錐栗半同胞子代群體遺傳結(jié)構(gòu)及栗疫病抗性變異分析
發(fā)布時(shí)間:2021-07-10 20:45
錐栗(Castanea henryi)是我國南方重要的木本糧食樹種。隨著錐栗產(chǎn)業(yè)及種植面積的不斷擴(kuò)大,選育錐栗優(yōu)良品種顯得尤為重要。由于對錐栗疫病抗性的遺傳基礎(chǔ)研究比較薄弱,目前仍未選育出用于推廣的高抗優(yōu)良品種。本研究利用開發(fā)的轉(zhuǎn)錄組SSR標(biāo)記對錐栗半同胞子代群體進(jìn)行了遺傳多樣性及遺傳結(jié)構(gòu)分析,并對群體的栗疫病抗性及苗期性狀進(jìn)行了變異分析,開展了優(yōu)良家系和優(yōu)良單株的初步選擇,并進(jìn)行了轉(zhuǎn)錄組SSR分子標(biāo)記和表型性狀的關(guān)聯(lián)分析,為進(jìn)一步的良種選育提供參考。主要研究結(jié)果如下:1.以6個(gè)錐栗農(nóng)家品種、3個(gè)板栗農(nóng)家品種和3個(gè)日本栗栽培品種為材料,共設(shè)計(jì)合成108對轉(zhuǎn)錄組SSR引物進(jìn)行擴(kuò)增,。其中引物FAFUZLEST-7、FAFUZLEST-9、FAFUZLEST-11、FAFUZLEST-12、FAFUZLEST-18等5個(gè)引物的多態(tài)性條帶百分比均為100%。2.利用18對轉(zhuǎn)錄組SSR引物對14個(gè)錐栗半同胞子代群體進(jìn)行遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)分析。檢測出Shanon信息指數(shù)(I)的范圍在1.037~1.287,平均有效等位基因數(shù)Ne=3.015,平均觀測雜合度Ho=0.584,平均期望雜合度He=...
【文章來源】:福建農(nóng)林大學(xué)福建省
【文章頁數(shù)】:105 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
部分SSR引物的擴(kuò)增結(jié)果
錐栗半同胞子代群體遺傳結(jié)構(gòu)及栗疫病抗性變異分析17圖2-212個(gè)基因型的聚類圖Figure2-2Dendrogramofthe12genotypes注:藍(lán)色為板栗,綠色為日本栗,紅色為錐栗。Cm-1~3為板栗1~3,Cc-1~3為日本栗1~3,Ch-1~6為處暑紅、雙峰子、大苞榛、烏榛、大尖嘴、油榛。Note:BlueforCastaneamollissima,greenforCastaneacrenata,redforCastaneahenryi.Cm-1~3areCastaneamollissima1~3,Cc-1~3areCastaneacrenata1~3,Ch-1~6areCSH、SFZ、DBZ、WZ、DJZ、YZ.
錐栗半同胞子代群體的轉(zhuǎn)錄組SSR分析22尖嘴(DJZ)群體的He最大,大苞榛(DBZ)的最;Shanon信息指數(shù)(I)的范圍在1.037-1.287,平均Shanon信息指數(shù)(I)為1.186,其中中尖嘴(ZJZ)群體的I最大,大苞榛(DBZ)的最;多態(tài)性位點(diǎn)百分比(PPL)的范圍在34.25%~60.77%,平均多態(tài)性位點(diǎn)百分比(PPL)為93.37%,其中油桐仔(YTZ)群體的PPL最大,大苞榛(DBZ)的最?傮w可以看出群體總體平均值都較高,說明錐栗的遺傳多樣性較豐富。從(表3-2)中可以看出,有11個(gè)群體的觀測雜合度值低于它們的期望雜合度值,這說明大部分群體的交配方式偏離隨機(jī)雜交方式。圖3-1錐栗半同胞家系毛細(xì)管電泳三色圖Figure3-1Capillaryelectrophoresistrichromatograminsemi-siblingfamiliesofCastaneahenryi
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]甜玉米種子營養(yǎng)品質(zhì)主要性狀全基因組關(guān)聯(lián)分析[J]. 王長進(jìn),徐運(yùn)林,程昕昕,周毅,余海兵. 浙江農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2020(03)
[2]溫?zé)釒в衩字旮叩娜蚪M關(guān)聯(lián)分析[J]. 郭子鋒,徐孝潔,劉小剛,王山葒. 玉米科學(xué). 2020(01)
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[7]水稻4種功能營養(yǎng)成分與SSR標(biāo)記關(guān)聯(lián)分析[J]. 鄒德堂,趙海彤,孫健,瞿炤珺,孫琦,付俊生,韓笑. 東北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2019(12)
