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南方水稻黑條矮縮病毒外殼蛋白的原核表達純化及其與抗病毒劑相互作用研究

發(fā)布時間:2021-07-07 11:15
  近年來,南方水稻黑條矮縮病毒(Southern rice black-streaked dwarf virus,SRBSDV)在我國南方地區(qū)發(fā)現(xiàn),并迅速在長江以南地區(qū)爆發(fā),嚴重降低我國水稻產量。然而,目前田間缺乏有效的抗SRBSDV的藥劑,并且對已有的抗SRBSDV藥劑的作用機制尚不清楚。SRBSDV外殼蛋白(P10)是病毒傳播和感染宿主所需的關鍵蛋白,是潛在的抗SRBSDV試劑篩選的靶標。研究發(fā)現(xiàn),阿魏酸及其衍生物具有農用活性,對水稻黑條矮縮病毒、番茄病毒、馬鈴薯病毒、瓜類病毒和玉米矮花葉病毒等具有很好的抑制活性,是潛在的抗SRBSDV藥劑。本論文通過體外克隆、表達和純化獲得SRBSDV外殼蛋白P10;利用熒光滴定和微量熱泳動儀技術研究靶標蛋白SRBSDV P10與抗植物病毒劑的相互作用。以抗病毒劑與SRBSDV P10蛋白的結合力為考查指標,建立了基于SRBSDV P10為靶標的離體藥物篩選模型,分析了基于阿魏酸結構骨架的一系列抗病毒化合物與WT-P10的相互作用。研究結果表明,抗植物病毒劑毒氟磷、氨基寡糖、香菇多糖、鹽酸嗎啉胍和病毒唑與SRBSDV P10蛋白沒有相互作用;而寧南... 

【文章來源】:貴州大學貴州省 211工程院校

【文章頁數(shù)】:101 頁

【學位級別】:碩士

【部分圖文】:

南方水稻黑條矮縮病毒外殼蛋白的原核表達純化及其與抗病毒劑相互作用研究


FDV病毒粒子結構

示意圖,信號采集,示意圖,水化層


應引起的移動性的測量方法,從微觀尺度上來說分子的定向運動在分子大小,電荷,水化層或構象等多種相互作用誘導下是高度敏的[71]。當液體局部受熱,分子開始沿著溫度梯度從高溫向低溫移動。當分子運動達到平衡狀態(tài),液體中分子的集中分布可以由等式 1-3 表示: = exp [-ST(T-T0)] = exp(-ST△T) ≈1- ST△T (1-3)其中 Chot是分子在高溫區(qū)域的濃度,Ccold是分子在低溫區(qū)域的濃度,ST是索雷系數(shù),T0初始溫度,T 是升高溫度。盡管 MST 的理論是新興的,但是大多數(shù)理論認為,各種參數(shù)可能影響 ST,如分子大小、電荷、水化層和溶劑熵。索雷系數(shù)可以由方程 1-4 表示:ST= (-△Shyd(T)+ 2 4 0 λDH(1-4)其中 A 代表分子的表面積,σeff為有效電荷,Δshyd 是分子-溶劑水化層的熵,λDH是 Debye-Hueckel 篩查長度,ε 介電常數(shù),β 是 ε 的溫度導數(shù)。

示意圖,信號采集,示意圖,水化層


應引起的移動性的測量方法,從微觀尺度上來說分子的定向運動在分子大小,電荷,水化層或構象等多種相互作用誘導下是高度敏的[71]。當液體局部受熱,分子開始沿著溫度梯度從高溫向低溫移動。當分子運動達到平衡狀態(tài),液體中分子的集中分布可以由等式 1-3 表示: = exp [-ST(T-T0)] = exp(-ST△T) ≈1- ST△T (1-3)其中 Chot是分子在高溫區(qū)域的濃度,Ccold是分子在低溫區(qū)域的濃度,ST是索雷系數(shù),T0初始溫度,T 是升高溫度。盡管 MST 的理論是新興的,但是大多數(shù)理論認為,各種參數(shù)可能影響 ST,如分子大小、電荷、水化層和溶劑熵。索雷系數(shù)可以由方程 1-4 表示:ST= (-△Shyd(T)+ 2 4 0 λDH(1-4)其中 A 代表分子的表面積,σeff為有效電荷,Δshyd 是分子-溶劑水化層的熵,λDH是 Debye-Hueckel 篩查長度,ε 介電常數(shù),β 是 ε 的溫度導數(shù)。

