華南地區(qū)甘薯病毒病調(diào)查及其分子檢測體系的建立
發(fā)布時(shí)間:2021-10-07 15:07
我國作為世界上最大的甘薯生產(chǎn)國,由于生產(chǎn)上長期采用無性繁殖,甘薯產(chǎn)量和品質(zhì)受到病毒病的嚴(yán)重影響,甚至引起種性退化。種植脫毒種苗是目前防治病毒病提高甘薯產(chǎn)量最有效的措施之一。明確主要的甘薯病毒種類,建立靈敏高效的病毒檢測技術(shù)在培育脫毒種苗中起至關(guān)重要的作用。華南地區(qū)是我國主要的甘薯產(chǎn)區(qū)之一,病毒病對甘薯的危害十分嚴(yán)重。本論文對華南地區(qū)三個(gè)。▍^(qū))十二個(gè)地區(qū)的甘薯病毒病進(jìn)行調(diào)查和樣品采集,運(yùn)用小RNA深度測序技術(shù)和RT-PCR檢測技術(shù)相結(jié)合的方法,鑒定出侵染華南地區(qū)甘薯的主要病毒種類,并建立同步檢測7種甘薯病毒的多重RT-PCR檢測技術(shù),為脫毒甘薯種苗生產(chǎn)奠定技術(shù)基礎(chǔ)。取得以下結(jié)果:1.對華南三省區(qū)12個(gè)甘薯種植區(qū)進(jìn)行了病毒病調(diào)查。結(jié)果表明,各地甘薯均受到病毒病危害,田間病株率為1.6%51.7%不等,癥狀通常表現(xiàn)為褪綠斑點(diǎn)、明脈、皺縮、紫色斑駁、花葉、卷葉等,以褪綠斑點(diǎn)、紫色斑駁為主。2.利用小RNA深度測序技術(shù)鑒定了華南地區(qū)主要甘薯病毒種類。在廣州和湛江地區(qū)的13個(gè)混樣中檢測到9種甘薯病毒,包括7種RNA病毒:甘薯褪綠斑病毒(SPCFV)、甘薯羽狀斑駁病毒(SPF...
【文章來源】:華南農(nóng)業(yè)大學(xué)廣東省
【文章頁數(shù)】:57 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
甘薯樣品采樣地點(diǎn)分布圖
結(jié)果表明,華南各地甘薯均有病毒病發(fā)生,病株率2.0%到50.0%不等,癥狀主要表現(xiàn)為褪綠斑駁、明脈、紫色斑駁、皺縮、畸形和花葉等癥狀,其中以褪綠斑駁最為常見(圖3-1,表3-1)。不同地區(qū)田間甘薯的發(fā)病情況有所差異,其中發(fā)病情況最為嚴(yán)重的為廣東梅州,其次為海南保亭,田間發(fā)病最輕的地區(qū)為廣東惠州?偟膩碇v,在病毒侵染初期,大多數(shù)病株的葉片表現(xiàn)為不典型的褪綠斑或明脈,隨著病程發(fā)展,不同品種癥狀表現(xiàn)有所差異,有的發(fā)展為斑駁花葉、褪綠斑,紫色素較重品種則常表現(xiàn)為紫色環(huán)斑、紫色斑駁。在調(diào)查的各個(gè)地區(qū)中,田間普遍存在褪綠斑點(diǎn)和紫色斑駁的典型癥狀,多數(shù)病株為幾種癥狀混合發(fā)生。圖 3-1 甘薯病毒病田間葉片癥狀圖注:(A):紫斑
電泳結(jié)果表明,從中可檢測出 7 種 RNA 病毒(圖 2A,Lane2-8)和 2 種毒(圖 2B,Lane2-3),PCR 產(chǎn)物測序結(jié)果表明,所獲得的擴(kuò)增產(chǎn)物序列與基因組片段高度同源,核苷酸同一率在 92%至 100%之間。表 3-2 小 RNA 深度測序拼接片段比對病毒種類及基因組覆蓋位點(diǎn)和覆毒種 病毒科 病毒屬 總覆蓋率對應(yīng)病毒同源序列起始位點(diǎn)終止位點(diǎn)weet potato virus G Potyviridae Potyvirus 70.67% 1222 weet potato virus C Potyviridae Potyvirus 62.37% 1962 weet potato latent virus Potyviridae Potyvirus 38.67% 1986 weet potato feathery mottle virus Potyviridae Potyvirus 51.00% 1964 weet potato leafcurl virus Geminiviridae Begomovirus 22.50% 1416 weet potato golden vein virus Geminiviridae Begomovirus 9.77% 580 weet potato chlorotic fleck virus Betaflexiviridae Carlavirus 21.62% 217
