湖南、海南省菜豆金色花葉病毒屬病毒的鑒定
發(fā)布時(shí)間:2021-10-25 16:30
雙生病毒科病毒是一類(lèi)具有孿生顆粒形態(tài)的植物單鏈DNA病毒,由煙粉虱或葉蟬為媒介進(jìn)行傳播,寄主范圍十分廣泛,在熱帶和亞熱帶地區(qū)對(duì)多種作物造成毀滅性危害。近年來(lái)雙生病毒在我國(guó)的危害范圍不斷擴(kuò)大,云南、重慶、海南、廣西、山東等多個(gè)省份均已發(fā)現(xiàn)其侵染,因此對(duì)雙生病毒的早期檢測(cè)也變得越來(lái)越重要。為了進(jìn)一步確定雙生病毒在我國(guó)的傳播、分布和發(fā)生規(guī)律,本論文對(duì)從湖南地區(qū)采集到的6例和海南采集到的1例疑似雙生病毒侵染的樣品進(jìn)行了檢測(cè)和分子鑒定。2016年,我們?cè)诤鲜“l(fā)現(xiàn)洋姜、番茄、蘿卜、賽葵、甘薯和牽;ǖ6種植物表現(xiàn)卷葉、葉片發(fā)黃、矮化等疑似雙生病毒侵染的癥狀。隨后從采集到的葉片樣品中分別提取總DNA,并以其為模板進(jìn)行了RCA(Rolling cycle amplification,RCA)擴(kuò)增,基于RCA-PCR技術(shù),在未知病毒序列的情況下,通過(guò)酶切RCA產(chǎn)物得到了部分病毒基因組片段。根據(jù)測(cè)得的部分序列,我們?cè)O(shè)計(jì)特異引物去擴(kuò)增分離物的DNA-A序列全長(zhǎng)。在GenBank數(shù)據(jù)庫(kù),將得到的全長(zhǎng)核苷酸序列分別進(jìn)行BLAST同源性檢索,結(jié)果表明,番茄和牽;ň浑p生病毒侵染:番茄樣品分離物的DNA-A組份...
【文章來(lái)源】:中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京市
【文章頁(yè)數(shù)】:71 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
滾環(huán)擴(kuò)增過(guò)程圖(引自Reaginetal.,2003)
5圖 1.2:雙生病毒科九個(gè)屬的基因組結(jié)構(gòu)圖(引自 Varsani et al., 2017)igure 1.2: Genome organizations of nine genera within family Geminiviridae.(cited from Varsani et al., 2017)玉米線條病毒屬(Mastrevirus)病毒其基因組一般是單組份病毒,大小約為 2.6-2.8 kb,玉米病毒(Maize streak virus, MSV)為其代表種,含有 4 個(gè) OFRs,其病毒鏈和互補(bǔ)鏈各自具有 ORFs,其中病毒鏈含有 Vl 和 V2 兩個(gè)開(kāi)放閱讀框,分別編碼外殼蛋白(Coat protein, CP)和蛋白(Movement protein, MP),互補(bǔ)鏈含有兩個(gè)開(kāi)放閱讀框 C1 和 C2,分別編碼復(fù)制相關(guān) A(Replication associated protein A, RepA)和復(fù)制相關(guān)蛋白(Replication associated protein,。病毒鏈和互補(bǔ)鏈上含有大小不同的兩個(gè)基因間隔區(qū),即 LIR(Large intergenic region)和
