與玉米彎孢葉斑病抗性相關(guān)的miRNA篩選與鑒定
發(fā)布時(shí)間:2021-07-20 11:27
由新月彎孢[Curvularia lunata Walk Boed]引起的玉米彎孢霉葉斑病,曾在我國(guó)北方玉米產(chǎn)區(qū)大發(fā)生造成嚴(yán)重的產(chǎn)量損失,是玉米生產(chǎn)上的一種重要病害。然而目前關(guān)于mi RNA介導(dǎo)的抗新月彎孢菌的分子調(diào)控機(jī)理鮮有報(bào)道。本研究通過(guò)s RNA高通量測(cè)序、mi RNA微陣列芯片、stem-loop RT-PCR技術(shù)篩選和鑒定出與抗新月彎孢菌相關(guān)的mi RNA,采用降解組測(cè)序技術(shù)明確了一些mi RNA的靶基因,分析了mi RNA介導(dǎo)抗病的可能途徑,為深入研究玉米mi RNA介導(dǎo)的抗玉米彎孢葉斑病分子調(diào)控機(jī)理奠定了基礎(chǔ)。其主要研究結(jié)果如下:1.以黃早4(感病)和魯原(抗。椴牧,利用s RNA高通量測(cè)序技術(shù)鑒定了玉米與新月彎孢菌互作中的mi RNA。在感病反應(yīng)的對(duì)照和接種處理中分別鑒定出2004和1879個(gè)mi RNA,處理比對(duì)照少125個(gè)mi RNA,表明感病反應(yīng)中部分mi RNA表達(dá)受到抑制;在抗病反應(yīng)的對(duì)照組和接種處理組中分別鑒定出1304和2199個(gè)mi RNA,處理組比對(duì)照組多895個(gè)mi RNA,表明抗病反應(yīng)促進(jìn)了mi RNA表達(dá),暗示mi RNA表達(dá)豐度的提高與玉米...
【文章來(lái)源】:黑龍江八一農(nóng)墾大學(xué)黑龍江省
【文章頁(yè)數(shù)】:92 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
miRNA的生物合成途徑和功能Fig.1BiogenesisandfunctionofmiRNAs(Khraiwesheta1.2012)
21圖 2 玉米接種新月彎孢菌后發(fā)病情況Fig. 2 The incidence of maize after inoculation),空白對(duì)照;2:黃早 4(感。臃N處理;3:魯原(處理。接種處理:1×106個(gè)孢子/mL(2%蔗糖和 0.02%吐溫 2白對(duì)照:2%蔗糖和 0.02%吐溫 20 的無(wú)菌水。S), Controls; 2: Huangzao4(S), Inoculation; 3: Luyuan(R), n treatment: Curvularia lunata Conidia suspension of 1×106spotrol: Distilled water of 2% sucrose and 0.02% Tween20.1 2 3 4
結(jié)果與分析四個(gè)文庫(kù)中 sRNA 的長(zhǎng)度為 17-25nt,sRNA 呈現(xiàn)不均勻分布模式(圖 3), 的范圍從 21 到 24nt 不等,且 sRNA 首位偏好堿基為尿嘧啶(U),約占總 s其次是腺嘌呤。另外還發(fā)現(xiàn) 24nt sRNAs 最豐富(ItR1 為 28.12%,ItR2 為 26 20.41%,ItR4 為 35.00%),其次是 22nt。此外,在數(shù)據(jù)中觀察到 ItR3(抗性和 ItR4(抗性品種,處理)之間 sRNA 的大小有顯著差異,ItR4 中 21-24nt 的
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]NO和H2O2在玉米抗彎孢菌侵染中的生理作用機(jī)制[J]. 鄢洪海,吳菊香,張茹琴,遲玉成,宋希云,夏淑春. 華北農(nóng)學(xué)報(bào). 2016(01)
[2]農(nóng)桿菌介導(dǎo)的桑樹(shù)瞬時(shí)表達(dá)體系構(gòu)建及miRn51與其靶基因的表達(dá)分析[J]. 張大燕,賈凌,向仲懷,何寧佳. 蠶業(yè)科學(xué). 2015(01)
[3]草酸脅迫下擬南芥三個(gè)差異表達(dá)microRNA的分析[J]. 陳曉婷,劉軍,孫翠霞,林桂芳. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2014(04)
[4]植物miR164家族研究進(jìn)展[J]. 牟桂萍,紀(jì)春艷,許東林,周?chē)?guó)輝. 生命科學(xué). 2013(05)
[5]玉米種質(zhì)沈137抗病性及其利用潛力分析[J]. 甄廣田,羅玉鑫,張振平. 作物雜志. 2011(04)
[6]玉米SSR連鎖圖譜構(gòu)建和抗彎孢菌葉斑病的QTL分析[J]. 劉蘭浩,裴玉賀,穆平,張恩盈,郭新梅,鄢洪海,宋希云. 華北農(nóng)學(xué)報(bào). 2009(02)