[8]錐栗幼林期葉片表型及光合生理性狀遺傳變異研究[J]. 楊龍,江錫兵,吳強(qiáng),章平生,吳聰連,吳小云,龔榜初,賴俊聲. 林業(yè)科技通訊. 2019(11)
[9]板栗和錐栗種間雜交F1代葉片表型及其遺傳變異研究[J]. 江錫兵,章平生,楊龍,吳強(qiáng),吳聰連,吳小云,龔榜初,賴俊聲. 園藝學(xué)報(bào). 2019(11)
[10]轉(zhuǎn)基因技術(shù)對中國農(nóng)業(yè)發(fā)展的影響分析與建議[J]. 黃毓驍. 中國集體經(jīng)濟(jì). 2019(24)
博士論文
[1]赤桉抗風(fēng)特性及其重要性狀的關(guān)聯(lián)分析[D]. 尚秀華.中國林業(yè)科學(xué)研究院 2017
[2]基于連鎖與連鎖不平衡作圖解析粳稻稻瘟病抗性遺傳位點(diǎn)[D]. 郭麗穎.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[3]利用關(guān)聯(lián)作圖解析紫斑牡丹重要性狀的等位遺傳變異[D]. 吳靜.北京林業(yè)大學(xué) 2016
[4]杜仲高密度遺傳連鎖圖譜構(gòu)建與重要數(shù)量性狀的分子標(biāo)記[D]. 李煜.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2015
[5]桉樹高密度遺傳圖譜構(gòu)建及生長和材性相關(guān)QTL解析[D]. 于曉麗.中國林業(yè)科學(xué)研究院 2015
[6]利用連鎖與連鎖不平衡聯(lián)合作圖解析毛白楊重要性狀的等位遺傳變異[D]. 杜慶章.北京林業(yè)大學(xué) 2014
[7]美洲黑楊×青楊連鎖圖構(gòu)建及重要材性QTLs分析[D]. 黃秦軍.北京林業(yè)大學(xué) 2003
碩士論文
[1]基于SSR、SRAP標(biāo)記的榛屬種質(zhì)資源遺傳多樣性及親緣關(guān)系分析[D]. 陳豫靜.沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2019
[2]基于SSR標(biāo)記的香蕉品種指紋圖譜及ID構(gòu)建[D]. 唐敏慧.江西農(nóng)業(yè)大學(xué) 2019
[3]中國樟樹群體遺傳結(jié)構(gòu)研究[D]. 劉爽.江西農(nóng)業(yè)大學(xué) 2019
[4]基于SSR分子標(biāo)記的中國古老月季野生親本分析[D]. 吳高瓊.云南大學(xué) 2019
[5]錐栗野生和栽培群體遺傳多樣性的SSR分析[D]. 李穎林.福建農(nóng)林大學(xué) 2019
[6]閩楠種質(zhì)資源遺傳多樣性的SSR分析[D]. 劉丹.福建農(nóng)林大學(xué) 2019
[7]烏桕EST-SSR標(biāo)記開發(fā)與遺傳評價(jià)[D]. 董峰平.浙江農(nóng)林大學(xué) 2019
[8]野生花生全基因組SSR標(biāo)記的開發(fā)與應(yīng)用[D]. 仇靜靜.山東師范大學(xué) 2018
[9]野杏SSR標(biāo)記多樣性及其與表型性狀的關(guān)聯(lián)分析[D]. 盧彩云.沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[10]甘蔗栽培品種的主要農(nóng)藝性狀與AFLP和SSR分子標(biāo)記的關(guān)聯(lián)分析[D]. 朱專為.福建農(nóng)林大學(xué) 2018
本文編號:3276632
【文章來源】:福建農(nóng)林大學(xué)福建省
【文章頁數(shù)】:105 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
部分SSR引物的擴(kuò)增結(jié)果
錐栗半同胞子代群體遺傳結(jié)構(gòu)及栗疫病抗性變異分析17圖2-212個(gè)基因型的聚類圖Figure2-2Dendrogramofthe12genotypes注:藍(lán)色為板栗,綠色為日本栗,紅色為錐栗。Cm-1~3為板栗1~3,Cc-1~3為日本栗1~3,Ch-1~6為處暑紅、雙峰子、大苞榛、烏榛、大尖嘴、油榛。Note:BlueforCastaneamollissima,greenforCastaneacrenata,redforCastaneahenryi.Cm-1~3areCastaneamollissima1~3,Cc-1~3areCastaneacrenata1~3,Ch-1~6areCSH、SFZ、DBZ、WZ、DJZ、YZ.
