粘蟲生物鐘基因的克
發(fā)布時間:2021-07-25 16:43
粘蟲Mythimna separata(Walker)隸屬鱗翅目夜蛾科,是一種典型的季節(jié)性遠(yuǎn)距離遷飛害蟲,也是嚴(yán)重威脅我國糧食作物生產(chǎn)安全的重大害蟲,廣泛分布于亞洲和澳洲的多個國家和地區(qū)。粘蟲在我國每年南北往返遷飛危害。近年來,由于農(nóng)田生態(tài)系統(tǒng)變化,粘蟲的發(fā)生危害呈現(xiàn)加重趨勢,尤其是2012和2013年在全國范圍暴發(fā)成災(zāi),對農(nóng)業(yè)生產(chǎn)造成了嚴(yán)重的影響。生物鐘基因是調(diào)控生物節(jié)律的一類基因,在細(xì)胞、組織、器官和行為等各層次中起作用。而粘蟲作為一種晝伏夜出性害蟲,其飛行、交配、產(chǎn)卵等行為均發(fā)生于夜晚,具有明顯的晝夜節(jié)律。但截至目前,有關(guān)其晝夜活動節(jié)律的分子調(diào)控機(jī)制尚未見報道。本研究首次對粘蟲4個生物鐘基因進(jìn)行了克隆,在此基礎(chǔ)上,通過實時熒光定量PCR技術(shù)分析了相應(yīng)的表達(dá)模式,并就生物鐘基因?qū)φ诚x活動節(jié)律的調(diào)控進(jìn)行了進(jìn)一步研究。取得如下主要研究結(jié)果。1.根據(jù)粘蟲轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫擴(kuò)增獲得4種粘蟲生物鐘基因period、timless、clock和cycle,分別命名為Msper(KY446805)、Mstim(KY446806)、Msclk(KY446807)、Mscyc(KY825136),長度分別...
【文章來源】:西北農(nóng)林科技大學(xué)陜西省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:52 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
粘蟲組織總RNA瓊脂糖凝膠電泳圖
圖 3-2 生物鐘基因 PCR 結(jié)果電泳圖Fig. 3-2 The PCR results of clock genes1-2: Msper,3: Mstim,4-6: Msclk,7-9: Mscyc3.2.2 氨基酸序列分析與進(jìn)化樹構(gòu)建Msper、Mstim、Msclk、Mscyc4 個生物鐘基因所編碼蛋白分子量分別為 132 kDa、117kDa、69 kDa、75 kDa,理論等電點分別為 6.50、5.14、5.63、6.74。四個蛋白均無信號肽且細(xì)胞定位結(jié)果表明,主要分布于分泌通路及線粒體外的其他部位。MsPER 具有保守的 PAS 及 PAC 結(jié)構(gòu)域并包含酸性氨基酸殘基(Asp + Glu)140 個,堿性氨基酸殘基(Arg + Lys)131 個。其蛋白質(zhì)疏水性最大值為 2.389,最小值為 3.556,其中有 98 個絲氨酸(Ser),53 個蘇氨酸(Thr),12 個酪氨酸(Tyr)可能被磷酸化。其預(yù)測二級結(jié)構(gòu) α-螺旋比例為 23.15%,β-折疊 2.16%,無規(guī)則卷曲 64.68%。經(jīng)軟件分析該蛋白質(zhì)無信號肽,細(xì)胞定位結(jié)果說明該蛋白主要分布于分泌通路及線粒體外的細(xì)胞6 7 89
3.3 粘蟲雌蛾生物鐘基因的表達(dá)模式分析3.3.1 定量片段的確認(rèn)以粘蟲頭部 cDNA 為模板,使用已合成的定量引物擴(kuò)增粘蟲生物鐘基因 Msper、Mstim、Msclk、Mscyc 及 β-Actin 定量片段。結(jié)果顯示,擴(kuò)增得到的 5 個片段長度分別為139 bp、139 bp、106 bp、168 bp、141 bp。片段序列測序結(jié)果表明,這 5 個片段序列與其對應(yīng)的 5 個粘蟲基因的 cDNA 序列一致性為 100%。3.3.2 定量引物特異性檢測采用實時熒光定量 PCR 體系,利用定量引物分別對粘蟲生物鐘基因 Msper、Mstim、Msclk、Mscyc 及內(nèi)參基因 β-Actin 進(jìn)行擴(kuò)增。結(jié)果顯示,擴(kuò)增產(chǎn)物的熔解曲線均為單峰(圖 3-5),表明這幾對定量引物的特異性較好,可進(jìn)一步用于基因定量試驗。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]家蠶晝夜節(jié)律生物鐘基因的生物信息學(xué)分析[J]. 王文棟,束梅影,張達(dá)艷,徐世清. 四川動物. 2016(02)
