大豆脈壞死病毒（soybean vein necrosis virus,SVNV）在北美大豆種植區(qū)大范圍流行,我國尚無該病毒報道。本研究通過RT-PCR、DAS-ELISA以及序列比對分析等方法,在一批美國進口大豆中檢出SVNV。這是全國口岸首次截獲SVNV。 

【文章來源】：植物檢疫. 2020,34(05)北大核心

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【部分圖文】：

一步法RT-PCR擴增結(jié)果

測序結(jié)果表明，SV-8726的SVNV-NP-f/SVNV-NP-r擴增片段大小為239 bp,SVNV-F/SVNV-R擴增片段為699 bp（圖2）。通過NCBI Blastn比對，SVNV-NP-f/SVNV-NP-r片段與SVNV NP基因序列（MH029494.1）相似性最高，兩者相差4個堿基，序列相似度為99.16%。SVNV-F/SVNV-R片段與SVNV NP基因序列（KJ955719.1）相似性最高，兩者相差5個堿基，序列相似度為99.28%，確定SV-8726為SVNV。以SVNV-F/SVNV-R擴增序列構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹（圖3），結(jié)果顯示本次在美國大豆中檢出的SV-8726與GenBank中SVNV獨自聚為一支，其相似度達(dá)98.14%～99.28%；與同屬其他病毒相似度相對較低，其中與BeNMV(JN587268.1）相似度為71.43%,TCSV(AF413110.1）為77.03%,TSWV(MF326511.1）為73.81%，而與其他屬病毒關(guān)系較遠(yuǎn)，進一步表明SV-8726為SVNV。圖3 基于SVNV NP序列構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹

基于SVNV NP序列構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]美國進口大豆中菜豆莢斑駁病毒和玉米褪綠斑駁病毒的檢疫鑒定[J]. 柳吉芹,王立杉,吳曦,錢云開,高飛,王海洋.  植物檢疫. 2019(03)
[2]小麥線條花葉病毒研究進展[J]. 王佳瑩,崔俊霞,張吉紅,陳先鋒,黃素文.  植物檢疫. 2018(03)



本文編號：3355063