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水稻白葉枯病菌Ⅲ型分泌系統(tǒng)轉(zhuǎn)位子的鑒定與效應(yīng)因子XopN功能的研究

發(fā)布時間:2021-08-13 12:37
  水稻白葉枯病菌Xoo(Xanthomonas oryzfae pv.oryzae,Xoo)能利用Ⅲ型分泌系統(tǒng)T3SS(Typethreesecretionsyetem)向細胞外分泌效應(yīng)因子,從而表現(xiàn)出水稻白葉枯病菌的毒性。轉(zhuǎn)位子是Ⅲ型分泌系統(tǒng)的重要組分,位于Ⅲ型分泌系統(tǒng)裝置頂端,通常由兩個疏水性轉(zhuǎn)位子蛋白和一個親水性轉(zhuǎn)位子蛋白組成。有研究顯示,水稻白葉枯病菌Xoo的親水性轉(zhuǎn)位子蛋白Hpa1xoo和疏水性轉(zhuǎn)位子蛋白HrpFxoo是Ⅲ型分泌系統(tǒng)的重要組分,它們影響著水稻白葉枯病菌PX099A在水稻上的致病性。因此使用GAL4和膜酵母雙雜交系統(tǒng)驗證Hpa1xoo和HrpFxoo兩者間是否存在直接互作,結(jié)果表明,兩種蛋白之間并不存在直接互作。設(shè)計實驗將hpa1和hrpF基因分別連接到表達載體pHM1上,并在設(shè)計hpa1引物時加上flag標簽,在設(shè)計hrpF引物時加上his標簽,通過Western bloting實驗顯示蛋白表達正確。之后分別通過Hpa1-Flag蛋白和HrpF-His蛋白在PXO99A總蛋白中進行免疫共沉淀(CO-IP)實驗,然后將免疫沉淀的互作結(jié)合蛋白樣品送公司進行質(zhì)譜鑒定。... 

【文章來源】:南京農(nóng)業(yè)大學(xué)江蘇省 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】:74 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

水稻白葉枯病菌Ⅲ型分泌系統(tǒng)轉(zhuǎn)位子的鑒定與效應(yīng)因子XopN功能的研究


圖2-1?TAL效應(yīng)蛋白的結(jié)構(gòu)和功能解析(Schomacketal.,2013)??Fig.2-1?Structure?and?Functional?Analysis?of?TAL?Effector?Protein??

效應(yīng),蛋白,效應(yīng)因子,轉(zhuǎn)運區(qū)


2?non-TAL效應(yīng)蛋白的研究進展??2.1?non-TAL效應(yīng)蛋白的起源和特征??在黃單胞菌三型分泌系統(tǒng)分泌的效應(yīng)因子中,通過基因組測序后結(jié)果的對比分發(fā)現(xiàn),還存在一些non-TAL效應(yīng)因子的類型(Zhaoetal.,2013)。non-TAL效應(yīng)因在于絕大多數(shù)的黃單胞菌屬中,主要由分泌或者信號轉(zhuǎn)運區(qū)(secretion/translocatioignal)和特異功能結(jié)構(gòu)域(function?domain)兩部分組成(圖2-3)。non-TAL效應(yīng)一般具有下列共同的特征:I.啟動子區(qū)域存在HrpX特異性結(jié)合位點PIP-box和-1序列(TTCGB-N15-TTCGB-N30-32-YANNRT)?,?B?代表?C、G?或者?T;Y?代表?C?;R代表A、G或者T),通常受HrpX蛋白的調(diào)控;2.分泌信號區(qū)是由位于N_端50個特定氨基酸組成的,位于N-端的分泌信號肽和mRNA序列的特征成為了對noTAL?效應(yīng)蛋白鑒定研究的依據(jù)?(趙帥,2011)?。?通過這些典型的特點,?研究人員在胞菌中鑒定了大量的non-TAL效應(yīng)蛋白,尤其是Xcc中(Jiang?etal.?,2006)。??通過對Xoo和Abe?菌株基因組序列對比分析,發(fā)現(xiàn)不同的菌株中包含著數(shù)量不?non-TAL?蛋白,在義〇〇?的?MAFF311018、KACC10331、PX099A*分別有?24、19、??

原理圖,雙雜交,酵母,原理圖


pGBKT7、pGADT7中!罢T餌”蛋白X克隆BD載體中,表達BD/X融合蛋白;待測??試蛋白Y克隆到AD載體中,表達AD/Y融合蛋白,如果X蛋白與Y蛋白之間有作??用,則DNA-BD和AD同樣被連在一起,激活下游基因的轉(zhuǎn)錄,表達報告基因(圖1-??1)?〇??( ̄Bajt?y ̄Library??V?protein?pr〇tein??^??GALUAS?minimal?promoter?[??圖1-1酵母GAL4系統(tǒng)雙雜交原理圖(Clontech,2007)??Fig.?1-1.The?two-hybrid?principle?of?GAL4?system??1.13.2?LiAc介導(dǎo)的酵母轉(zhuǎn)化法??(1)

【參考文獻】:
期刊論文
[1]水稻白葉枯病菌Ⅲ型效應(yīng)物基因hpaF與毒力相關(guān)[J]. 劉國芳,蔣蓉,蘇輝昭,牛祥娜,玉延華,姜偉,何勇強.  華南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2015(05)
[2]黃單胞菌Ⅲ型分泌系統(tǒng)效應(yīng)蛋白的研究進展[J]. 易杰祥,景曉輝,吳倫英.  熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué). 2014(08)
[3]水稻黃單胞菌三型分泌系統(tǒng)效應(yīng)物的研究進展[J]. 趙帥,張子宇,馮家勛.  微生物學(xué)通報. 2011(12)
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[5]植物病原菌黃單胞菌的分類研究進展[J]. 龍海,李一農(nóng),李芳榮,徐浪.  植物保護. 2010(05)
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博士論文
[1]Harpins蛋白誘導(dǎo)植物生長和防衛(wèi)的信號傳導(dǎo)交叉調(diào)控及植物互作因子的研究[D]. 任秀艷.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2007
[2]水稻黃單胞菌遺傳操作體系的建立及hrp基因和avrBs3/pthA家族基因的功能研究[D]. 鄒麗芳.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2007

碩士論文
[1]水稻白葉枯病菌XopP/Q和Hpa1蛋白病理功能與植物防衛(wèi)反應(yīng)研究[D]. 高蓉.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[2]水稻細條斑病菌harpinXooc蛋白功能域研究[D]. 郭曉靜.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2004



本文編號:3340441

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