基于16S rRNA高通量測序技術(shù)的兩種蟬科昆蟲貯菌體細(xì)菌多樣性研究
發(fā)布時間:2021-10-17 01:38
蟬科昆蟲具有刺吸式口器,若蟲和成蟲均以植物木質(zhì)部汁液為食。木質(zhì)部汁液中的碳水化合物、氨基酸和維生素等含量極低,營養(yǎng)成分極度不均衡。在長期的進化過程中,蟬科昆蟲與體內(nèi)的細(xì)菌形成密切的共生關(guān)系,并通過共生菌獲得營養(yǎng)代謝和生長發(fā)育所必須的部分營養(yǎng)物質(zhì)。共生菌與寄主協(xié)同進化,能夠影響寄主種群擴張和物種分化。蟬科昆蟲的內(nèi)共生菌通常存在于體內(nèi)特殊的器官——貯菌體。截至目前,關(guān)于蟬科同一物種不同地理種群、不同發(fā)育階段的貯菌體和生殖器官的共生菌多樣性研究較少,相關(guān)的細(xì)菌群落組成也不清楚。鑒于此,本文采用16S rRNA高通量測序技術(shù)對枯蟬Subpsaltria yangi Chen兩個地理種群和不同發(fā)育階段的蒙古寒蟬Meimuna mongolica(Distant)貯菌體、卵巢、精巢、卵的細(xì)菌多樣性進行了研究,并對其解剖結(jié)構(gòu)進行形態(tài)學(xué)觀察,主要研究結(jié)果如下。(1)分布于寧夏賀蘭山和陜西韓城的兩個枯蟬種群,生活環(huán)境及寄主植物都不同。形態(tài)學(xué)研究表明這兩個種群的貯菌體及生殖器官沒有差別。韓城種群的貯菌體和生殖器官細(xì)菌多樣性明顯高于賀蘭山種群,兩個種群均以精巢的細(xì)菌多樣性最高。專性共生菌Sulcia mue...
【文章來源】:西北農(nóng)林科技大學(xué)陜西省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:58 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
取食不同寄主植物的枯蟬AB
第二章材料與方法9蟬的卵,選取適量的剛羽化的成蟲(雌雄比例約為1:1)置于罩有杜梨樹枝(未經(jīng)產(chǎn)卵的枝條)的養(yǎng)蟲籠內(nèi)。幾天后,雌蟲和雄蟲均性成熟并完成交配(圖2-2B),待雌蟲產(chǎn)卵后,收集卵,并解剖性成熟的雌、雄成蟲用于后續(xù)實驗。AB圖2-2蒙古寒蟬成蟲A,剛羽化的成蟲;B,性成熟的成蟲Figure2-2AdultsofM.mongolicaA,Newlyemergedadult;B,Sexuallymatureadults2.1.4實驗試劑和儀器2.1.4.1主要試劑血液/細(xì)胞/組織基因組DNA提取試劑盒(天根,北京)、TaKaMinBESTUniversalGenomicDNAExtractionKitVer.5.0、DNAMaker(Takara生物,大連)、Taq酶(Takara生物,大連)、細(xì)菌16SrRNA通用引物:27F(5-AGAGTTTGATCMTGGCTCAG-3)和1492R(5-ATGGGYTACCTTGTTACGACTT-3)、細(xì)菌16SrRNAV4區(qū)引物:515F(5-GTGCCAGCMGCCGCGGTAA-3)和806R(5-GGACTACVSGGGTATCTAAT-3)、COI基因特異性引物:L-1490(5-GGTCAACAAATCATAAAGATATTGG-3)和H-2198(5-TAAACTTCAGGGTGACCAAAAAATCA-3)。本實驗所用引物由上海生工生物技術(shù)有限公司合成。2.1.4.2主要儀器本研究所用儀器見表2-1。
第二章材料與方法15圖2-316SrRNA高通量分析流程Figure2-3Theanalysisprocessof16SrRNAhigh-throughputsequencing2.2.4卵的分子鑒定實驗中使用的蒙古寒蟬的卵是用枝條飼養(yǎng)成蟲得到,因此可以確定收集到的卵都是蒙古寒蟬的后代。但枯蟬的卵采自野外,為保證采集到的卵都是枯蟬的后代,測定枯蟬卵的線粒體細(xì)胞色素氧化酶I(COI)基因序列。2.2.4.1基因組DNA的提取與檢測以保存于–80°C冰箱中的卵為材料,采用試劑盒(TaKaMinBESTUniversalGenomicDNAExtractionKitVer.5.0)的方法提取基因組DNA。2.2.4.2COI基因的PCR擴增(1)引物將獲得的基因組DNA用于PCR擴增。擴增的目的基因片段為線粒體COI基因的部分序列。擴增引物為COI:L-1490和H-2198(Simonetal.1994)。
本文編號:3440870
【文章來源】:西北農(nóng)林科技大學(xué)陜西省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:58 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
取食不同寄主植物的枯蟬AB
第二章材料與方法9蟬的卵,選取適量的剛羽化的成蟲(雌雄比例約為1:1)置于罩有杜梨樹枝(未經(jīng)產(chǎn)卵的枝條)的養(yǎng)蟲籠內(nèi)。幾天后,雌蟲和雄蟲均性成熟并完成交配(圖2-2B),待雌蟲產(chǎn)卵后,收集卵,并解剖性成熟的雌、雄成蟲用于后續(xù)實驗。AB圖2-2蒙古寒蟬成蟲A,剛羽化的成蟲;B,性成熟的成蟲Figure2-2AdultsofM.mongolicaA,Newlyemergedadult;B,Sexuallymatureadults2.1.4實驗試劑和儀器2.1.4.1主要試劑血液/細(xì)胞/組織基因組DNA提取試劑盒(天根,北京)、TaKaMinBESTUniversalGenomicDNAExtractionKitVer.5.0、DNAMaker(Takara生物,大連)、Taq酶(Takara生物,大連)、細(xì)菌16SrRNA通用引物:27F(5-AGAGTTTGATCMTGGCTCAG-3)和1492R(5-ATGGGYTACCTTGTTACGACTT-3)、細(xì)菌16SrRNAV4區(qū)引物:515F(5-GTGCCAGCMGCCGCGGTAA-3)和806R(5-GGACTACVSGGGTATCTAAT-3)、COI基因特異性引物:L-1490(5-GGTCAACAAATCATAAAGATATTGG-3)和H-2198(5-TAAACTTCAGGGTGACCAAAAAATCA-3)。本實驗所用引物由上海生工生物技術(shù)有限公司合成。2.1.4.2主要儀器本研究所用儀器見表2-1。
第二章材料與方法15圖2-316SrRNA高通量分析流程Figure2-3Theanalysisprocessof16SrRNAhigh-throughputsequencing2.2.4卵的分子鑒定實驗中使用的蒙古寒蟬的卵是用枝條飼養(yǎng)成蟲得到,因此可以確定收集到的卵都是蒙古寒蟬的后代。但枯蟬的卵采自野外,為保證采集到的卵都是枯蟬的后代,測定枯蟬卵的線粒體細(xì)胞色素氧化酶I(COI)基因序列。2.2.4.1基因組DNA的提取與檢測以保存于–80°C冰箱中的卵為材料,采用試劑盒(TaKaMinBESTUniversalGenomicDNAExtractionKitVer.5.0)的方法提取基因組DNA。2.2.4.2COI基因的PCR擴增(1)引物將獲得的基因組DNA用于PCR擴增。擴增的目的基因片段為線粒體COI基因的部分序列。擴增引物為COI:L-1490和H-2198(Simonetal.1994)。
本文編號:3440870
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