茶足柄瘤蚜繭蜂可寄生棉蚜、豆蚜、玉米蚜、高粱蚜以及菜豆和木槿上的蚜蟲。昆蟲可以通過進(jìn)入滯育狀態(tài)來度過不良環(huán)境,從而使個(gè)體在不利條件下仍能繼續(xù)存活,還可以保持種群發(fā)育整齊,使交配率得以提高,以確保種群的繁衍。所以此特性在生產(chǎn)中可以得到廣泛應(yīng)用。本研究通過對滯育（Diapause,D）與非滯育（Non-Diapause,ND）的茶足柄瘤蚜繭蜂蛹進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序,目的是篩選出與滯育相關(guān)的差異表達(dá)基因,并分析其對滯育可能起到的作用,來豐富滯育的轉(zhuǎn)錄組學(xué)理論研究;對滯育與非滯育的茶足柄瘤蚜繭蜂蛹蛋白組的研究是通過應(yīng)用iTRAQ技術(shù),篩選出與滯育相關(guān)的蛋白并進(jìn)行功能分析,從蛋白層面揭示滯育的分子機(jī)制;利用LC-MS（liquid chromatograph-mass spectrometer）技術(shù)對滯育組與非滯育組茶足柄瘤蚜繭蜂蛹進(jìn)行代謝組檢測,尋找影響茶足柄瘤蚜繭蜂蛹滯育的生物標(biāo)志物,從代謝角度來分析滯育的分子水平調(diào)控。主要結(jié)果如下:1.差異表達(dá)基因分析結(jié)果ND.VS.D,有19,201個(gè)上調(diào)差異表達(dá)基因,19,141個(gè)下調(diào)差異基因;共25,666個(gè)差異基因被注釋到GO數(shù)據(jù)庫,涉及到的代謝過程有脂... 

【文章來源】：中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京市

【文章頁數(shù)】：106 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

Unigenes長度分布

中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院碩士學(xué)位論文第二章茶足柄瘤蚜繭蜂蛹滯育相關(guān)的轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究112.3.2基因功能注釋基因在Nr，Nt，Pfam，KOG/COG，Swiss-prot，KEGG，GO七個(gè)數(shù)據(jù)庫完成了功能注釋，目的是獲得更全面的功能信息。圖2-2展示了此次獲取的177,142個(gè)unigenes在上述數(shù)據(jù)庫中注釋的成功率。圖2-2基因在各數(shù)據(jù)庫注釋成功概率統(tǒng)計(jì)Fig.2-2Statisticsofsuccessprobabilityofgeneannotationineachdatabase2.3.2.1Nr注釋結(jié)果根據(jù)Nr庫比對注釋的結(jié)果，統(tǒng)計(jì)并繪制出比對上的物種分布圖、比對的e-value分布圖以及序列相似度分布圖。在種間分布上，比對上的物種有Trichomalopsissarcophag（6.0%）、胡蜂Diachasmaalloeum（6.3%）、多胚跳小蜂Copidosomafloridanum（8.0%）、麗蠅蛹集金小蜂Nasoniavitripennis（9.1%）和絡(luò)新婦蛛Nephilaclavipes（16.0%）以及一些未命名的其他種others（圖2-3：A）。在e-value分布中,e值為0~1e-100占比最大，為22.5%，e值為0所占比例最小，為5.2%（圖2-33：B）。在相似性分布中，相似性60~80%所占比例最高，為40.3%，相似性18~40%占比最少，為0.3%（圖2-3：C）。AB

中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院碩士學(xué)位論文第二章茶足柄瘤蚜繭蜂蛹滯育相關(guān)的轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究12C圖2-3UnigenesNr注釋的物種分布、e-value和相似性統(tǒng)計(jì)Fig.2-3Statisticsofspeciesdistribution,E-valueandsimilarityfromtheNrannotationresultsofunigenes2.3.2.2KOG注釋KOG數(shù)據(jù)庫將功能分為26組，將基因與數(shù)據(jù)庫比對，注釋成功的基因按數(shù)據(jù)庫的26個(gè)組分類，一般功能預(yù)測（R:generalfunctionpredictiononly，5460個(gè)）是unigenes注釋數(shù)量最多的組別，其次是蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)換和伴侶蛋白（O:posttranslationalmodification,proteinturnover,chaperones,3,920個(gè)）和信號傳導(dǎo)機(jī)理(T:signaltransductionmechanisms,3,899個(gè))，結(jié)果見圖2-4。圖2-4Unigenes在KOG中的分類統(tǒng)計(jì)Fig.2-4StatisticsoftheunigenesinKOGclassification

【參考文獻(xiàn)】：
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博士論文
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本文編號：3500493