蘋果黑腐皮殼菌G蛋白-cAMP-PKA信號通路相關(guān)基因的功能研究
發(fā)布時間:2021-10-13 08:54
由蘋果黑腐皮殼菌(Valsa mali)引起的蘋果樹腐爛病,是蘋果上的一種毀滅性真菌病害。一旦病菌侵入到蘋果樹枝干的韌皮部和木質(zhì)部,生產(chǎn)上只能利用外科手術(shù)及化學(xué)藥劑進(jìn)行防治,但是化學(xué)藥劑由于很難達(dá)到樹皮和樹干深層,無法很好的控制病害,從而導(dǎo)致生產(chǎn)上嚴(yán)重的產(chǎn)量和經(jīng)濟(jì)損失。因此,解析蘋果黑腐皮殼菌的致病機(jī)制對于開發(fā)新的腐爛病防治策略具有重要意義。病原菌通過G蛋白所調(diào)控的cAMP/PKA(the cyclic AMP/protein kinase A)信號轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑對外界的變化做出改變,從而調(diào)控病原真菌的致病性。G蛋白,G蛋白調(diào)控因子(RGS),以及PKA是G蛋白-cAMP-PKA信號通路的三個重要組成部分。本論文借助蘋果黑腐皮殼菌全基因組測序信息,對蘋果黑腐皮殼菌G蛋白α亞基、RGS和蛋白激酶A的兩個催化亞基開展研究,明確它們在蘋果黑腐皮殼菌生長發(fā)育以及侵染致病等過程中的作用。該研究為全面揭示蘋果黑腐皮殼菌的致病機(jī)理奠定基礎(chǔ),進(jìn)而為制定蘋果樹腐爛病防治新策略,提供重要的理論依據(jù)。主要研究結(jié)果如下:1.蘋果黑腐皮殼菌G蛋白α亞基Gvm2和Gvm3基因的鑒定和功能分析G蛋白可以通過調(diào)控cAMP/...
【文章來源】:西北農(nóng)林科技大學(xué)陜西省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:98 頁
【學(xué)位級別】:博士
【部分圖文】:
異三聚體蛋白信號途徑模式(Lietal.2007)
圖2-1基于同源重組的基因敲除和四對引物PCR檢測轉(zhuǎn)化子示意圖Fig.2-1GeneknockoutbyhomologousrecombinationandPCRscreeningoftransformantswithfourpairprimers.2.3.2.2Double-jointPCR方法構(gòu)建敲除載體為了檢驗Gα蛋白的生物學(xué)功能,我們擬生成三個基因Gvm1,Gvm2和Gvm3的敲除突變體。我們使用Double-jointPCR的方法構(gòu)建基因敲除盒(Yuetal.2014)。根據(jù)蘋果黑腐皮殼菌基因組數(shù)據(jù)庫中基因兩側(cè)的基因組DNA序列,分別選取開放閱讀框上游與下游各1kb左右的DNA序列作為同源重組時的上臂和下臂,構(gòu)建基因敲除體系。以03-8基因組DNA為模板分別用引物對Gvm1-1F/Gvm1-2R,Gvm1-3F/Gvm1-4R,Gvm2-1F/Gvm2-2R,Gvm2-3F/Gvm2-4R和Gvm3-1F/Gvm3-2R,Gvm3-3F/Gvm3-4R擴(kuò)出上游片段L1和下游片段L2,以攜帶潮霉素磷酸轉(zhuǎn)移酶基因(hph)的質(zhì)粒PHIG2RHPH2-GFP-GUS為模板用引物HYG-F/HYG-R擴(kuò)增hph基因片段,并膠回收PCR產(chǎn)物。接著用Double-jointPCR方法將3段片段連接在一起,構(gòu)建敲除片段。構(gòu)建好的敲除片段轉(zhuǎn)化進(jìn)入野生型菌株03-8通過同源重組實現(xiàn)基因敲除。2.3.2.3野生型蘋果黑腐皮殼菌原生質(zhì)體的制備和轉(zhuǎn)化(1)將03-8野生型菌株接種到鋪玻璃紙的PDA平板上,25℃培養(yǎng)2d。將菌絲刮成小塊接種到含有100mlYEPD液體培養(yǎng)基的250ml三角瓶中,25℃,110rpm培養(yǎng)36h。(2)用無菌濾布過濾收集菌絲,稱量菌絲并加入酶解液(0.7g菌絲/10ml酶解液)。(3)放置于搖床上30℃,90rpm搖約2-2.5h。(4)顯微鏡下觀察,酶解完成后,上面放兩層擦鏡紙下面放一層無菌濾布過濾酶解混合物到無菌的50ml離心管中,再用1.2M的KCl沖洗,以便將原生質(zhì)體盡可能多的洗下來,用KCl定容至50ml。(5)室溫4500rpm離心10min。(6)棄上清,加入15mlSTCBuffer用移液槍輕微的重新懸浮,4
