析。結果表明,只有9份普通野生稻,2份常規(guī)稻能擴增出啟動子上游約200 bp序列,檢出率只有22.0%,說明Xa23不廣泛存在于水稻中;進一步的序列分析顯示,EBEavr Xa23序列存在豐富的變異,其等位序列至少存在7種單倍型,但EBEavr Xa23只存在水稻CBB23中。最后,依據EBEavr Xa23序列開發(fā)了Xa23顯性功能標記,經驗證該標記能明確區(qū)分水稻是否攜Xa23基因。本研究將有助于進一步研究Xa23進化機制及分子標記輔助選擇育種。 

【文章來源】:分子植物育種. 2020,18(21)北大核心CSCD

【文章頁數】:7 頁

【部分圖文】:

水稻抗白葉枯病基因Xa23啟動子變異及功能標記


Xa23啟動子擴增

啟動子序列,啟動子序列,啟動子,功能


Xa23啟動子序列比較分析

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本研究材料采用攜抗病Xa23基因的水稻CB-B23 (Xa23)及攜感病等位xa23的水稻JG30 (xa23)外,用于Xa23啟動子測序擴增的還有31個國外普通野生稻、12個國內普通野生稻(以采集地命名)及7個常見水稻品種‘IR24’、‘日本晴’、‘9311’、‘臺北309 (TP309)’及攜單一抗白葉枯病基因材料IRBB21(Xa21)、IRBB27 (Xa27)、IRBB5 (xa5)(表1)。3.2 Xa23啟動子PCR擴增

【參考文獻】:
期刊論文
[1]近30年來我國水稻主要品種更新換代歷程淺析[J]. 曾波.  作物雜志. 2018(03)
[2]水稻抗白葉枯病基因Xa23的EST標記及其在分子育種上的利用[J]. 王春連,戚華雄,潘海軍,李進波,樊穎倫,章琦,趙開軍.  中國農業(yè)科學. 2005(10)
[3]水稻抗白葉枯病基因Xa23的PCR分子標記定位及輔助選擇[J]. 潘海軍,王春連,趙開軍,章琦,樊穎倫,周少川,朱立煌.  作物學報. 2003(04)
[4]攜有抗白葉枯病新基因Xa23水稻近等基因系的構建及應用(英文)[J]. 章琦,王春連,趙開軍,楊文才,喬楓,周永力,江祺祥,劉古春.  中國水稻科學. 2002(03)
[5]普通野生稻的抗水稻白葉枯。╔anthomonas oryzaepv.oryzae)新基因Xa-23(t)的鑒定和分子標記定位[J]. 章琦,趙炳宇,趙開軍,王春連,楊文才,林世成,闕更生,周永力,李道遠,陳成斌,朱立煌.  作物學報. 2000(05)
[6]水稻白葉枯病抗性基因的研究與分子育種[J]. 翟文學,朱立煌.  生物工程進展. 1999(06)

博士論文
[1]水稻抗白葉枯病基因Xa23的進化機制及XA23與HR功能相關的重要氨基酸的分析[D]. 崔華.中國農業(yè)科學院 2018



本文編號:3516534

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