水稻黑條矮縮病毒（Rice black streaked dwarf virus,RBSDV）引起的玉米粗縮病是我國玉米生產(chǎn)中的一類重要病害,嚴(yán)重威脅我國玉米生產(chǎn)。MicroRNA（miRNA）是一類內(nèi)源的小分子非編碼RNA,作為真核生物基因表達(dá)中的一類調(diào)控因子,在抵御病毒入侵方面起著非常重要的作用。本研究通過對不同抗性玉米品種人工接種RBSDV,構(gòu)建莖稈及葉片miRNA文庫共8個。利用高通量測序,共獲得150個已知miRNA前體序列和474個新miRNA序列。miRNA差異表達(dá)分析表明,兩品種間葉片組織中表達(dá)趨勢相反的miRNA有17個,莖稈組織中表達(dá)趨勢相反的miRNA有10個。對差異表達(dá)的miRNA進(jìn)行靶基因預(yù)測,共得到1 870個靶標(biāo)基因,通過KEGG和GO富集分析,得出差異表達(dá)miRNA的表達(dá)模式。本試驗為玉米抗粗縮病分子機(jī)理研究奠定了基礎(chǔ)。 

【文章來源】：山東農(nóng)業(yè)科學(xué). 2020,52(10)

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【部分圖文】：

miRNA序列的長度分布

miRNA中不同位置具有堿基偏好性，圖2為不同長度的miRNA 5"端首位堿基的出現(xiàn)頻率。結(jié)果表明，長度18～22 nt和25 nt的miRNA 5"端堿基以U居多，長度23 nt和24 nt的miRNA 5"端堿基以A居多。2.3 miRNA注釋與新miRNA預(yù)測

靶基因GO富集分析(圖3)表明，差異表達(dá)miRNA靶基因的生物過程主要集中在生物轉(zhuǎn)錄、轉(zhuǎn)錄調(diào)控、DNA復(fù)制等;細(xì)胞組成主要涉及細(xì)胞核內(nèi)過程、質(zhì)膜運輸、細(xì)胞質(zhì)等;分子功能主要涉及DNA結(jié)合、ATP結(jié)合、蛋白結(jié)合等。靶基因KEGG通路分析(圖4)表明，差異表達(dá)miRNA的靶基因主要富集在半胱氨酸和蛋氨酸代謝、氧化磷酸化、泛素介導(dǎo)的蛋白水解及苯丙氨酸、酪氨酸和色氨酸的生物合成、維生素B6代謝、吞噬體等通路。


本文編號：3409196