本實(shí)驗(yàn)從污染的黑曲霉平板上分離到一株菌,該菌對黑曲霉有很強(qiáng)抑制效果。通過平板對峙法和牛津杯法檢測到了該菌的發(fā)酵液對各種植物病原菌如立枯絲核菌和水稻黃單胞菌等有很明顯的抑制效果。由此可知該菌在農(nóng)業(yè)植物病防治和水果保藏方面有重要的應(yīng)用價(jià)值。為進(jìn)一步了解該菌,本論文通過分類學(xué)、生物信息學(xué)、分離純化和初步鑒定等技術(shù)對該菌進(jìn)行了闡述,其研究內(nèi)容如下:1.從基因型特征上,確定了所分離獲得的菌株YL1為Bacillus velezensis。16S rDNA序列比對結(jié)果顯示:其與Bacillus velezensis CR-502相似度為99.85%。通過基因組中平均核苷酸一致性（ANI）比對發(fā)現(xiàn):該菌株與Bacillus velezensis CR-502同源性為98.29%,確定該菌株與Bacillus velezensis CR-502為同一個(gè)種。由于菌株不同,將此菌株命名為Bacillus velezensis YL1。2.獲得Bacillus velezensis YL1全基因序列并預(yù)測其可能產(chǎn)生的抗生素。通過第二代基因組測序拼接獲得該菌株的基因組草圖,然后利用antismash網(wǎng)站對基因... 

【文章來源】：華中農(nóng)業(yè)大學(xué)湖北省 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：71 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

非核糖體合成肽類抗生素以及合成的NRPSs的基因結(jié)構(gòu)

R 克隆 16S rRNA 后跑瓊脂糖 DNAMarker，條帶位于 100ose gel detection result of 16Sarker 條帶對比可知，其片段rRNA 長度范圍內(nèi)。然后對目常會有兩端測不準(zhǔn)的情況，，轉(zhuǎn)化至 E. Coli DH5α菌株的 16S rRNA 全長為 1,393 bpzTaxon server 對所測得的 16株 YL116S rRNA 序列比對

度來進(jìn)行分類的方法，即 ANI 相似度在 96％以上時(shí)被認(rèn)為是同一種菌。如表 3.示，這株菌YL1與Bacillus velezensis CR-502同源性為98.29％且與Bacillus velezeCR-502 相似度為 99.85％，即可以確定株菌 YL1 與 Bacillus velezensis CR-502 為胞桿菌屬的同一個(gè)種。由于菌株不一樣，因此將株菌 YL1 命名為 Bacillus velezeYL1。3.1.3 形態(tài)學(xué)特征Bacillus velezensis YL1 菌株在 LB 平板上劃線生長 24h 即可看到單菌落，直3mm 左右，表面粗糙，中間凹陷，邊緣有褶皺，菌落不透明白色，與枯草芽胞桿菌落形態(tài)具有相似的特征。其單細(xì)胞通過戊二醛固定，通過掃描電鏡放大 10 倍，測結(jié)構(gòu)如圖 3.3 所示。

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]白菜黑斑病拮抗細(xì)菌Bacillus velezensis DL-59的篩選鑒定及田間防效實(shí)驗(yàn)[J]. 杜淑濤,李術(shù)娜,朱寶成.  河北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2010(06)
[2]番茄灰霉病拮抗細(xì)菌的篩選與X-75菌株鑒定[J]. 王偉,李術(shù)娜,李紅亞,郝志敏,王全,王樹香,朱寶成.  園藝學(xué)報(bào). 2010(02)
[3]生防枯草芽孢桿菌的研究進(jìn)展[J]. 李晶,楊謙.  安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2008(01)
[4]微生物菌種對大慶原油的降解作用[J]. 伍曉林,侯兆偉,陳堅(jiān),倫世儀.  大慶石油學(xué)院學(xué)報(bào). 2004(06)



本文編號：3385177