基于全基因序列的中國北方3。▍^(qū))馬鈴薯Y病毒遺傳多樣性分析
發(fā)布時間:2021-11-14 13:16
本研究以馬鈴薯Y病毒(PVY)全基因組為基礎(chǔ),分析吉林、黑龍江和內(nèi)蒙古3省(區(qū))PVY群體遺傳多樣性和群體分化,并評估突變、重組、選擇等遺傳力所起的作用。根據(jù)已報道的PVY全基因序列保守區(qū)設(shè)計4對引物,采用片段重疊法對來自內(nèi)蒙古和吉林的24個PVY分離物全基因序列進行測定,并聯(lián)合NCBI中已登錄的9個黑龍江分離物全基因組序列進行遺傳多樣性參數(shù)評估、群體分化檢驗和分子變異等分析。結(jié)果顯示,我國北方3省(區(qū))PVY群體遺傳多樣性高,其中內(nèi)蒙古和黑龍江PVY群體遺傳多樣性高于吉林群體,并且3個群體之間呈現(xiàn)一定程度的遺傳分化。分子變異分析發(fā)現(xiàn)在PVY基因組中存在1 786個變異位點,表明我國北方3省(區(qū))PVY群體變異程度較高,并且這種高變異度有85.54%來自各個馬鈴薯種植區(qū)內(nèi)PVY個體的遺傳變異。重組分析和系統(tǒng)發(fā)育分析發(fā)現(xiàn),我國北方3省(區(qū))PVY群體中重組株系占比高達90.3%,并具有明顯的株系多樣性,表明PVY重組株系已成為我國北方3。▍^(qū))馬鈴薯種植區(qū)的流行株系。選擇壓力分析顯示,使用FEL和IFEL法分別檢測出501個和315個凈化壓力選擇位點,這表明3。▍^(qū))PVY群體受凈化選擇...
【文章來源】:植物保護. 2020,46(04)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:8 頁
【部分圖文】:
基于全基因組序列構(gòu)建的中國北方3省(區(qū))
【參考文獻】:
期刊論文
[1]基于小RNA深度測序和RT-PCR檢測侵染廣東省冬種馬鈴薯的病毒[J]. 路秉翰,湯亞飛,于琳,佘小漫,鄧銘光,何自福. 植物保護學報. 2019(03)
[2]山東省馬鈴薯病害調(diào)查[J]. 王炳森,王麗,陳惠蘭. 中國馬鈴薯. 2017(02)
[3]烏蘭察布市馬鈴薯病毒病調(diào)查分析[J]. 苑智華. 江蘇農(nóng)業(yè)科學. 2015(11)
[4]馬鈴薯病毒PVY,PVS和PLRV多重RT-PCR檢測[J]. 黃丹,余琨,陳建斌,蔡紅,朱有勇. 云南農(nóng)業(yè)大學學報(自然科學). 2015(04)
[5]馬鈴薯Y病毒pipo基因的分子變異及結(jié)構(gòu)特征分析[J]. 高芳鑾,沈建國,史鳳陽,常飛,謝聯(lián)輝,詹家綏. 遺傳. 2013(09)
[6]湖南省馬鈴薯主產(chǎn)區(qū)馬鈴薯病毒種類及流行分析[J]. 胡新喜,雷艷,何長征,劉明月,李炎林,宋勇,黃科,秦玉芝,熊興耀,Nie Xianzhou. 中國馬鈴薯. 2012(06)
[7]植物病原物的群體遺傳學[J]. 祝雯,詹家綏. 遺傳. 2012(02)
[8]四川省馬鈴薯主產(chǎn)區(qū)最新病毒病普查及血清學鑒定[J]. 鐘婷婷,蒲志剛,何俊蓉,吳潔,楊春林,閻文昭. 西南農(nóng)業(yè)學報. 2008(01)
[9]黑龍江省馬鈴薯病毒病的普查及鑒定[J]. 劉洪義,張洪祥,李明福,楊立群,騰麗雅,于恒純,張有才. 東北農(nóng)業(yè)大學學報. 2006(03)
碩士論文
[1]馬鈴薯Y病毒pipo基因的遺傳結(jié)構(gòu)分析[D]. 常飛.福建農(nóng)林大學 2015
[2]中國4個省份馬鈴薯Y病毒(PVY)P1基因的群體遺傳結(jié)構(gòu)[D]. 史鳳陽.福建農(nóng)林大學 2014
本文編號:3494707
【文章來源】:植物保護. 2020,46(04)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:8 頁
【部分圖文】:
基于全基因組序列構(gòu)建的中國北方3省(區(qū))
【參考文獻】:
期刊論文
[1]基于小RNA深度測序和RT-PCR檢測侵染廣東省冬種馬鈴薯的病毒[J]. 路秉翰,湯亞飛,于琳,佘小漫,鄧銘光,何自福. 植物保護學報. 2019(03)
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[1]馬鈴薯Y病毒pipo基因的遺傳結(jié)構(gòu)分析[D]. 常飛.福建農(nóng)林大學 2015
[2]中國4個省份馬鈴薯Y病毒(PVY)P1基因的群體遺傳結(jié)構(gòu)[D]. 史鳳陽.福建農(nóng)林大學 2014
本文編號:3494707
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