本實(shí)驗(yàn)從污染的黑曲霉平板上分離到一株菌,該菌對(duì)黑曲霉有很強(qiáng)抑制效果。通過(guò)平板對(duì)峙法和牛津杯法檢測(cè)到了該菌的發(fā)酵液對(duì)各種植物病原菌如立枯絲核菌和水稻黃單胞菌等有很明顯的抑制效果。由此可知該菌在農(nóng)業(yè)植物病防治和水果保藏方面有重要的應(yīng)用價(jià)值。為進(jìn)一步了解該菌,本論文通過(guò)分類(lèi)學(xué)、生物信息學(xué)、分離純化和初步鑒定等技術(shù)對(duì)該菌進(jìn)行了闡述,其研究?jī)?nèi)容如下:1.從基因型特征上,確定了所分離獲得的菌株YL1為Bacillus velezensis。16S rDNA序列比對(duì)結(jié)果顯示:其與Bacillus velezensis CR-502相似度為99.85%。通過(guò)基因組中平均核苷酸一致性（ANI）比對(duì)發(fā)現(xiàn):該菌株與Bacillus velezensis CR-502同源性為98.29%,確定該菌株與Bacillus velezensis CR-502為同一個(gè)種。由于菌株不同,將此菌株命名為Bacillus velezensis YL1。2.獲得Bacillus velezensis YL1全基因序列并預(yù)測(cè)其可能產(chǎn)生的抗生素。通過(guò)第二代基因組測(cè)序拼接獲得該菌株的基因組草圖,然后利用antismash網(wǎng)站對(duì)基因... 

【文章來(lái)源】：華中農(nóng)業(yè)大學(xué)湖北省 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁(yè)數(shù)】：71 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

非核糖體合成肽類(lèi)抗生素以及合成的NRPSs的基因結(jié)構(gòu)

R 克隆 16S rRNA 后跑瓊脂糖 DNAMarker，條帶位于 100ose gel detection result of 16Sarker 條帶對(duì)比可知，其片段rRNA 長(zhǎng)度范圍內(nèi)。然后對(duì)目常會(huì)有兩端測(cè)不準(zhǔn)的情況，，轉(zhuǎn)化至 E. Coli DH5α菌株的 16S rRNA 全長(zhǎng)為 1,393 bpzTaxon server 對(duì)所測(cè)得的 16株 YL116S rRNA 序列比對(duì)

度來(lái)進(jìn)行分類(lèi)的方法，即 ANI 相似度在 96％以上時(shí)被認(rèn)為是同一種菌。如表 3.示，這株菌YL1與Bacillus velezensis CR-502同源性為98.29％且與Bacillus velezeCR-502 相似度為 99.85％，即可以確定株菌 YL1 與 Bacillus velezensis CR-502 為胞桿菌屬的同一個(gè)種。由于菌株不一樣，因此將株菌 YL1 命名為 Bacillus velezeYL1。3.1.3 形態(tài)學(xué)特征Bacillus velezensis YL1 菌株在 LB 平板上劃線生長(zhǎng) 24h 即可看到單菌落，直3mm 左右，表面粗糙，中間凹陷，邊緣有褶皺，菌落不透明白色，與枯草芽胞桿菌落形態(tài)具有相似的特征。其單細(xì)胞通過(guò)戊二醛固定，通過(guò)掃描電鏡放大 10 倍，測(cè)結(jié)構(gòu)如圖 3.3 所示。

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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[2]番茄灰霉病拮抗細(xì)菌的篩選與X-75菌株鑒定[J]. 王偉,李術(shù)娜,李紅亞,郝志敏,王全,王樹(shù)香,朱寶成.  園藝學(xué)報(bào). 2010(02)
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