【參考文獻】:
期刊論文
[1]蛋白質-小分子相互作用的研究方法[J]. 趙志娟.  華中師范大學研究生學報. 2014(04)
[2]與RBSDV外殼蛋白P10互作植物因子的篩選與驗證[J]. 孫宗濤,魏佳,李俊敏,王旭,沈國新,陳劍平.  核農學報. 2014(05)
[3]南方水稻黑條矮縮病綜合防控關鍵技術研究[J]. 鐘玲,段德康,蔡德珍,賴昌秀,張國光,劉方義,楊迎青,蘭波,李湘民.  江西農業(yè)大學學報. 2014(01)
[4]The Efficiency of Southern rice black-streaked dwarf virus Transmission by the Vector Sogatella furcifera to Different Host Plant Species[J]. LI You-zhi1,3,CAO Yang1,ZHOU Qian1,GUO Hai-ming2 and OU Gao-cai2 1 Hunan Provincial Key Laboratory for Biology and Control of Plant Diseases and Insect Pests,College of Biosafety & Technology,Hunan Agricultural University,Changsha 410128,P.R.China 2 Hunan Provincial Plant Protection Station,Changsha 410650,P.R.China 3 National Research Center of Engineering & Technology for Utilization of Botanical Functional Ingredients,Hunan Agricultural University,Changsha 410128,P.R.China.  Journal of Integrative Agriculture. 2012(04)
[5]南方水稻黑條矮縮病毒的新的自然寄主[J]. 朱俊子,周倩,崔亞,高必達.  湖南農業(yè)大學學報(自然科學版). 2012(01)
[6]南方水稻黑條矮縮病補救藥劑篩選試驗[J]. 唐新海,龍先華,黃岳,陳上進.  廣西植保. 2011(04)
[7]南方水稻黑條矮縮病藥劑防控技術初探[J]. 楊海中,李鵬,廖孝文,王波.  中國植保導刊. 2011(11)
[8]毒氟磷防治南方水稻黑條矮縮病藥效研究[J]. 陳卓,李國君,范會濤,劉家駒,畢亮,楊松,宋寶安,胡德禹.  中國農學通報. 2011(18)
[9]南方水稻黑條矮縮病毒S6編碼一個沉默抑制子[J]. 盧嫣紅,張金鳳,熊如意,徐秋芳,周益軍.  中國農業(yè)科學. 2011(14)
[10]南方水稻黑條矮縮病的診斷與防控[J]. 李小一,肖媛,陳南康,張小平,陳海球,劉貴芳,鄧勇男,胡細貴.  科技信息. 2011(02)

博士論文
[1]南方水稻黑條矮縮病毒基因序列特征及基質蛋白與病毒防控藥劑相互作用研究[D]. 王貞超.貴州大學 2015
[2]新型酰胺類殺菌劑的設計、合成、殺菌活性和構效關系研究[D]. 杜士杰.中國農業(yè)大學 2015
[3]煙草花葉病毒的修飾和調控及其與安托芬類似物的相互作用研究[D]. 高爽.南開大學 2010
[4]嘧肽霉素抗煙草花葉病毒(TMV)作用機制研究[D]. 朱春玉.沈陽農業(yè)大學 2005

碩士論文
[1]黏質沙雷氏菌次生代謝物對TMV的抑制機理研究[D]. 畢建華.中國農業(yè)科學院 2014
[2]南方水稻黑條矮縮病毒云南分離物基因組特征及其編碼蛋白的功能預測[D]. 胡秀弟.云南農業(yè)大學 2012
[3]水稻黑條矮縮病毒基因組片段S3和S9編碼蛋白的表達分析[D]. 孫麗英.中國農業(yè)大學 2003



本文編號:3269532

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