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抗番茄黃化曲葉病毒病基因ty-5的精細(xì)定位及連鎖標(biāo)記的應(yīng)用

發(fā)布時(shí)間:2021-11-02 11:29
  番茄(Solanum lycopersicum)屬于茄科番茄屬,適應(yīng)性強(qiáng),易于栽培,產(chǎn)量高,品種多,具有較高的營(yíng)養(yǎng)價(jià)值,在世界各地廣泛種植。近年來(lái)番茄黃化曲葉。═omato yellow leaf curl disease,TYLCD)的發(fā)生制約著番茄生產(chǎn)的品質(zhì)和產(chǎn)量。番茄黃化曲葉病毒(Tomato yellow leaf curl virus TYLCV)屬雙生病毒,是導(dǎo)致世界各地番茄發(fā)病的重要病毒,對(duì)番茄的生產(chǎn)危害極大。TYLCV傳播范圍廣、速度快,利用化學(xué)藥劑、物理、生物等方式難以防治,而選育抗病品種能最經(jīng)濟(jì)有效的減輕該病害的發(fā)生。傳統(tǒng)的番茄育種方式,存在育種周期長(zhǎng)、耗費(fèi)人力物力,不良連鎖不易被打破等缺點(diǎn)。而分子標(biāo)記輔助選擇(marker-assisted selection,MAS)育種能夠克服傳統(tǒng)育種的缺陷,加快目標(biāo)育種進(jìn)程。目前已知抗TYLCV的基因有Ty-1、Ty-2、Ty-3、Ty-3a、Ty-4 ty-5、Ty-6,其中Ty-1和Ty-3基因已被克隆,抗病品種中的抗性基因主要以Ty-1、Ty-2.Ty--3和Ty-3a為主。ty-5基因是近年來(lái)新發(fā)現(xiàn)的抗TYLCV基... 

【文章來(lái)源】:南京農(nóng)業(yè)大學(xué)江蘇省 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁(yè)數(shù)】:84 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

抗番茄黃化曲葉病毒病基因ty-5的精細(xì)定位及連鎖標(biāo)記的應(yīng)用


圖2-1?親本材料接種TYLCV的病情表型??Figure?2-1?parent?material?phenotype?after?inoculated?with?TYLCV??

親本,材料,基因


?抗番茄黃化曲葉病毒病基因的精細(xì)定位及連鎖標(biāo)記的應(yīng)用???2.4.3分子標(biāo)記檢測(cè)結(jié)果??用S1NAC1標(biāo)記檢測(cè)親本材料結(jié)果如圖2-2,?P,為ATV01227抗病親本材料,條帶??大小為206bp;?P2為moneymaker感病親本材料,條帶大小為16]bp,與基因特異??性條帶大小一致。結(jié)果顯示,本課題組引進(jìn)的親本材料中可以檢測(cè)到與<y-5基因分子??連鎖標(biāo)記大小一致的特異性條帶,證明該材料中的抗TYLCV的基因?yàn)閱坞[性遺傳基??因(y-5。??M?PI?P2??■??圖2-2?SIN?AC?1標(biāo)記檢測(cè)親本材料??注:M:?lOObp?Marker;?Pi:?ATV01227?抗病親本材料;P2:?moneymaker?感病親本材料??Figure?2-2?I'he?SIN?AC?1?marker?detects?the?parental?lines??Note:?M:?lOObp?Marker;?Pi:?ATV01227?resistant?parental?line;?P2:?moneymaker?susceptible?parental?line??2.5討論??本研究通過(guò)對(duì)引進(jìn)的AVT01227番茄材料的抗性鑒定和遺傳分析表明,該親本材??料AVT01227對(duì)TYLCV表現(xiàn)出很高的抗性,Fdf群體植株的田間表型為感病,F2代??分離群體的遺傳分析符合孟德?tīng)栠z傳規(guī)律抗感比為1:3,通過(guò)遺傳分析得出AVT01227??材料具有抗TYLCV基因?yàn)殡[性遺傳基因。用前人(Anbindereta丨.,2009)發(fā)現(xiàn)的TY172??中與少-5基因連鎖的CAPS標(biāo)記S1NAC1檢測(cè)親本材料得出含有基因的條帶,與?

深度分布,測(cè)序,深度分布,基因組序列


n?reads,從S池中獲得了?39118590?clean??reads。clean?reads在番前染色體覆蓋率幾乎為91.7%。測(cè)序數(shù)據(jù)符合正態(tài)分布規(guī)律(圖??3-1?),。页睾停映氐幕旌铣氐臏y(cè)序深度在l〇x?6〇x之間的基因組序列為有效測(cè)序數(shù)??據(jù)。??4??£?3.??(J)??〇??]2-?||?{??0.?。?[?。?i?丨-??6?2040 ̄ ̄60 ̄ ̄80 ̄ ̄100?120?140?160+??Sequencing?depth??圖3-1?R池和S池測(cè)序深度分布圖??Figure?3-1?R?pool?and?S?pool?sequencing?depth??R池和S池的基因組序列的覆蓋率分別為96.66%和96.86%。通過(guò)測(cè)序結(jié)果分析??在R池和S池的混合池之間檢測(cè)到1709042個(gè)SNP和94066個(gè)InDel?(表3-1?)。??表3-1混池樣品間SNP和InDel統(tǒng)計(jì)???Table?3-1?SNP?and?InDel?statistics?between?mix?pool?samples???Pool?SINP_INum?InDelJNum??R01?vs?R02?1709042?94066??注:Pooh混池編號(hào);SNP_Num:混池間的SNP數(shù);InDelJMum:混池間的InDel數(shù)。??18??

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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博士論文
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碩士論文
[1]番茄Ty基因?qū)YLCV復(fù)制、轉(zhuǎn)錄和移動(dòng)的影響及TYLCV侵染后番茄的轉(zhuǎn)錄組分析[D]. 李佳蔚.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2016
[2]不同番茄抗病基因型和溫度對(duì)TYLCV復(fù)制的影響[D]. 林銘.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2013



本文編號(hào):3471896

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