煙草叢頂病毒不依賴帽子翻譯機(jī)制的RNA結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)與分子進(jìn)化
發(fā)布時(shí)間：2021-08-14 18:24
煙草叢頂病毒（Tobacco bushy top virus,TBTV）屬于番茄叢矮病毒科幽影病毒屬,基因組由一條正義單鏈RNA（+ssRNA）組成,全長(zhǎng)約4,152 nt。5’端缺乏帽子結(jié)構(gòu)（m7GPPPN）,3’末端也不帶poly（A）尾,編碼4個(gè)ORF,包括復(fù)制酶組分p35蛋白及其-1位移碼產(chǎn)物p98蛋白（RNA依賴RNA聚合酶,RdRp）,運(yùn)動(dòng)蛋白p26和p27。前人研究表明,TBTV基因組的3’UTR含有不依賴帽子翻譯元件BTE,可以調(diào)控報(bào)告基因的表達(dá)。本文分析了BTE在全長(zhǎng)TBTV中對(duì)p35蛋白翻譯的調(diào)控作用以及對(duì)TBTV在BY-2原生質(zhì)體中的RNA積累的作用。另外從中國(guó)云南地區(qū)克隆了3個(gè)新的TBTV弱毒分離物,發(fā)現(xiàn)其p35表達(dá)量相對(duì)于野生型（TBTV-Ch）明顯降低,且p35表達(dá)量降低與BTE元件的結(jié)構(gòu)變異相關(guān)。利用體外翻譯系統(tǒng)WGE,以TBTV基因組全長(zhǎng)RNA為材料全面分析其不依賴帽子翻譯,發(fā)現(xiàn)TBTV基因組中除BTE外還存在至少1種類型的不依賴帽子翻譯元件。具體結(jié)果如下:（1）TBTV全基因組克隆及分子進(jìn)化:通過5’RACE和3’RACE結(jié)合一步RT-PCR的方法,克...
【文章來源】：山東農(nóng)業(yè)大學(xué)山東省
【文章頁數(shù)】：115 頁
【學(xué)位級(jí)別】：博士
【部分圖文】：
真核細(xì)胞mRNA翻譯模式圖（Jacksonetal.,2005；Dresiosetal.,2006；Deforgesetal.,2015）
山東農(nóng)業(yè)大學(xué)博士學(xué)位論文僅可以與 eIF4F 互作，還和 5’UTR 存在遠(yuǎn)距離的 RNA-RNA 互作，將 eIF4F 傳遞到 5’末端以高效的起始翻譯（Nicholson et al., 2010）。玉米壞死條紋病毒的 5’端也會(huì)形成類似 TBSV 5’端形成的 T 型結(jié)構(gòu)域，并且和其不依賴帽子翻譯調(diào)控元件（I-Shape結(jié)構(gòu)）存在遠(yuǎn)距離的RNA-RNA互作（Miller et al., 2007）。
圖 1-3 結(jié)構(gòu)分析原理圖（Soukup and Breaker, 2009；Wilkinsone et al., 2006；Smola et al., 2015）A. 分子內(nèi)轉(zhuǎn)酯反應(yīng)；B. NMIA 修飾后形成穩(wěn)定的復(fù)合物Fig. 1-3 Principle of the structural probing.A. Transesterification of nucleotides; B. NMIA reacts preferentially with the 2'-hydroxyl group in flexible nucleotides toform a stable 2'-O-ester adduct1.5 煙草叢頂病毒的研究進(jìn)展煙草叢頂病是近年來我國(guó)云南西部煙區(qū)頻繁爆發(fā)流行的一種煙草病害（李凡等，2001），感病煙株葉色淡綠或黃化，并伴有系統(tǒng)壞死枯斑或壞死線紋，苗期感病煙株嚴(yán)重矮化、縮頂，晚期感病煙株腋芽過度增生。煙草叢頂病最早發(fā)生在津巴布韋，對(duì)該國(guó)的煙草生產(chǎn)造成了嚴(yán)重威脅（Ndowora et al., 2002）。另外，煙草叢頂病還引起了幾次大規(guī)模的損失，包括 1960 年在非洲南部國(guó)家（Gates et al., 1962）和 1990 年在中國(guó)云南省的大爆發(fā)（Chen et al., 2006）。從 1993 到 2001 年間，煙草從頂病造成我國(guó)云南煙區(qū)的 51,300 公頃煙草感染病害，直接經(jīng)濟(jì)損失近千萬（Mo et al., 2003）。