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]三種甘薯病毒多重RT-PCR檢測技術(shù)的建立[J]. 蔣素華,程喜梅,宋彩霞,許申平,梁芳,崔波. 植物保護(hù). 2017(01)
[2]甘薯病毒病防控措施研究進(jìn)展與展望[J]. 董芳,張超凡. 作物雜志. 2016(03)
[3]廣西甘薯病毒病的病原病毒種類檢測[J]. 黃利利,Pham Binhdan,何芳練,劉奕君,劉義明,陳保善,廖詠梅. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2016(05)
[4]2014年廣東甘薯產(chǎn)業(yè)發(fā)展形勢與對策建議[J]. 李向偉,萬忠,柯清標(biāo),譚俊. 廣東農(nóng)業(yè)科學(xué). 2015(11)
[5]云南甘薯病毒的檢測及主要病毒的多樣性分析[J]. 包改麗,左瑞娟,饒維力,LI Ru-Hui,李凡. 微生物學(xué)通報(bào). 2013(02)
[6]馬鈴薯Y病毒病的檢測技術(shù)及防治策略[J]. 賈霽,肖啟明,劉劍峰,周志成,劉雙清,唐前君. 園藝與種苗. 2013(01)
[7]葡萄卷葉伴隨病毒4和5簡并引物和多重PCR檢測[J]. 范旭東,董雅鳳,張尊平,任芳,裴光前. 植物保護(hù). 2012(06)
[8]海南省甘薯產(chǎn)業(yè)發(fā)展調(diào)研報(bào)告[J]. 朱紅林,陳健曉,王效寧,孟衛(wèi)東. 熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué). 2012(06)
[9]中國甘薯病毒種類的血清學(xué)和分子檢測[J]. 喬奇,張振臣,張德勝,秦艷紅,田雨婷,王永江. 植物病理學(xué)報(bào). 2012(01)
[10]4種大豆種傳病毒多重RT-PCR檢測[J]. 李孝軍,殷漢華,陳宇,王筱筱,陳峰,葉露飛,楊賽軍. 植物檢疫. 2011(06)
碩士論文
[1]多重PCR檢測三種小麥病毒及小麥黃花葉病毒全基因組序列分析[D]. 魏姣.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[2]西瓜病毒病的田間調(diào)查及多重RT-PCR同步檢測[D]. 王威麟.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2010
[3]三種甘薯病毒多重RT-PCR檢測方法的建立及甘薯脈花葉病毒(SPVMV)的分子鑒定[D]. 張業(yè)輝.河南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009
[4]甘薯莖尖脫毒、快繁技術(shù)及其脫毒苗增產(chǎn)機(jī)理的研究[D]. 蔣明權(quán).安徽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2004
本文編號:3422279
【文章來源】:華南農(nóng)業(yè)大學(xué)廣東省
【文章頁數(shù)】:57 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
甘薯樣品采樣地點(diǎn)分布圖
結(jié)果表明,華南各地甘薯均有病毒病發(fā)生,病株率2.0%到50.0%不等,癥狀主要表現(xiàn)為褪綠斑駁、明脈、紫色斑駁、皺縮、畸形和花葉等癥狀,其中以褪綠斑駁最為常見(圖3-1,表3-1)。不同地區(qū)田間甘薯的發(fā)病情況有所差異,其中發(fā)病情況最為嚴(yán)重的為廣東梅州,其次為海南保亭,田間發(fā)病最輕的地區(qū)為廣東惠州?偟膩碇v,在病毒侵染初期,大多數(shù)病株的葉片表現(xiàn)為不典型的褪綠斑或明脈,隨著病程發(fā)展,不同品種癥狀表現(xiàn)有所差異,有的發(fā)展為斑駁花葉、褪綠斑,紫色素較重品種則常表現(xiàn)為紫色環(huán)斑、紫色斑駁。在調(diào)查的各個(gè)地區(qū)中,田間普遍存在褪綠斑點(diǎn)和紫色斑駁的典型癥狀,多數(shù)病株為幾種癥狀混合發(fā)生。圖 3-1 甘薯病毒病田間葉片癥狀圖注:(A):紫斑
