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基于全基因序列的中國北方3。▍^(qū))馬鈴薯Y病毒遺傳多樣性分析

發(fā)布時間:2021-11-14 13:16
  本研究以馬鈴薯Y病毒(PVY)全基因組為基礎(chǔ),分析吉林、黑龍江和內(nèi)蒙古3。▍^(qū))PVY群體遺傳多樣性和群體分化,并評估突變、重組、選擇等遺傳力所起的作用。根據(jù)已報道的PVY全基因序列保守區(qū)設(shè)計4對引物,采用片段重疊法對來自內(nèi)蒙古和吉林的24個PVY分離物全基因序列進(jìn)行測定,并聯(lián)合NCBI中已登錄的9個黑龍江分離物全基因組序列進(jìn)行遺傳多樣性參數(shù)評估、群體分化檢驗和分子變異等分析。結(jié)果顯示,我國北方3。▍^(qū))PVY群體遺傳多樣性高,其中內(nèi)蒙古和黑龍江PVY群體遺傳多樣性高于吉林群體,并且3個群體之間呈現(xiàn)一定程度的遺傳分化。分子變異分析發(fā)現(xiàn)在PVY基因組中存在1 786個變異位點,表明我國北方3。▍^(qū))PVY群體變異程度較高,并且這種高變異度有85.54%來自各個馬鈴薯種植區(qū)內(nèi)PVY個體的遺傳變異。重組分析和系統(tǒng)發(fā)育分析發(fā)現(xiàn),我國北方3。▍^(qū))PVY群體中重組株系占比高達(dá)90.3%,并具有明顯的株系多樣性,表明PVY重組株系已成為我國北方3。▍^(qū))馬鈴薯種植區(qū)的流行株系。選擇壓力分析顯示,使用FEL和IFEL法分別檢測出501個和315個凈化壓力選擇位點,這表明3省(區(qū))PVY群體受凈化選擇... 

【文章來源】:植物保護(hù). 2020,46(04)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】:8 頁

【部分圖文】:

基于全基因序列的中國北方3。▍^(qū))馬鈴薯Y病毒遺傳多樣性分析


基于全基因組序列構(gòu)建的中國北方3省(區(qū))

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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[3]烏蘭察布市馬鈴薯病毒病調(diào)查分析[J]. 苑智華.  江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2015(11)
[4]馬鈴薯病毒PVY,PVS和PLRV多重RT-PCR檢測[J]. 黃丹,余琨,陳建斌,蔡紅,朱有勇.  云南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)). 2015(04)
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[7]植物病原物的群體遺傳學(xué)[J]. 祝雯,詹家綏.  遺傳. 2012(02)
[8]四川省馬鈴薯主產(chǎn)區(qū)最新病毒病普查及血清學(xué)鑒定[J]. 鐘婷婷,蒲志剛,何俊蓉,吳潔,楊春林,閻文昭.  西南農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2008(01)
[9]黑龍江省馬鈴薯病毒病的普查及鑒定[J]. 劉洪義,張洪祥,李明福,楊立群,騰麗雅,于恒純,張有才.  東北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2006(03)

碩士論文
[1]馬鈴薯Y病毒pipo基因的遺傳結(jié)構(gòu)分析[D]. 常飛.福建農(nóng)林大學(xué) 2015
[2]中國4個省份馬鈴薯Y病毒(PVY)P1基因的群體遺傳結(jié)構(gòu)[D]. 史鳳陽.福建農(nóng)林大學(xué) 2014



本文編號:3494707

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