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FRG3在抗番茄枯萎病過程中的功能研究以及番茄枯萎病病原菌的快速檢測

發(fā)布時間:2021-10-12 11:17
  尖孢鐮刀菌(Fusariumoxysporum)是一類既可以侵染宿主植物又可以在土壤內(nèi)生存的兼性寄生真菌,存在種下分化,具有多種;汀<怄哏)刀菌的寄主范圍非常廣泛,可引起茄科、豆科、瓜類等100多種植物枯萎病的發(fā)生。尖孢鐮刀菌番茄;停‵usarium oxysporf.sp.Lycopersici,FOL,FGSC 9935)導(dǎo)致的番茄枯萎病給全球農(nóng)業(yè)生產(chǎn)造成巨大的經(jīng)濟(jì)損失。目前對于番茄抗枯萎病的研究主要集中在抗性品種的培育等方面,從寄主抗性相關(guān)基因的功能方面的探索番茄抗尖孢鐮刀菌分子機(jī)理的研究還處于初期階段。1 FRG3在抗番茄枯萎病過程中的功能研究NBS-LRR(Nucleotide-binding site-Leucine-reach repeats)類蛋白是植物抗性基因(R)編碼的R蛋白,是植物機(jī)體內(nèi)數(shù)量最多的一類R蛋白家族。本論文以NBS-LRR類抗性基因FRG3為研究對象,分析其在抗番茄枯萎病過程中的功能。(1)本研究利用番茄枯萎病病原菌尖孢鐮刀菌番茄;停‵OL),對具有相似遺傳背景的番茄抗病品系Motelle(Mot)和感病品系Moneymaker(MM)進(jìn)行... 

【文章來源】:揚(yáng)州大學(xué)江蘇省

【文章頁數(shù)】:78 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

FRG3在抗番茄枯萎病過程中的功能研究以及番茄枯萎病病原菌的快速檢測


圖1-1:植物與病原菌互作模式[32]??

灰度分析,尖孢鐮刀菌,侵染,成員


提取根部總RNA,對slmiR482家族的七個成員進(jìn)行miRNANorthem?Blot分析。sRNA??NorthemBlot結(jié)果顯示,FOL侵染后,slmiR482家族的七個成員在兩個番茄品種中都存在??差異表達(dá),這與之前的sRNA-seq結(jié)果不同(圖2-1A)。在FOL侵染條件下,slmiR482a,??slmiR482c?和?slmiR482e-5p?在?MM?和?Mot?中均是下調(diào)表達(dá);slmiR482b,?slmiR482d-3p?和??slmiR482e-3p在Mot中下調(diào)表達(dá),在MM中上調(diào)表達(dá)。然而,sImiR482d-5p呈現(xiàn)出的趨勢??是,在FOL侵染后,在MM中下調(diào)表達(dá),在Mot中上調(diào)表達(dá)(圖2-1B)。這些數(shù)據(jù)結(jié)果??表明,sImiR482家族成員在防御番煎枯萎病過程中起著不同的作用。??基于sRNA-seq和sRNANorthern?Blot的結(jié)果分析,確定的是在病原菌FOL侵染后,??

靶序列,蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域,靶基因


slmiR482家族的每個成員,都預(yù)測到了幾個靶基因。有趣的是,S〇lycl2g099060是??slmiR482d-3p和slmiR482e-3p的共同預(yù)測到的一個靶基因,但在結(jié)合位點(diǎn)上存在2-nt的位??移(圖2-2A)。通過對蛋白結(jié)構(gòu)域的分析表明,Solycl2g099060蛋白是由699-nt組成,一??個含有卷曲螺旋(CC)和P環(huán)結(jié)構(gòu)域的233氨基酸的NBS類抗性蛋白。并且預(yù)測到這兩??個miRNA的靶向位點(diǎn)在P環(huán)結(jié)構(gòu)域上(圖2-2B)。??slmiR482f?-?CCAUACCCUCCUCAQCCUUUCU?-5^?22??FRG3?5f-?GGTATGGGAGGATTAGGCAAAA?-3,?22??-k-k'k-k'k'k-k-k'k-k-k-k?*?*?*?*? ̄k?-k?-k??E??I??0?〇?2??FRG3?—?=|?1?■??i?:_:.i........??i?1?1?1??1?50?100?150?200?233?aa??圖2-2slmiRNA靶基因預(yù)測和蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域分析。??A:?mRNA靶序列和觀向位點(diǎn)的預(yù)測;紅色表示mRNA與相應(yīng)的miRNA的堿基錯配;B:蛋白結(jié)構(gòu)域??的預(yù)測;紅色箭頭表示miRNA在P環(huán)區(qū)域的結(jié)合位點(diǎn)??為了闡明/2家族和Solycl2g099060之間的遺傳同源性,從己知的醋栗番茄的顯性基??因12基因座中分離出6個同源物剛,包括仏/2C-7,?/2C-2,?/2C-3,?/2C4和72匸-5[40]和??本課題組之前報道的4個NBS-LRR抗性基因Solyc08g075630

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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博士論文
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[2]番茄抗晚疫病基因Ph-3的克隆及其效應(yīng)子的篩選[D]. 張春芝.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2014
[3]作物枯萎病生防細(xì)菌的研究[D]. 郝曉娟.浙江大學(xué) 2006



本文編號:3432474

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