[2]時間毒理學(xué)研究進(jìn)展[J]. 秦粉菊,陳麗莉,童建. 生命科學(xué). 2015(11)
[3]我國粘蟲發(fā)生危害新特點及趨勢分析[J]. 江幸福,張蕾,程云霞,羅禮智. 應(yīng)用昆蟲學(xué)報. 2014(06)
[4]哺乳動物生物鐘與能量代謝的相關(guān)研究進(jìn)展[J]. 王楠,袁拿特,富浩軒,朱雅麗,吳濤. 生命科學(xué). 2014(09)
[5]動物隱花色素研究進(jìn)展[J]. 呂垣澄,吳曉暉. 遺傳. 2014(09)
[6]生物節(jié)律基因Timeless的生物學(xué)功能研究進(jìn)展[J]. 宋何煜,張耀,江紅. 生物技術(shù)通訊. 2014(03)
[7]昆蟲的變態(tài)發(fā)育研究[J]. 曾保娟,馮啟理. 應(yīng)用昆蟲學(xué)報. 2014(02)
[8]興義維蚋中樞神經(jīng)系統(tǒng)的組織學(xué)觀察[J]. 尋慧,丁凱澤,楊明,陳漢彬. 中國寄生蟲學(xué)與寄生蟲病雜志. 2013(06)
[9]藍(lán)藻生物節(jié)律性分子調(diào)控機(jī)制的研究進(jìn)展[J]. 李青雁,龐羽彤,李小龍,周飛飛,張芳,霍宇鵬,趙宇瑋. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2013(05)
[10]2012年黏蟲暴發(fā)特點分析與監(jiān)測預(yù)警建議[J]. 曾娟,姜玉英,劉杰. 植物保護(hù). 2013(02)
博士論文
[1]草地螟對溫濕度變異的適應(yīng)與反應(yīng)[D]. 唐繼洪.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2016
[2]近日節(jié)律基因per1和per2的非生物鐘效應(yīng)的功能研究[D]. 王躍锜.四川大學(xué) 2005
碩士論文
[1]夜蛾科6種害蟲觸角微觀結(jié)構(gòu)比較分析[D]. 魏延弟.吉林農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[2]稻縱卷葉螟飛行行為及與生殖的互作關(guān)系[D]. 潘攀.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2013
[3]家蠶生物鐘基因Cry的克隆和功能鑒定[D]. 梁輝.蘇州大學(xué) 2011
[4]家蠶滯育誘導(dǎo)過程中近日節(jié)律基因period和timless的表達(dá)研究[D]. 宋艷.蘇州大學(xué) 2009
本文編號:3302395
【文章來源】:西北農(nóng)林科技大學(xué)陜西省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:52 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
粘蟲組織總RNA瓊脂糖凝膠電泳圖
圖 3-2 生物鐘基因 PCR 結(jié)果電泳圖Fig. 3-2 The PCR results of clock genes1-2: Msper,3: Mstim,4-6: Msclk,7-9: Mscyc3.2.2 氨基酸序列分析與進(jìn)化樹構(gòu)建Msper、Mstim、Msclk、Mscyc4 個生物鐘基因所編碼蛋白分子量分別為 132 kDa、117kDa、69 kDa、75 kDa,理論等電點分別為 6.50、5.14、5.63、6.74。四個蛋白均無信號肽且細(xì)胞定位結(jié)果表明,主要分布于分泌通路及線粒體外的其他部位。MsPER 具有保守的 PAS 及 PAC 結(jié)構(gòu)域并包含酸性氨基酸殘基(Asp + Glu)140 個,堿性氨基酸殘基(Arg + Lys)131 個。其蛋白質(zhì)疏水性最大值為 2.389,最小值為 3.556,其中有 98 個絲氨酸(Ser),53 個蘇氨酸(Thr),12 個酪氨酸(Tyr)可能被磷酸化。其預(yù)測二級結(jié)構(gòu) α-螺旋比例為 23.15%,β-折疊 2.16%,無規(guī)則卷曲 64.68%。經(jīng)軟件分析該蛋白質(zhì)無信號肽,細(xì)胞定位結(jié)果說明該蛋白主要分布于分泌通路及線粒體外的細(xì)胞6 7 89