第二章 湖南省番茄和牽牛花上的雙生病毒分子鑒定近些年,雙生病毒在中國(guó)的危害日益加重,傳播速度越來(lái)越快,侵染范圍也不斷擴(kuò)大。在,我國(guó)并未在湖南省發(fā)現(xiàn)過(guò)雙生病毒,為了明確其在中國(guó)的發(fā)生分布,本研究基于 RCA-P,對(duì)從湖南采集到的番茄和牽;悠愤M(jìn)行了病原分子鑒定,通過(guò)擴(kuò)增得到了樣品分離物序列全長(zhǎng),這為更好地完善對(duì)該病害的防控防治工作,提供了一定的科學(xué)依據(jù)。 材料和儀器.1 材料2016 年 10 月在湖南省長(zhǎng)沙市采集到番茄、牽;、甘薯、蘿卜、洋姜和賽葵樣品(圖 2.1番茄和牽;ň哂须p生病毒侵染的植株矮化、葉片邊緣上卷,葉片增厚,黃化等典型癥狀證實(shí)是被雙生病毒侵染。陽(yáng)性對(duì)照為本實(shí)驗(yàn)室保存的番茄黃化曲葉病毒和甘薯曲葉病毒。AA CB
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]番茄黃化曲葉病毒病綜合防控技術(shù)研究進(jìn)展[J]. 徐德利,楊靜,鮑繼友,謝玲,吳敏,鄭燕. 農(nóng)業(yè)科技通訊. 2014(09)
[2]甘薯卷葉病毒江蘇分離物基因組全長(zhǎng)序列測(cè)定及其外殼蛋白基因在大腸桿菌中的表達(dá)[J]. 喬貞貞,秦艷紅,喬奇,張德勝,田雨婷,高潔,張振臣. 河南農(nóng)業(yè)科學(xué). 2012(04)
[3]河北魏縣番茄黃化曲葉病毒病的發(fā)生情況及其綜合防控措施[J]. 王書(shū)芳. 中國(guó)植保導(dǎo)刊. 2011(02)
[4]番茄黃化曲葉病毒病的發(fā)生分布及防治對(duì)策[J]. 宋建軍,劉紅宵,仇燕,田鵬. 北方園藝. 2010(07)
[5]番茄病毒病的癥狀、病原與藥劑防治[J]. 王愛(ài)武,皇甫自起. 長(zhǎng)江蔬菜. 2010(03)
[6]我國(guó)番茄黃化曲葉病發(fā)生規(guī)律和研究進(jìn)展[J]. 李小靖,葉志彪. 長(zhǎng)江蔬菜. 2010(02)
[7]淺談番茄黃曲葉病毒病[J]. 馮蘭香,謝丙炎,楊宇紅. 中國(guó)蔬菜. 2009(05)
[8]滾環(huán)DNA擴(kuò)增的原理、應(yīng)用和展望[J]. 肖樂(lè)義,祁自柏,姜俊,張子寬. 中國(guó)生物工程雜志. 2004(09)
[9]雙生病毒——一類(lèi)值得重視的植物病毒[J]. 周雪平,崔曉峰,陶小榮. 植物病理學(xué)報(bào). 2003(06)
[10]粉虱傳雙生病毒的TAS-ELISA及PCR快速檢測(cè)[J]. 謝艷,張仲凱,李正和,丁銘,周雪平. 植物病理學(xué)報(bào). 2002(02)
博士論文
[1]雙生病毒DNAβ分子βC1基因的功能研究[D]. 崔曉峰.浙江大學(xué) 2004
碩士論文
[1];ㄈ~型萎縮病病原的鑒定[D]. 馬宇欣.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2015
本文編號(hào):3457780
【文章來(lái)源】:中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京市
【文章頁(yè)數(shù)】:71 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
滾環(huán)擴(kuò)增過(guò)程圖(引自Reaginetal.,2003)
5圖 1.2:雙生病毒科九個(gè)屬的基因組結(jié)構(gòu)圖(引自 Varsani et al., 2017)igure 1.2: Genome organizations of nine genera within family Geminiviridae.