圖2-2接種位置示意圖Fig.2-2Inoculatelocationdiagram.2.3.8胞內(nèi)cAMP濃度和PKA活性分析收集YEPD搖培3d的菌絲體,液氮冷凍。樣品的cAMP濃度由蘇州科銘生物技術(shù)有限公司采用HPLC方法測定。數(shù)據(jù)分析采用SAS軟件包(SASInstitute,Cary,USA)平均數(shù)差異顯著性t檢驗分析,p<0.05。收集YEPD搖培3d的菌絲體用于PKA活性檢測,液氮研磨0.3g的菌絲樣品。PKA活性檢測使用PepTag非放射性蛋白激酶檢測系統(tǒng)(Promega,Madison,USA)測定。測定樣品用1.2%的瓊脂糖凝膠160V電壓跑15min。紫外透照器檢測。2.4試驗結(jié)果2.4.1G蛋白α亞基序列分析與比較根據(jù)M.oryzaeMagA,MagB和MagCGα亞基蛋白序列分別在蘋果黑腐皮殼菌轉(zhuǎn)錄組和基因組數(shù)據(jù)庫中Blast比對分析,共找到3個異源三聚體G蛋白的Gα亞基,命名為Gvm1(VM1G_00876),Gvm2(VM1G_09956)和Gvm3(VM1G_04248)。Gvm1基因編碼含353個氨基酸的多肽包括3個內(nèi)含子,與稻瘟病菌的MAGB(AF011341)有98.6%的相似性,與粗糙脈孢菌的GNA-1(XP957133)有98.3%的相似性,與釀酒酵母Gpa1(NP011868)有28.5%的相似性。Gvm2基因編碼含357個氨基酸的多肽包括4個內(nèi)含子,與稻瘟病菌的MAGC(AF011342)有82.7%的相似性,與粗糙脈孢菌的GNA-2(Q05424)有81.0%的相似性。Gvm3基因編碼含355個氨基酸的多肽包括5個內(nèi)含子,與稻瘟病菌的MAGA(AF011340)有89.9%的相似性,與粗糙脈孢菌的GNA-3(XP962205)有85.4%的相似性,與釀酒酵母Gpa2(NP010937)有40.1%的相似性(圖2-3A)。不同的異源三聚體G蛋白α亞基的系統(tǒng)發(fā)育樹分為三個組群:組群I,組群II和組21
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]蘋果樹腐爛病菌果膠裂解酶基因Vmpl4的致病功能研究[J]. 許春景,孫迎超,吳玉星,馮浩,高小寧,黃麗麗. 果樹學(xué)報. 2017(01)
[2]蘋果樹腐爛病菌多聚半乳糖醛酸酶基因Vmpg7和Vmpg8的功能[J]. 許春景,吳玉星,戴青青,李正鵬,高小寧,黃麗麗. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2016(08)
[3]陜西渭北地區(qū)蘋果樹腐爛病發(fā)生情況調(diào)查[J]. 李正鵬,高小寧,杜戰(zhàn)濤,胡楊,康振生,黃麗麗. 西北農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2013(01)
[4]蘋果樹腐爛病室內(nèi)快速評價方法的研究[J]. 韋潔玲,黃麗麗,郜佐鵬,柯希望,康振生. 植物病理學(xué)報. 2010(01)
[5]七株植物內(nèi)生放線菌對蘋果樹腐爛病的防治作用[J]. 郜佐鵬,柯希望,韋潔玲,陳銀潮,康振生,黃麗麗. 植物保護(hù)學(xué)報. 2009(05)
[6]中國蘋果樹腐爛病發(fā)生和防治情況調(diào)查[J]. 曹克強(qiáng),國立耘,李保華,孫廣宇,陳漢杰. 植物保護(hù). 2009(02)
[7]陜西渭北地區(qū)盛果期蘋果樹腐爛病調(diào)查研究[J]. 馬志峰,王榮花,劉文國,康克功,高平文. 北方園藝. 2007(10)
[8]蘋果樹腐爛病菌分生孢子萌發(fā)及其影響條件研究[J]. 臧睿,黃麗麗. 西北農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2007(01)
[9]陜北地區(qū)蘋果樹腐爛病防治建議[J]. 王金友. 西北園藝(果樹). 2006(02)
[10]陜西省關(guān)中地區(qū)蘋果樹腐爛病調(diào)查初報[J]. 王磊,臧睿,黃麗麗,謝芳琴,高小寧. 西北農(nóng)林科技大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2005(S1)
博士論文
[1]中國蘋果樹腐爛病菌的種類:rDNA-ITS序列和表型比較研究[D]. 王旭麗.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2007
碩士論文