【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]2種類型的煙草扭脈病毒外殼蛋白基因的序列和結(jié)構(gòu)分析[J]. 張振甲,王德亞,于成明,王增輝,師科榮,李凡,原雪峰. 植物病理學(xué)報(bào). 2016(02)
[2]煙草叢頂病毒ORF1蛋白的多克隆抗體制備及應(yīng)用[J]. 王國(guó)魯,王德亞,于成明,原雪峰. 植物病理學(xué)報(bào). 2016(01)
[3]煙草叢頂病穴TBTV雪傳毒特性及寄主范圍研究[J]. 段玉琪,秦西云,莫笑晗,王曉云,譚仲夏. 中國(guó)煙草科學(xué). 2003(04)
[4]云南煙草叢枝癥病害初步研究[J]. 李凡,周雪平,蔡紅,陳海如,李德葆. 植物病理學(xué)報(bào). 2001(04)
本文編號(hào)：3342962
【文章來源】：山東農(nóng)業(yè)大學(xué)山東省
【文章頁數(shù)】：115 頁
【學(xué)位級(jí)別】：博士
【部分圖文】：
真核細(xì)胞mRNA翻譯模式圖（Jacksonetal.,2005；Dresiosetal.,2006；Deforgesetal.,2015）
山東農(nóng)業(yè)大學(xué)博士學(xué)位論文僅可以與 eIF4F 互作，還和 5’UTR 存在遠(yuǎn)距離的 RNA-RNA 互作，將 eIF4F 傳遞到 5’末端以高效的起始翻譯（Nicholson et al., 2010）。玉米壞死條紋病毒的 5’端也會(huì)形成類似 TBSV 5’端形成的 T 型結(jié)構(gòu)域，并且和其不依賴帽子翻譯調(diào)控元件（I-Shape結(jié)構(gòu)）存在遠(yuǎn)距離的RNA-RNA互作（Miller et al., 2007）。
圖 1-3 結(jié)構(gòu)分析原理圖（Soukup and Breaker, 2009；Wilkinsone et al., 2006；Smola et al., 2015）A. 分子內(nèi)轉(zhuǎn)酯反應(yīng)；B. NMIA 修飾后形成穩(wěn)定的復(fù)合物Fig. 1-3 Principle of the structural probing.A. Transesterification of nucleotides; B. NMIA reacts preferentially with the 2'-hydroxyl group in flexible nucleotides toform a stable 2'-O-ester adduct1.5 煙草叢頂病毒的研究進(jìn)展煙草叢頂病是近年來我國(guó)云南西部煙區(qū)頻繁爆發(fā)流行的一種煙草病害（李凡等，2001），感病煙株葉色淡綠或黃化，并伴有系統(tǒng)壞死枯斑或壞死線紋，苗期感病煙株嚴(yán)重矮化、縮頂，晚期感病煙株腋芽過度增生。煙草叢頂病最早發(fā)生在津巴布韋，對(duì)該國(guó)的煙草生產(chǎn)造成了嚴(yán)重威脅（Ndowora et al., 2002）。另外，煙草叢頂病還引起了幾次大規(guī)模的損失，包括 1960 年在非洲南部國(guó)家（Gates et al., 1962）和 1990 年在中國(guó)云南省的大爆發(fā)（Chen et al., 2006）。從 1993 到 2001 年間，煙草從頂病造成我國(guó)云南煙區(qū)的 51,300 公頃煙草感染病害，直接經(jīng)濟(jì)損失近千萬（Mo et al., 2003）。
【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]2種類型的煙草扭脈病毒外殼蛋白基因的序列和結(jié)構(gòu)分析[J]. 張振甲,王德亞,于成明,王增輝,師科榮,李凡,原雪峰. 植物病理學(xué)報(bào). 2016(02)
[2]煙草叢頂病毒ORF1蛋白的多克隆抗體制備及應(yīng)用[J]. 王國(guó)魯,王德亞,于成明,原雪峰. 植物病理學(xué)報(bào). 2016(01)
[3]煙草叢頂病穴TBTV雪傳毒特性及寄主范圍研究[J]. 段玉琪,秦西云,莫笑晗,王曉云,譚仲夏. 中國(guó)煙草科學(xué). 2003(04)
[4]云南煙草叢枝癥病害初步研究[J]. 李凡,周雪平,蔡紅,陳海如,李德葆. 植物病理學(xué)報(bào). 2001(04)
本文編號(hào)：3342962
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