[7]Proteomic comparison of four maize inbred lines with different levels of resistance to Curvularia lunata(Wakker) Boed infection[J]. Xiuli Huang, Lixing Liu, Yuhong Zhai, Tong Liu, Jie Chen * School of Agriculture and Biology, Key Laboratory of Microbial Metabolism, Ministry of Education, Shanghai Jiaotong University, 800 Dongchuan Road, Minhang District, Shanghai 200240, China. Progress in Natural Science. 2009(03)
[8]玉米彎孢菌葉斑病菌致病性遺傳變異[J]. 鄢洪海,陳捷,高增貴,夏淑春,張茹琴. 玉米科學(xué). 2005(02)
[9]玉米彎孢霉葉斑病菌生物學(xué)特性的研究[J]. 張定法,徐瑞富,張希福,婁國(guó)強(qiáng). 植物病理學(xué)報(bào). 1997(04)
[10]遼寧省爆發(fā)一種新病害-玉米彎孢菌葉斑病[J]. 呂國(guó)忠,劉志恒,何富剛,趙琦,劉萬(wàn)仁,宋亞坤,何景順,姜明忠,趙華忱. 沈陽(yáng)農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 1997(01)
博士論文
[1]MicroRNA調(diào)控下的RNAi途徑關(guān)鍵基因及NBS-LRR類(lèi)抗病基因在SMV侵染大豆中的作用研究[D]. 奧云朝倫.內(nèi)蒙古大學(xué) 2016
[2]玉米抗彎孢菌葉斑病QTL的定位及遺傳分析[D]. 侯靜.中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[3]玉米彎孢菌葉斑病抗性及其它農(nóng)藝性狀的QTL分析[D]. 黎裕.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2001
碩士論文
[1]水稻中與水稻-稻瘟病菌互作相關(guān)的microRNA初步研究[D]. 盧遠(yuǎn)根.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[2]番茄中應(yīng)答灰霉病菌的miRNA的抗病性及抗病機(jī)制研究[D]. 劉雨.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2014
[3]致病疫霉誘導(dǎo)下番茄小RNA文庫(kù)構(gòu)建及sly-miR396的功能特性研究[D]. 翟俊淼.大連理工大學(xué) 2014
[4]白木香原生質(zhì)體瞬時(shí)表達(dá)體系與植物MiRNA功能瞬時(shí)驗(yàn)證體系的建立[D]. 趙文婷.東北林業(yè)大學(xué) 2013
[5]基于生物信息學(xué)方法預(yù)測(cè)玉米抗紋枯病相關(guān)miRNA及功能分析[D]. 宋銳.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009
[6]外源化學(xué)物質(zhì)誘導(dǎo)玉米對(duì)彎孢菌葉斑病的抗性研究[D]. 易成波.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2005
本文編號(hào):3292736
【文章來(lái)源】:黑龍江八一農(nóng)墾大學(xué)黑龍江省
【文章頁(yè)數(shù)】:92 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
miRNA的生物合成途徑和功能Fig.1BiogenesisandfunctionofmiRNAs(Khraiwesheta1.2012)
21圖 2 玉米接種新月彎孢菌后發(fā)病情況Fig. 2 The incidence of maize after inoculation),空白對(duì)照;2:黃早 4(感。臃N處理;3:魯原(處理。接種處理:1×106個(gè)孢子/mL(2%蔗糖和 0.02%吐溫 2白對(duì)照:2%蔗糖和 0.02%吐溫 20 的無(wú)菌水。S), Controls; 2: Huangzao4(S), Inoculation; 3: Luyuan(R), n treatment: Curvularia lunata Conidia suspension of 1×106spotrol: Distilled water of 2% sucrose and 0.02% Tween20.1 2 3 4
結(jié)果與分析四個(gè)文庫(kù)中 sRNA 的長(zhǎng)度為 17-25nt,sRNA 呈現(xiàn)不均勻分布模式(圖 3), 的范圍從 21 到 24nt 不等,且 sRNA 首位偏好堿基為尿嘧啶(U),約占總 s其次是腺嘌呤。另外還發(fā)現(xiàn) 24nt sRNAs 最豐富(ItR1 為 28.12%,ItR2 為 26 20.41%,ItR4 為 35.00%),其次是 22nt。此外,在數(shù)據(jù)中觀察到 ItR3(抗性和 ItR4(抗性品種,處理)之間 sRNA 的大小有顯著差異,ItR4 中 21-24nt 的