電泳結(jié)果表明,從中可檢測出 7 種 RNA 病毒(圖 2A,Lane2-8)和 2 種毒(圖 2B,Lane2-3),PCR 產(chǎn)物測序結(jié)果表明,所獲得的擴(kuò)增產(chǎn)物序列與基因組片段高度同源,核苷酸同一率在 92%至 100%之間。表 3-2 小 RNA 深度測序拼接片段比對病毒種類及基因組覆蓋位點(diǎn)和覆毒種 病毒科 病毒屬 總覆蓋率對應(yīng)病毒同源序列起始位點(diǎn)終止位點(diǎn)weet potato virus G Potyviridae Potyvirus 70.67% 1222 weet potato virus C Potyviridae Potyvirus 62.37% 1962 weet potato latent virus Potyviridae Potyvirus 38.67% 1986 weet potato feathery mottle virus Potyviridae Potyvirus 51.00% 1964 weet potato leafcurl virus Geminiviridae Begomovirus 22.50% 1416 weet potato golden vein virus Geminiviridae Begomovirus 9.77% 580 weet potato chlorotic fleck virus Betaflexiviridae Carlavirus 21.62% 217
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]三種甘薯病毒多重RT-PCR檢測技術(shù)的建立[J]. 蔣素華,程喜梅,宋彩霞,許申平,梁芳,崔波. 植物保護(hù). 2017(01)
[2]甘薯病毒病防控措施研究進(jìn)展與展望[J]. 董芳,張超凡. 作物雜志. 2016(03)
[3]廣西甘薯病毒病的病原病毒種類檢測[J]. 黃利利,Pham Binhdan,何芳練,劉奕君,劉義明,陳保善,廖詠梅. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2016(05)
[4]2014年廣東甘薯產(chǎn)業(yè)發(fā)展形勢與對策建議[J]. 李向偉,萬忠,柯清標(biāo),譚俊. 廣東農(nóng)業(yè)科學(xué). 2015(11)
[5]云南甘薯病毒的檢測及主要病毒的多樣性分析[J]. 包改麗,左瑞娟,饒維力,LI Ru-Hui,李凡. 微生物學(xué)通報(bào). 2013(02)
[6]馬鈴薯Y病毒病的檢測技術(shù)及防治策略[J]. 賈霽,肖啟明,劉劍峰,周志成,劉雙清,唐前君. 園藝與種苗. 2013(01)
[7]葡萄卷葉伴隨病毒4和5簡并引物和多重PCR檢測[J]. 范旭東,董雅鳳,張尊平,任芳,裴光前. 植物保護(hù). 2012(06)
[8]海南省甘薯產(chǎn)業(yè)發(fā)展調(diào)研報(bào)告[J]. 朱紅林,陳健曉,王效寧,孟衛(wèi)東. 熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué). 2012(06)
[9]中國甘薯病毒種類的血清學(xué)和分子檢測[J]. 喬奇,張振臣,張德勝,秦艷紅,田雨婷,王永江. 植物病理學(xué)報(bào). 2012(01)
[10]4種大豆種傳病毒多重RT-PCR檢測[J]. 李孝軍,殷漢華,陳宇,王筱筱,陳峰,葉露飛,楊賽軍. 植物檢疫. 2011(06)
碩士論文
[1]多重PCR檢測三種小麥病毒及小麥黃花葉病毒全基因組序列分析[D]. 魏姣.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[2]西瓜病毒病的田間調(diào)查及多重RT-PCR同步檢測[D]. 王威麟.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2010
[3]三種甘薯病毒多重RT-PCR檢測方法的建立及甘薯脈花葉病毒(SPVMV)的分子鑒定[D]. 張業(yè)輝.河南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009
[4]甘薯莖尖脫毒、快繁技術(shù)及其脫毒苗增產(chǎn)機(jī)理的研究[D]. 蔣明權(quán).安徽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2004
本文編號:3422279
本文鏈接:http://sikaile.net/nykjlw/dzwbhlw/3422279.html
最近更新
教材專著