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我國(guó)棕櫚薊馬遺傳多樣性與種群遺傳結(jié)構(gòu)研究

發(fā)布時(shí)間:2021-11-18 13:51
  棕櫚薊馬Thrips palmi Karny,屬纓翅目Thysanoptera薊馬科Thripidae,危害多種作物,是農(nóng)林業(yè)生產(chǎn)上的重要害蟲。棕櫚薊馬起源于南亞地區(qū),目前已擴(kuò)散到日本、韓國(guó)、澳大利亞等國(guó)家以及我國(guó)大部分地區(qū)。種群遺傳變異可能會(huì)導(dǎo)致棕櫚薊馬對(duì)新環(huán)境的快速適應(yīng)和爆發(fā)危害。明確不同種群的多樣性和遺傳結(jié)構(gòu),對(duì)明確棕櫚薊馬快速傳播擴(kuò)散的機(jī)制、制定防控措施等具有重要的理論和實(shí)踐意義。本研究在開發(fā)棕櫚薊馬微衛(wèi)星標(biāo)記的基礎(chǔ)上,研究我國(guó)不同地理種群和不同寄主上棕櫚薊馬遺傳多樣性和種群遺傳結(jié)構(gòu),探討地理、環(huán)境、寄主植物和化學(xué)防治措施等因素對(duì)該蟲種群遺傳變異的影響。主要研究結(jié)果如下:(1)棕櫚薊馬微衛(wèi)星標(biāo)記開發(fā)利用高通量測(cè)序技術(shù)測(cè)定了 356 MB的棕櫚薊馬基因組草圖,搜索得到104229個(gè)位點(diǎn)適于引物設(shè)計(jì),其中64.02%為二核苷酸重復(fù)序列位點(diǎn)。篩選了 60個(gè)位點(diǎn)在7個(gè)個(gè)體進(jìn)行驗(yàn)證分析,根據(jù)擴(kuò)增效率和多態(tài)性開發(fā)得到了 26個(gè)多態(tài)性微衛(wèi)星標(biāo)記,為棕櫚薊馬遺傳遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)研究提供分子標(biāo)記。(2)不同地理種群棕櫚薊馬遺傳多樣性利用微衛(wèi)星標(biāo)記和線粒體COⅠ基因序列對(duì)我國(guó)14個(gè)地理種群、日... 

【文章來源】:北京林業(yè)大學(xué)北京市 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁(yè)數(shù)】:60 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

我國(guó)棕櫚薊馬遺傳多樣性與種群遺傳結(jié)構(gòu)研究


圖3.1線粒體COI單倍體在15個(gè)種群中的分布(a)和單倍型分析圖(b)??Figure?3.1?Distribution?of?the?mitochondrial?coxl?haplotypes?in?15?population?(a)?and?split???

棕櫚薊馬,微衛(wèi)星位點(diǎn)


(p<0.0l)。然而,在所有種群中,沒有顯示出微衛(wèi)星位點(diǎn)偏離哈迪溫伯格平衡。對(duì)26??個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)進(jìn)行中性檢驗(yàn),結(jié)果顯示,S29,?S40和S57在陽(yáng)性選擇的區(qū)域內(nèi),S25??在平衡選擇的區(qū)域,其他22個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)沒有顯示出選擇壓力,見圖3.2。??Fst/He??0?225??/?^?.A?JS28??〇,,〇?I??…?尸??°125?it?.???????:?????0?100?■???眷?????磷??^?0?075?[I.???????**??0?050?I????0?025『冬??〇〇〇〇?■??0?025???0050?|??0?075???0.100?―一—?-?V?.?V:T.夕、―二、,j? ̄?.?-?:_-'■]??0.00?0.05?0?10?0?15?020?0.25?0.30?0?35?0?40?0?45?0.50?0?55?0?60?0?65?0?70?0.75?0.80?0?85?0?D0??He????barkers?Candidate?balancing?selection?Candidate?neutral?—Candidate?postive?selection?|??圖3.2棕櫚薊馬的26個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)的中性檢驗(yàn)??Figure?3.2?Neutrality?test?result?of?all?the?locus?developed.??23??

棕櫚薊馬,種群,海南三亞


為獨(dú)立的遺傳簇,云南西雙版納(YNXS)和四川攀枝花(SCPZ)分為西南組,六個(gè)??種群分為東部和中部組,五個(gè)種群分為北部組。在東部和中部種群和北部種群發(fā)現(xiàn)了??明顯的混合物,見圖3.4a。??DAPC分析結(jié)果表明,兩個(gè)島嶼種群日本(JANP)和海南三亞(HNSY)以及西??南部的四川攀枝花(SCPZ)種群被分離出來,見圖3.4b,其他大多數(shù)種群是根據(jù)地??理分布而聚集成一個(gè)類群,見圖3.4c。總體而言,15個(gè)棕櫚薊馬的種群分為日本??(JANP),海南三亞(HNSY)和四川攀枝花(SCPZ)分為獨(dú)立的遺傳簇,其余的12??個(gè)種群分為一個(gè)較大的遺傳簇。??棕櫚薊馬種群間成對(duì)的FST值表明,日本(JANP)、海南三亞(HNSY)、四川攀??枝花(SCPZ)和海南三亞(HNSY)四個(gè)種群與其他種群的遺傳分化相對(duì)較高,其中??最高的FST值在日本(JANP)和海南三亞(HNSY);表明南方種群的遺傳分化較大。??山東壽光(SDSG)、北京大興(BJDX)、北京房山(BJFS)和北京朝陽(yáng)(BJCY)的??FST值較小,種群間的遺傳分化相對(duì)較小,其中最小的FST值在山東壽光(SDSG)和??北京大興(BJDX)之間

【參考文獻(xiàn)】:
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本文編號(hào):3503015

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