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]NO和H2O2在玉米抗彎孢菌侵染中的生理作用機(jī)制[J]. 鄢洪海,吳菊香,張茹琴,遲玉成,宋希云,夏淑春. 華北農(nóng)學(xué)報(bào). 2016(01)
[2]農(nóng)桿菌介導(dǎo)的桑樹(shù)瞬時(shí)表達(dá)體系構(gòu)建及miRn51與其靶基因的表達(dá)分析[J]. 張大燕,賈凌,向仲懷,何寧佳. 蠶業(yè)科學(xué). 2015(01)
[3]草酸脅迫下擬南芥三個(gè)差異表達(dá)microRNA的分析[J]. 陳曉婷,劉軍,孫翠霞,林桂芳. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2014(04)
[4]植物miR164家族研究進(jìn)展[J]. 牟桂萍,紀(jì)春艷,許東林,周?chē)?guó)輝. 生命科學(xué). 2013(05)
[5]玉米種質(zhì)沈137抗病性及其利用潛力分析[J]. 甄廣田,羅玉鑫,張振平. 作物雜志. 2011(04)
[6]玉米SSR連鎖圖譜構(gòu)建和抗彎孢菌葉斑病的QTL分析[J]. 劉蘭浩,裴玉賀,穆平,張恩盈,郭新梅,鄢洪海,宋希云. 華北農(nóng)學(xué)報(bào). 2009(02)
[7]Proteomic comparison of four maize inbred lines with different levels of resistance to Curvularia lunata(Wakker) Boed infection[J]. Xiuli Huang, Lixing Liu, Yuhong Zhai, Tong Liu, Jie Chen * School of Agriculture and Biology, Key Laboratory of Microbial Metabolism, Ministry of Education, Shanghai Jiaotong University, 800 Dongchuan Road, Minhang District, Shanghai 200240, China. Progress in Natural Science. 2009(03)
[8]玉米彎孢菌葉斑病菌致病性遺傳變異[J]. 鄢洪海,陳捷,高增貴,夏淑春,張茹琴. 玉米科學(xué). 2005(02)
[9]玉米彎孢霉葉斑病菌生物學(xué)特性的研究[J]. 張定法,徐瑞富,張希福,婁國(guó)強(qiáng). 植物病理學(xué)報(bào). 1997(04)
[10]遼寧省爆發(fā)一種新病害-玉米彎孢菌葉斑病[J]. 呂國(guó)忠,劉志恒,何富剛,趙琦,劉萬(wàn)仁,宋亞坤,何景順,姜明忠,趙華忱. 沈陽(yáng)農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 1997(01)
博士論文
[1]MicroRNA調(diào)控下的RNAi途徑關(guān)鍵基因及NBS-LRR類(lèi)抗病基因在SMV侵染大豆中的作用研究[D]. 奧云朝倫.內(nèi)蒙古大學(xué) 2016
[2]玉米抗彎孢菌葉斑病QTL的定位及遺傳分析[D]. 侯靜.中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[3]玉米彎孢菌葉斑病抗性及其它農(nóng)藝性狀的QTL分析[D]. 黎裕.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2001
碩士論文
[1]水稻中與水稻-稻瘟病菌互作相關(guān)的microRNA初步研究[D]. 盧遠(yuǎn)根.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[2]番茄中應(yīng)答灰霉病菌的miRNA的抗病性及抗病機(jī)制研究[D]. 劉雨.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2014
[3]致病疫霉誘導(dǎo)下番茄小RNA文庫(kù)構(gòu)建及sly-miR396的功能特性研究[D]. 翟俊淼.大連理工大學(xué) 2014
[4]白木香原生質(zhì)體瞬時(shí)表達(dá)體系與植物MiRNA功能瞬時(shí)驗(yàn)證體系的建立[D]. 趙文婷.東北林業(yè)大學(xué) 2013
[5]基于生物信息學(xué)方法預(yù)測(cè)玉米抗紋枯病相關(guān)miRNA及功能分析[D]. 宋銳.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009
[6]外源化學(xué)物質(zhì)誘導(dǎo)玉米對(duì)彎孢菌葉斑病的抗性研究[D]. 易成波.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2005
本文編號(hào):3292736
本文鏈接:http://sikaile.net/nykjlw/dzwbhlw/3292736.html
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