基于交互度的層次聚類算法在紫莖澤蘭種群基因流中應(yīng)用與研究
發(fā)布時間:2021-09-23 15:00
同種或不同種的生物種群之間存在基因的交流,這種交流是指某一生物種群的遺傳信息從該種群流向其他種群的過程。基因流可以揭示生物種群之間的親緣關(guān)系,計算種群的傳播速度、傳播距離、定居過程以及預(yù)測種群未來的擴散趨勢等。目前,在生物學(xué)領(lǐng)域?qū)蛄鞯难芯糠椒ū容^單一。Structure模型聚類是該領(lǐng)域中使用頻率最高的一種研究方法,該方法是基于K-means算法的一種聚類算法。聚類開始前需要計算△K來預(yù)算所聚類的個數(shù)。然而在實際應(yīng)用中,△K的值與所聚類的結(jié)果往往存在差異。在對聚類的結(jié)果分析時,并不能保證所聚類結(jié)果在生物學(xué)領(lǐng)域中的表達是否準確、合理。因此,本文提出基于交互度的層次聚類算法,并應(yīng)用于基因流的研究,與Structure模型聚類算法相對比分析兩種算法之間的優(yōu)略。紫莖澤蘭是極具危害性的惡性雜草,屬于入侵生物。20世紀40年代由中緬邊境傳入中國云南南部。紫莖澤蘭的入侵趨勢和危害性日益嚴峻,嚴重影響和破壞當(dāng)?shù)氐娜诵蠼】岛娃r(nóng)林業(yè)、畜牧業(yè)的發(fā)展。僅云南省危害發(fā)生的總面積已達6.4萬km2,給西南地區(qū)帶來了巨大的經(jīng)濟損失。選擇云南怒江河谷北段中紫莖澤蘭的12個母本種群和子代種群個體的基因位點為數(shù)據(jù)樣本。...
【文章來源】:云南大學(xué)云南省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:54 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖3:交互度示例一??
圖5:簇之間的交互度??
圖6:存在無交互頂點的簇之間的交互度??
【參考文獻】:
期刊論文
[1]基于交互相似度的細粒度社群發(fā)掘方法[J]. 張星,於志文,梁韻基,郭斌. 計算機科學(xué). 2014(04)
[2]層次聚類社區(qū)發(fā)現(xiàn)算法的研究[J]. 龔尚福,陳婉璐,賈澎濤. 計算機應(yīng)用研究. 2013(11)
[3]聚類分析研究中的若干問題[J]. 王駿,王士同,鄧趙紅. 控制與決策. 2012(03)
[4]外來植物紫莖澤蘭的入侵機理與控制策略研究進展[J]. 萬方浩,劉萬學(xué),郭建英,強勝,李保平,王進軍,楊國慶,牛紅榜,桂富榮,黃文坤,蔣智林,王文琪. 中國科學(xué):生命科學(xué). 2011(01)
[5]層次聚類算法的有效性研究[J]. 胡曉慶,馬儒寧,鐘寶江. 山東大學(xué)學(xué)報(工學(xué)版). 2010(05)
[6]遺傳多樣性研究進展[J]. 馬靜,安永平,王彩芬,張文銀. 陜西農(nóng)業(yè)科學(xué). 2010(01)
[7]紫莖澤蘭的危害及其綜合利用進展分析[J]. 尹芳,黃梅,徐銳,劉士清,李建昌,陳玉保,張無敵. 災(zāi)害學(xué). 2009(04)
[8]改進層次聚類算法在文獻分析中的應(yīng)用[J]. 陳旭玲,樓佩煌. 數(shù)值計算與計算機應(yīng)用. 2009(04)
[9]惡性外來入侵植物紫莖澤蘭在云南的分布格局[J]. 肖正清,周冠華,權(quán)文婷. 自然災(zāi)害學(xué)報. 2009(05)
[10]層次聚類算法的改進及分析[J]. 郭曉娟,劉曉霞,李曉玲. 計算機應(yīng)用與軟件. 2008(06)
碩士論文
[1]層次聚類算法的研究及應(yīng)用[D]. 段明秀.中南大學(xué) 2009
本文編號:3405918
【文章來源】:云南大學(xué)云南省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:54 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖3:交互度示例一??
圖5:簇之間的交互度??
圖6:存在無交互頂點的簇之間的交互度??
【參考文獻】:
期刊論文
[1]基于交互相似度的細粒度社群發(fā)掘方法[J]. 張星,於志文,梁韻基,郭斌. 計算機科學(xué). 2014(04)
[2]層次聚類社區(qū)發(fā)現(xiàn)算法的研究[J]. 龔尚福,陳婉璐,賈澎濤. 計算機應(yīng)用研究. 2013(11)
[3]聚類分析研究中的若干問題[J]. 王駿,王士同,鄧趙紅. 控制與決策. 2012(03)
[4]外來植物紫莖澤蘭的入侵機理與控制策略研究進展[J]. 萬方浩,劉萬學(xué),郭建英,強勝,李保平,王進軍,楊國慶,牛紅榜,桂富榮,黃文坤,蔣智林,王文琪. 中國科學(xué):生命科學(xué). 2011(01)
[5]層次聚類算法的有效性研究[J]. 胡曉慶,馬儒寧,鐘寶江. 山東大學(xué)學(xué)報(工學(xué)版). 2010(05)
[6]遺傳多樣性研究進展[J]. 馬靜,安永平,王彩芬,張文銀. 陜西農(nóng)業(yè)科學(xué). 2010(01)
[7]紫莖澤蘭的危害及其綜合利用進展分析[J]. 尹芳,黃梅,徐銳,劉士清,李建昌,陳玉保,張無敵. 災(zāi)害學(xué). 2009(04)
[8]改進層次聚類算法在文獻分析中的應(yīng)用[J]. 陳旭玲,樓佩煌. 數(shù)值計算與計算機應(yīng)用. 2009(04)
[9]惡性外來入侵植物紫莖澤蘭在云南的分布格局[J]. 肖正清,周冠華,權(quán)文婷. 自然災(zāi)害學(xué)報. 2009(05)
[10]層次聚類算法的改進及分析[J]. 郭曉娟,劉曉霞,李曉玲. 計算機應(yīng)用與軟件. 2008(06)
碩士論文
[1]層次聚類算法的研究及應(yīng)用[D]. 段明秀.中南大學(xué) 2009
本文編號:3405918
本文鏈接:http://sikaile.net/nykjlw/dzwbhlw/3405918.html
最近更新
教材專著