(cited from Varsani et al., 2017)玉米線條病毒屬(Mastrevirus)病毒其基因組一般是單組份病毒,大小約為 2.6-2.8 kb,玉米病毒(Maize streak virus, MSV)為其代表種,含有 4 個(gè) OFRs,其病毒鏈和互補(bǔ)鏈各自具有 ORFs,其中病毒鏈含有 Vl 和 V2 兩個(gè)開(kāi)放閱讀框,分別編碼外殼蛋白(Coat protein, CP)和蛋白(Movement protein, MP),互補(bǔ)鏈含有兩個(gè)開(kāi)放閱讀框 C1 和 C2,分別編碼復(fù)制相關(guān) A(Replication associated protein A, RepA)和復(fù)制相關(guān)蛋白(Replication associated protein,。病毒鏈和互補(bǔ)鏈上含有大小不同的兩個(gè)基因間隔區(qū),即 LIR(Large intergenic region)和
第二章 湖南省番茄和牽牛花上的雙生病毒分子鑒定近些年,雙生病毒在中國(guó)的危害日益加重,傳播速度越來(lái)越快,侵染范圍也不斷擴(kuò)大。在,我國(guó)并未在湖南省發(fā)現(xiàn)過(guò)雙生病毒,為了明確其在中國(guó)的發(fā)生分布,本研究基于 RCA-P,對(duì)從湖南采集到的番茄和牽;悠愤M(jìn)行了病原分子鑒定,通過(guò)擴(kuò)增得到了樣品分離物序列全長(zhǎng),這為更好地完善對(duì)該病害的防控防治工作,提供了一定的科學(xué)依據(jù)。 材料和儀器.1 材料2016 年 10 月在湖南省長(zhǎng)沙市采集到番茄、牽;、甘薯、蘿卜、洋姜和賽葵樣品(圖 2.1番茄和牽;ň哂须p生病毒侵染的植株矮化、葉片邊緣上卷,葉片增厚,黃化等典型癥狀證實(shí)是被雙生病毒侵染。陽(yáng)性對(duì)照為本實(shí)驗(yàn)室保存的番茄黃化曲葉病毒和甘薯曲葉病毒。AA CB
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]番茄黃化曲葉病毒病綜合防控技術(shù)研究進(jìn)展[J]. 徐德利,楊靜,鮑繼友,謝玲,吳敏,鄭燕. 農(nóng)業(yè)科技通訊. 2014(09)
[2]甘薯卷葉病毒江蘇分離物基因組全長(zhǎng)序列測(cè)定及其外殼蛋白基因在大腸桿菌中的表達(dá)[J]. 喬貞貞,秦艷紅,喬奇,張德勝,田雨婷,高潔,張振臣. 河南農(nóng)業(yè)科學(xué). 2012(04)
[3]河北魏縣番茄黃化曲葉病毒病的發(fā)生情況及其綜合防控措施[J]. 王書(shū)芳. 中國(guó)植保導(dǎo)刊. 2011(02)
[4]番茄黃化曲葉病毒病的發(fā)生分布及防治對(duì)策[J]. 宋建軍,劉紅宵,仇燕,田鵬. 北方園藝. 2010(07)
[5]番茄病毒病的癥狀、病原與藥劑防治[J]. 王愛(ài)武,皇甫自起. 長(zhǎng)江蔬菜. 2010(03)
[6]我國(guó)番茄黃化曲葉病發(fā)生規(guī)律和研究進(jìn)展[J]. 李小靖,葉志彪. 長(zhǎng)江蔬菜. 2010(02)
[7]淺談番茄黃曲葉病毒病[J]. 馮蘭香,謝丙炎,楊宇紅. 中國(guó)蔬菜. 2009(05)
[8]滾環(huán)DNA擴(kuò)增的原理、應(yīng)用和展望[J]. 肖樂(lè)義,祁自柏,姜俊,張子寬. 中國(guó)生物工程雜志. 2004(09)
[9]雙生病毒——一類(lèi)值得重視的植物病毒[J]. 周雪平,崔曉峰,陶小榮. 植物病理學(xué)報(bào). 2003(06)
[10]粉虱傳雙生病毒的TAS-ELISA及PCR快速檢測(cè)[J]. 謝艷,張仲凱,李正和,丁銘,周雪平. 植物病理學(xué)報(bào). 2002(02)
博士論文
[1]雙生病毒DNAβ分子βC1基因的功能研究[D]. 崔曉峰.浙江大學(xué) 2004
碩士論文
[1];ㄈ~型萎縮病病原的鑒定[D]. 馬宇欣.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2015
本文編號(hào):3457780
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