[1]蘋果樹腐爛病菌三個果膠酶基因的致病功能研究[D]. 許春景.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2016
[2]蘋果樹腐爛病菌4個多聚半乳糖醛酸酶基因功能的初步研究[D]. 宋娜.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2014
[3]蘋果樹腐爛病菌致病物質(zhì)的初步研究[D]. 王建華.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2012
[4]陜西蘋果樹腐爛病菌不同分離株生物學(xué)特性及致病性研究[D]. 臧睿.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2006
本文編號:3434343
【文章來源】:西北農(nóng)林科技大學(xué)陜西省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:98 頁
【學(xué)位級別】:博士
【部分圖文】:
異三聚體蛋白信號途徑模式(Lietal.2007)
圖2-1基于同源重組的基因敲除和四對引物PCR檢測轉(zhuǎn)化子示意圖Fig.2-1GeneknockoutbyhomologousrecombinationandPCRscreeningoftransformantswithfourpairprimers.2.3.2.2Double-jointPCR方法構(gòu)建敲除載體為了檢驗Gα蛋白的生物學(xué)功能,我們擬生成三個基因Gvm1,Gvm2和Gvm3的敲除突變體。我們使用Double-jointPCR的方法構(gòu)建基因敲除盒(Yuetal.2014)。根據(jù)蘋果黑腐皮殼菌基因組數(shù)據(jù)庫中基因兩側(cè)的基因組DNA序列,分別選取開放閱讀框上游與下游各1kb左右的DNA序列作為同源重組時的上臂和下臂,構(gòu)建基因敲除體系。以03-8基因組DNA為模板分別用引物對Gvm1-1F/Gvm1-2R,Gvm1-3F/Gvm1-4R,Gvm2-1F/Gvm2-2R,Gvm2-3F/Gvm2-4R和Gvm3-1F/Gvm3-2R,Gvm3-3F/Gvm3-4R擴(kuò)出上游片段L1和下游片段L2,以攜帶潮霉素磷酸轉(zhuǎn)移酶基因(hph)的質(zhì)粒PHIG2RHPH2-GFP-GUS為模板用引物HYG-F/HYG-R擴(kuò)增hph基因片段,并膠回收PCR產(chǎn)物。接著用Double-jointPCR方法將3段片段連接在一起,構(gòu)建敲除片段。構(gòu)建好的敲除片段轉(zhuǎn)化進(jìn)入野生型菌株03-8通過同源重組實現(xiàn)基因敲除。2.3.2.3野生型蘋果黑腐皮殼菌原生質(zhì)體的制備和轉(zhuǎn)化(1)將03-8野生型菌株接種到鋪玻璃紙的PDA平板上,25℃培養(yǎng)2d。將菌絲刮成小塊接種到含有100mlYEPD液體培養(yǎng)基的250ml三角瓶中,25℃,110rpm培養(yǎng)36h。(2)用無菌濾布過濾收集菌絲,稱量菌絲并加入酶解液(0.7g菌絲/10ml酶解液)。(3)放置于搖床上30℃,90rpm搖約2-2.5h。(4)顯微鏡下觀察,酶解完成后,上面放兩層擦鏡紙下面放一層無菌濾布過濾酶解混合物到無菌的50ml離心管中,再用1.2M的KCl沖洗,以便將原生質(zhì)體盡可能多的洗下來,用KCl定容至50ml。(5)室溫4500rpm離心10min。(6)棄上清,加入15mlSTCBuffer用移液槍輕微的重新懸浮,4
圖2-2接種位置示意圖Fig.2-2Inoculatelocationdiagram.2.3.8胞內(nèi)cAMP濃度和PKA活性分析收集YEPD搖培3d的菌絲體,液氮冷凍。樣品的cAMP濃度由蘇州科銘生物技術(shù)有限公司采用HPLC方法測定。數(shù)據(jù)分析采用SAS軟件包(SASInstitute,Cary,USA)平均數(shù)差異顯著性t檢驗分析,p<0.05。收集YEPD搖培3d的菌絲體用于PKA活性檢測,液氮研磨0.3g的菌絲樣品。PKA活性檢測使用PepTag非放射性蛋白激酶檢測系統(tǒng)(Promega,Madison,USA)測定。測定樣品用1.2%的瓊脂糖凝膠160V電壓跑15min。紫外透照器檢測。2.4試驗結(jié)果2.4.1G蛋白α亞基序列分析與比較根據(jù)M.oryzaeMagA,MagB和MagCGα亞基蛋白序列分別在蘋果黑腐皮殼菌轉(zhuǎn)錄組和基因組數(shù)據(jù)庫中Blast比對分析,共找到3個異源三聚體G蛋白的Gα亞基,命名為Gvm1(VM1G_00876),Gvm2(VM1G_09956)和Gvm3(VM1G_04248)。