3.3 粘蟲雌蛾生物鐘基因的表達(dá)模式分析3.3.1 定量片段的確認(rèn)以粘蟲頭部 cDNA 為模板,使用已合成的定量引物擴(kuò)增粘蟲生物鐘基因 Msper、Mstim、Msclk、Mscyc 及 β-Actin 定量片段。結(jié)果顯示,擴(kuò)增得到的 5 個片段長度分別為139 bp、139 bp、106 bp、168 bp、141 bp。片段序列測序結(jié)果表明,這 5 個片段序列與其對應(yīng)的 5 個粘蟲基因的 cDNA 序列一致性為 100%。3.3.2 定量引物特異性檢測采用實時熒光定量 PCR 體系,利用定量引物分別對粘蟲生物鐘基因 Msper、Mstim、Msclk、Mscyc 及內(nèi)參基因 β-Actin 進(jìn)行擴(kuò)增。結(jié)果顯示,擴(kuò)增產(chǎn)物的熔解曲線均為單峰(圖 3-5),表明這幾對定量引物的特異性較好,可進(jìn)一步用于基因定量試驗。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]家蠶晝夜節(jié)律生物鐘基因的生物信息學(xué)分析[J]. 王文棟,束梅影,張達(dá)艷,徐世清. 四川動物. 2016(02)
[2]時間毒理學(xué)研究進(jìn)展[J]. 秦粉菊,陳麗莉,童建. 生命科學(xué). 2015(11)
[3]我國粘蟲發(fā)生危害新特點及趨勢分析[J]. 江幸福,張蕾,程云霞,羅禮智. 應(yīng)用昆蟲學(xué)報. 2014(06)
[4]哺乳動物生物鐘與能量代謝的相關(guān)研究進(jìn)展[J]. 王楠,袁拿特,富浩軒,朱雅麗,吳濤. 生命科學(xué). 2014(09)
[5]動物隱花色素研究進(jìn)展[J]. 呂垣澄,吳曉暉. 遺傳. 2014(09)
[6]生物節(jié)律基因Timeless的生物學(xué)功能研究進(jìn)展[J]. 宋何煜,張耀,江紅. 生物技術(shù)通訊. 2014(03)
[7]昆蟲的變態(tài)發(fā)育研究[J]. 曾保娟,馮啟理. 應(yīng)用昆蟲學(xué)報. 2014(02)
[8]興義維蚋中樞神經(jīng)系統(tǒng)的組織學(xué)觀察[J]. 尋慧,丁凱澤,楊明,陳漢彬. 中國寄生蟲學(xué)與寄生蟲病雜志. 2013(06)
[9]藍(lán)藻生物節(jié)律性分子調(diào)控機(jī)制的研究進(jìn)展[J]. 李青雁,龐羽彤,李小龍,周飛飛,張芳,霍宇鵬,趙宇瑋. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2013(05)
[10]2012年黏蟲暴發(fā)特點分析與監(jiān)測預(yù)警建議[J]. 曾娟,姜玉英,劉杰. 植物保護(hù). 2013(02)
博士論文
[1]草地螟對溫濕度變異的適應(yīng)與反應(yīng)[D]. 唐繼洪.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2016
[2]近日節(jié)律基因per1和per2的非生物鐘效應(yīng)的功能研究[D]. 王躍锜.四川大學(xué) 2005
碩士論文
[1]夜蛾科6種害蟲觸角微觀結(jié)構(gòu)比較分析[D]. 魏延弟.吉林農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[2]稻縱卷葉螟飛行行為及與生殖的互作關(guān)系[D]. 潘攀.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2013
[3]家蠶生物鐘基因Cry的克隆和功能鑒定[D]. 梁輝.蘇州大學(xué) 2011
[4]家蠶滯育誘導(dǎo)過程中近日節(jié)律基因period和timless的表達(dá)研究[D]. 宋艷.蘇州大學(xué) 2009
本文編號:3302395
本文鏈接:http://sikaile.net/nykjlw/dzwbhlw/3302395.html
最近更新
教材專著