棉花黃萎病是一種土傳性真菌維管束病害,嚴(yán)重影響棉花的產(chǎn)量和纖維品質(zhì),現(xiàn)已成為限制棉花高產(chǎn)、穩(wěn)產(chǎn)的主要障礙之一。在我國(guó),棉花黃萎病的病原菌主要為大麗輪枝菌,其致病機(jī)理十分復(fù)雜。深入挖掘大麗輪枝菌致病相關(guān)基因,對(duì)于揭示其致病機(jī)理、防治棉花黃萎病具有重要意義。本研究運(yùn)用轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)比較分析了強(qiáng)致病力大麗輪枝菌Vd991在侵染陸地棉品種Coker312早期階段的基因表達(dá)情況。通過差異表達(dá)分析、基因功能Gene ontology,GO)注釋、GO富集分析、代謝與調(diào)控通路分析等方法篩選候選致病相關(guān)基因;在此基礎(chǔ)上,通過基因敲除技術(shù)對(duì)候選致病相關(guān)基因進(jìn)行功能鑒定。本研究的主要結(jié)果及結(jié)論如下:一、致病候選基因的篩選1)差異表達(dá)分析及GO注釋與分類:比較分析強(qiáng)致病力大麗輪枝菌Vd991侵染Coker312前后的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),獲得979個(gè)差異表達(dá)基因（Differentially expressed genes,DEGs）,其中376個(gè)上調(diào),603個(gè)下調(diào)。GO注釋和分類結(jié)果表明,這些DEGs涉及廣泛的功能或生物學(xué)過程,包括細(xì)胞增殖與生長(zhǎng)、產(chǎn)孢、碳水化合物結(jié)合、蛋白激酶活性調(diào)節(jié)、裂解酶活性、水解酶活性等;在... 

【文章來源】：上海交通大學(xué)上海市 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：83 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

大麗輪枝菌孢子形態(tài)及棉花黃萎病病癥[8]

Fig.1-病的發(fā)生與大田圖 1-2 大麗輪枝菌的的侵染循環(huán)2 The infection cycle of Verticillium dahliae防治

圖 1-3在植物細(xì)胞核中，HIGS結(jié)構(gòu)），隨后被轉(zhuǎn)運(yùn)至細(xì)胞質(zhì)中。 21nt 的 ds RNA 分子從植物細(xì)胞中導(dǎo)出Fig.1-3 Technical principle of HIGS to control plant diseases and insect pestsIn the nucleus of plant cell,transcriptscessed into 21 nt dsRNA molecules by Dicer (B利用 HIGS 技術(shù)防治植物病蟲害的原理[17]的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物dsRNA被Dicer酶加工后與轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白在細(xì)胞質(zhì)中被 Dicer 酶進(jìn)一步加工成 21 nt 的 ds后被病原菌攝入，導(dǎo)致病原菌致病基因的of the host-induced gene silencing (HIGS) construc1,B2,B3).HIGS ds RNA molecules are expExp.5結(jié)合（RNA 分子（B沉默（B

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]高毒力大麗輪枝菌VDG1特異分泌蛋白HSSP致病相關(guān)功能分析[J]. 徐明,陳捷胤,馬雪峰,王新艷,郭維,戴小楓.  棉花學(xué)報(bào). 2015(04)
[2]棉花黃萎病菌VdSge1基因的敲除與功能分析[J]. 高云,孟佩,張婷,黃家風(fēng),高峰.  棉花學(xué)報(bào). 2015(04)
[3]大麗輪枝菌微菌核的萌發(fā)條件及致死溫度[J]. 商文靜,陳婷,白應(yīng)文,楊家榮,胡小平.  菌物學(xué)報(bào). 2013(06)
[4]棉花抗黃萎病機(jī)制研究進(jìn)展[J]. 徐理,朱龍付,張獻(xiàn)龍.  作物學(xué)報(bào). 2012(09)
[5]棉花黃萎病病癥識(shí)別及其發(fā)生規(guī)律[J]. 張衛(wèi)國(guó),張庭軍.  新疆農(nóng)墾科技. 2012(06)
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[7]轉(zhuǎn)錄組研究新技術(shù):RNA-Seq及其應(yīng)用[J]. 祁云霞,劉永斌,榮威恒.  遺傳. 2011(11)
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博士論文
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[2]黑腐皮殼侵染蘋果的組織細(xì)胞學(xué)及轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究[D]. 柯希望.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2013
[3]我國(guó)棉花黃萎病菌的致病力分化及致病相關(guān)基因的克隆與分析[D]. 朱荷琴.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2013
[4]大麗輪枝菌不同毒力菌株全基因組測(cè)序及重測(cè)序分析[D]. 陳相永.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2012
[5]大麗輪枝菌基因敲除體系的建立及分泌蛋白初步分析[D]. 田李.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2011

碩士論文
[1]高毒力大麗輪枝菌特異分泌蛋白基因VdSSP1的克隆和功能初步分析[D]. 柳少燕.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2013
[2]農(nóng)桿菌介導(dǎo)的大麗輪枝菌的遺傳轉(zhuǎn)化[D]. 韓紹輝.河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009
[3]VD-toxin作用下擬南芥懸浮細(xì)胞微絲骨架和核仁的變化[D]. 袁海永.中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué) 2005



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