Gvm1基因編碼含353個氨基酸的多肽包括3個內(nèi)含子,與稻瘟病菌的MAGB(AF011341)有98.6%的相似性,與粗糙脈孢菌的GNA-1(XP957133)有98.3%的相似性,與釀酒酵母Gpa1(NP011868)有28.5%的相似性。Gvm2基因編碼含357個氨基酸的多肽包括4個內(nèi)含子,與稻瘟病菌的MAGC(AF011342)有82.7%的相似性,與粗糙脈孢菌的GNA-2(Q05424)有81.0%的相似性。Gvm3基因編碼含355個氨基酸的多肽包括5個內(nèi)含子,與稻瘟病菌的MAGA(AF011340)有89.9%的相似性,與粗糙脈孢菌的GNA-3(XP962205)有85.4%的相似性,與釀酒酵母Gpa2(NP010937)有40.1%的相似性(圖2-3A)。不同的異源三聚體G蛋白α亞基的系統(tǒng)發(fā)育樹分為三個組群:組群I,組群II和組21
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]蘋果樹腐爛病菌果膠裂解酶基因Vmpl4的致病功能研究[J]. 許春景,孫迎超,吳玉星,馮浩,高小寧,黃麗麗. 果樹學(xué)報. 2017(01)
[2]蘋果樹腐爛病菌多聚半乳糖醛酸酶基因Vmpg7和Vmpg8的功能[J]. 許春景,吳玉星,戴青青,李正鵬,高小寧,黃麗麗. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2016(08)
[3]陜西渭北地區(qū)蘋果樹腐爛病發(fā)生情況調(diào)查[J]. 李正鵬,高小寧,杜戰(zhàn)濤,胡楊,康振生,黃麗麗. 西北農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2013(01)
[4]蘋果樹腐爛病室內(nèi)快速評價方法的研究[J]. 韋潔玲,黃麗麗,郜佐鵬,柯希望,康振生. 植物病理學(xué)報. 2010(01)
[5]七株植物內(nèi)生放線菌對蘋果樹腐爛病的防治作用[J]. 郜佐鵬,柯希望,韋潔玲,陳銀潮,康振生,黃麗麗. 植物保護(hù)學(xué)報. 2009(05)
[6]中國蘋果樹腐爛病發(fā)生和防治情況調(diào)查[J]. 曹克強(qiáng),國立耘,李保華,孫廣宇,陳漢杰. 植物保護(hù). 2009(02)
[7]陜西渭北地區(qū)盛果期蘋果樹腐爛病調(diào)查研究[J]. 馬志峰,王榮花,劉文國,康克功,高平文. 北方園藝. 2007(10)
[8]蘋果樹腐爛病菌分生孢子萌發(fā)及其影響條件研究[J]. 臧睿,黃麗麗. 西北農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2007(01)
[9]陜北地區(qū)蘋果樹腐爛病防治建議[J]. 王金友. 西北園藝(果樹). 2006(02)
[10]陜西省關(guān)中地區(qū)蘋果樹腐爛病調(diào)查初報[J]. 王磊,臧睿,黃麗麗,謝芳琴,高小寧. 西北農(nóng)林科技大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2005(S1)
博士論文
[1]中國蘋果樹腐爛病菌的種類:rDNA-ITS序列和表型比較研究[D]. 王旭麗.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2007
碩士論文
[1]蘋果樹腐爛病菌三個果膠酶基因的致病功能研究[D]. 許春景.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2016
[2]蘋果樹腐爛病菌4個多聚半乳糖醛酸酶基因功能的初步研究[D]. 宋娜.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2014
[3]蘋果樹腐爛病菌致病物質(zhì)的初步研究[D]. 王建華.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2012
[4]陜西蘋果樹腐爛病菌不同分離株生物學(xué)特性及致病性研究[D]. 臧睿.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2006
本文編號:3434343
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