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陜西榆林地區(qū)馬鈴薯腐爛莖線蟲的特異性分子鑒定

發(fā)布時(shí)間:2021-07-20 17:04
  旨在對(duì)陜西榆林8個(gè)縣區(qū)馬鈴薯腐爛莖線蟲群體進(jìn)行特異性分子鑒定,明確該地區(qū)線蟲病害的種群類型,為馬鈴薯腐爛莖線蟲病的快速診斷和及時(shí)防控提供理論依據(jù)。采用通用引物rDNA1/rDNA2和特異性引物DdS1/DdS2 (A型)、DdL1/DdL2(B型)進(jìn)行基因擴(kuò)增、測(cè)序、序列分析并構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,對(duì)線蟲種類進(jìn)行鑒定。結(jié)果顯示,陜西榆林8個(gè)采樣點(diǎn)線蟲病害種類均為馬鈴薯腐爛莖線蟲B型,并且這8個(gè)地理種群的馬鈴薯腐爛莖線蟲具有較高的親緣關(guān)系。 

【文章來源】:陜西農(nóng)業(yè)科學(xué). 2020,66(03)

【文章頁數(shù)】:4 頁

【部分圖文】:

陜西榆林地區(qū)馬鈴薯腐爛莖線蟲的特異性分子鑒定


通用引物擴(kuò)增的rDNA-ITS序列凝膠電泳圖

序列,特異性引物,凝膠電泳,線蟲


采用特異性引物DdS1/DdS2和DdL1/DdL2分別進(jìn)行PCR,結(jié)果顯示擴(kuò)增出485 bp條帶,無252 bp條帶(圖2)。采用特異性引物對(duì)陜西8個(gè)地區(qū)的馬鈴薯腐爛莖線蟲進(jìn)行分型鑒定,結(jié)果均為B型,與上述通用引物PCR擴(kuò)增鑒定的結(jié)果一致。2.3 馬鈴薯莖線蟲rDNA-ITS序列分析

序列,線蟲,馬鈴薯,榆林


特異性引物PCR擴(kuò)增產(chǎn)物的測(cè)序結(jié)果顯示,序列1~8與馬鈴薯腐爛莖線蟲的同源性均達(dá)到99%以上。將榆林地區(qū)8個(gè)種群的特異性引物擴(kuò)增序列與GenBank中7個(gè)國內(nèi)外馬鈴薯腐爛莖線蟲種群(EF062575、AM232227、AY987007、EF062572、FJ911551、KC923223、EF062574)的rDNA-ITS序列進(jìn)行ClustalX比對(duì)分析并構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹。結(jié)果顯示,在親緣關(guān)系上所有的序列聚為3個(gè)分支,獲得的榆林地區(qū)8個(gè)種群中,1、2、3、4、5、8和EF062575、AM232227群體聚為一個(gè)分支,6和KC923223、EF062574群體聚為一個(gè)分支,7和EF062572、AY987007、FJ911551群體聚為一個(gè)分支,榆林地區(qū)8個(gè)地理種群的馬鈴薯腐爛莖線蟲具有較高的親緣關(guān)系。3 討論

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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碩士論文
[1]馬鈴薯腐爛莖線蟲的鑒定及分子檢測(cè)[D]. 劉先寶.華南熱帶農(nóng)業(yè)大學(xué) 2006



本文編號(hào):3293230

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