錐栗半同胞子代群體的轉(zhuǎn)錄組SSR分析22尖嘴(DJZ)群體的He最大,大苞榛(DBZ)的最;Shanon信息指數(shù)(I)的范圍在1.037-1.287,平均Shanon信息指數(shù)(I)為1.186,其中中尖嘴(ZJZ)群體的I最大,大苞榛(DBZ)的最;多態(tài)性位點(diǎn)百分比(PPL)的范圍在34.25%~60.77%,平均多態(tài)性位點(diǎn)百分比(PPL)為93.37%,其中油桐仔(YTZ)群體的PPL最大,大苞榛(DBZ)的最?傮w可以看出群體總體平均值都較高,說明錐栗的遺傳多樣性較豐富。從(表3-2)中可以看出,有11個(gè)群體的觀測雜合度值低于它們的期望雜合度值,這說明大部分群體的交配方式偏離隨機(jī)雜交方式。圖3-1錐栗半同胞家系毛細(xì)管電泳三色圖Figure3-1Capillaryelectrophoresistrichromatograminsemi-siblingfamiliesofCastaneahenryi
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]甜玉米種子營養(yǎng)品質(zhì)主要性狀全基因組關(guān)聯(lián)分析[J]. 王長進(jìn),徐運(yùn)林,程昕昕,周毅,余海兵. 浙江農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2020(03)
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[4]林木全基因組關(guān)聯(lián)分析研究進(jìn)展與展望[J]. 李鵬,盧文杰,肖亮,權(quán)明洋,李連政,杜慶章,張德強(qiáng). 中國科學(xué):生命科學(xué). 2020(02)
[5]馬尾松候選基因EST-SSR引物開發(fā)[J]. 龔桂芳,馮源恒,安琪,楊章旗. 分子植物育種. 2020(23)
[6]錐栗基因組SSR開發(fā)及農(nóng)家品種的遺傳多樣性分析[J]. 顧光仕,李穎林,劉丹,陳輝,鄭國華,李煜. 森林與環(huán)境學(xué)報(bào). 2020(01)
[7]水稻4種功能營養(yǎng)成分與SSR標(biāo)記關(guān)聯(lián)分析[J]. 鄒德堂,趙海彤,孫健,瞿炤珺,孫琦,付俊生,韓笑. 東北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2019(12)
[8]錐栗幼林期葉片表型及光合生理性狀遺傳變異研究[J]. 楊龍,江錫兵,吳強(qiáng),章平生,吳聰連,吳小云,龔榜初,賴俊聲. 林業(yè)科技通訊. 2019(11)
[9]板栗和錐栗種間雜交F1代葉片表型及其遺傳變異研究[J]. 江錫兵,章平生,楊龍,吳強(qiáng),吳聰連,吳小云,龔榜初,賴俊聲. 園藝學(xué)報(bào). 2019(11)
[10]轉(zhuǎn)基因技術(shù)對中國農(nóng)業(yè)發(fā)展的影響分析與建議[J]. 黃毓驍. 中國集體經(jīng)濟(jì). 2019(24)
博士論文
[1]赤桉抗風(fēng)特性及其重要性狀的關(guān)聯(lián)分析[D]. 尚秀華.中國林業(yè)科學(xué)研究院 2017
[2]基于連鎖與連鎖不平衡作圖解析粳稻稻瘟病抗性遺傳位點(diǎn)[D]. 郭麗穎.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[3]利用關(guān)聯(lián)作圖解析紫斑牡丹重要性狀的等位遺傳變異[D]. 吳靜.北京林業(yè)大學(xué) 2016
[4]杜仲高密度遺傳連鎖圖譜構(gòu)建與重要數(shù)量性狀的分子標(biāo)記[D]. 李煜.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2015
[5]桉樹高密度遺傳圖譜構(gòu)建及生長和材性相關(guān)QTL解析[D]. 于曉麗.中國林業(yè)科學(xué)研究院 2015
[6]利用連鎖與連鎖不平衡聯(lián)合作圖解析毛白楊重要性狀的等位遺傳變異[D]. 杜慶章.北京林業(yè)大學(xué) 2014
[7]美洲黑楊×青楊連鎖圖構(gòu)建及重要材性QTLs分析[D]. 黃秦軍.北京林業(yè)大學(xué) 2003
碩士論文
[1]基于SSR、SRAP標(biāo)記的榛屬種質(zhì)資源遺傳多樣性及親緣關(guān)系分析[D]. 陳豫靜.沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2019
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[3]中國樟樹群體遺傳結(jié)構(gòu)研究[D]. 劉爽.江西農(nóng)業(yè)大學(xué) 2019
[4]基于SSR分子標(biāo)記的中國古老月季野生親本分析[D]. 吳高瓊.云南大學(xué) 2019
[5]錐栗野生和栽培群體遺傳多樣性的SSR分析[D]. 李穎林.福建農(nóng)林大學(xué) 2019
[6]閩楠種質(zhì)資源遺傳多樣性的SSR分析[D]. 劉丹.福建農(nóng)林大學(xué) 2019
[7]烏桕EST-SSR標(biāo)記開發(fā)與遺傳評價(jià)[D]. 董峰平.浙江農(nóng)林大學(xué) 2019
[8]野生花生全基因組SSR標(biāo)記的開發(fā)與應(yīng)用[D]. 仇靜靜.山東師范大學(xué) 2018
[9]野杏SSR標(biāo)記多樣性及其與表型性狀的關(guān)聯(lián)分析[D]. 盧彩云.沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[10]甘蔗栽培品種的主要農(nóng)藝性狀與AFLP和SSR分子標(biāo)記的關(guān)聯(lián)分析[D]. 朱專為.福建農(nóng)林大學(xué) 2018
本文編號:3276632
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