不同侵染時間點稻粒黑粉病菌的轉(zhuǎn)錄組分析
發(fā)布時間:2021-07-05 16:46
由土傳真菌稻粒黑粉菌引起的稻粒黑粉病是水稻雜交制種田中的主要病害之一。為初步解析稻粒黑粉病菌侵染過程中與寄主的互作分子機制,本研究用稻粒黑粉病菌強毒力菌株JY-521侵染感病不育系材料"9311A",于侵染8、12、24、48和72 h 5個時間點取菌樣進行轉(zhuǎn)錄組測序分析。結(jié)果表明,與未侵染對照組相比,在侵染8 h時,差異表達基因(DEGs)數(shù)最多,有337個DEGs;其中上調(diào)的DEGs有120個,下調(diào)的DEGs有217個。337個DEGs的KEGG富集分析表明,脂肪酸代謝和過氧化物酶體可能是稻粒黑粉病菌侵染過程中的關(guān)鍵代謝途徑。此外,對編碼碳水化合物酶、分泌蛋白和宿主植物—病原互作蛋白的DEGs在5個侵染時間點的表達模式進行解析,結(jié)果表明,一些顯著上調(diào)表達的DEGs可能是稻粒黑粉病菌侵染的關(guān)鍵致病因子。該研究結(jié)果為解析稻粒黑粉病菌的致病分子機制,進一步防控該病害奠定了理論基礎(chǔ)。
【文章來源】:草業(yè)學(xué)報. 2020,29(09)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:13 頁
【部分圖文】:
稻粒黑粉病菌在5個不同侵染時間點的遺傳統(tǒng)計
稻粒黑粉病菌中共表達差異基因的表達模塊
將篩選閾值定為corrected P-value≤0.05,對不同時間獲得的差異表達基因進行GO注釋分析(圖3),這些DEGs被富集注釋到3個GO分類,分別是生物學(xué)過程(biological process)、細胞組成(cellular component)和分子功能(molecular function)。以未侵染為對照,對稻粒黑粉菌侵染8 h顯著差異表達基因進行GO富集分析,結(jié)果顯示,上調(diào)DEGs在生物學(xué)過程分類中的生長、細胞組成分類中的細胞器組件和分子功能分類中的酶調(diào)節(jié)活性、分子功能調(diào)節(jié)顯著富集。顯著下調(diào)DEGs在生物學(xué)過程的代謝過程和分子功能的結(jié)合、催化活性顯著富集。推測該7條富集條目可能與稻粒黑粉病菌致病途徑相關(guān)。2.5 KEGG代謝途徑分析
【參考文獻】:
期刊論文
[1]水稻幼穗與Ustilaginoidea virens互作早期的轉(zhuǎn)錄組分析[J]. 韓彥卿,韓淵懷,張春來,孫文獻. 植物病理學(xué)報. 2019(03)
[2]基于轉(zhuǎn)錄組測序的異常漢遜酵母菌不同發(fā)酵時期差異表達基因功能分析[J]. 唐朝,張寒玉,王婷,馮光文,錢衛(wèi)東,蔡長龍,毛培宏. 食品與發(fā)酵工業(yè). 2019(04)
[3]78個水稻不育系對稻粒黑粉病的抗性評價[J]. 王愛軍,殷得所,富蓉,盤林秀,顧思思,江波,鄭愛萍. 植物病理學(xué)報. 2018(02)
[4]一種簡單高質(zhì)量的黃傘菌總RNA分離提取方法[J]. 郭陳剛,李順國,魏志敏,夏雪巖. 華北農(nóng)學(xué)報. 2016(S1)
[5]中國水稻高產(chǎn)栽培技術(shù)創(chuàng)新與實踐[J]. 朱德峰,張玉屏,陳惠哲,向鏡,張義凱. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2015(17)
[6]碳水化合物活性酶數(shù)據(jù)庫(CAZy)及其研究趨勢[J]. 王帥,陳冠軍,張懷強,王祿山. 生物加工過程. 2014(01)
[7]稻瘟菌P-ATPase基因MoCTA3的克隆及表達分析[J]. 彭陳,陳洪亮,王俊偉,郭士偉,張玉瓊,方先文. 江蘇農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2012(03)
[8]稻瘟病菌分泌蛋白質(zhì)在致病過程中的作用初探[J]. 劉永鋒,陳志誼,俞文淵,于俊杰,胡建坤,劉郵洲,聶亞鋒. 中國水稻科學(xué). 2011(04)
[9]稻粒黑粉菌冬孢子萌發(fā)影響因素及其產(chǎn)孢培養(yǎng)基的篩選[J]. 陳勝軍,王艷麗,張震,姜華,柴榮耀,毛雪琴,邱海萍,王教瑜,杜新法,孫國昌. 浙江農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2011(03)
[10]氮脅迫條件下稻瘟病菌分泌蛋白致病性分析[J]. 周曉罡,蘇源,李成云,丁玉梅,張紹松,孫茂林,李進斌. 植物病理學(xué)報. 2009(05)
碩士論文
[1]小麥條銹菌幾丁質(zhì)酶基因Pst23943的功能分析[D]. 林顥丞.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2019
本文編號:3266447
【文章來源】:草業(yè)學(xué)報. 2020,29(09)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:13 頁
【部分圖文】:
稻粒黑粉病菌在5個不同侵染時間點的遺傳統(tǒng)計
稻粒黑粉病菌中共表達差異基因的表達模塊
將篩選閾值定為corrected P-value≤0.05,對不同時間獲得的差異表達基因進行GO注釋分析(圖3),這些DEGs被富集注釋到3個GO分類,分別是生物學(xué)過程(biological process)、細胞組成(cellular component)和分子功能(molecular function)。以未侵染為對照,對稻粒黑粉菌侵染8 h顯著差異表達基因進行GO富集分析,結(jié)果顯示,上調(diào)DEGs在生物學(xué)過程分類中的生長、細胞組成分類中的細胞器組件和分子功能分類中的酶調(diào)節(jié)活性、分子功能調(diào)節(jié)顯著富集。顯著下調(diào)DEGs在生物學(xué)過程的代謝過程和分子功能的結(jié)合、催化活性顯著富集。推測該7條富集條目可能與稻粒黑粉病菌致病途徑相關(guān)。2.5 KEGG代謝途徑分析
【參考文獻】:
期刊論文
[1]水稻幼穗與Ustilaginoidea virens互作早期的轉(zhuǎn)錄組分析[J]. 韓彥卿,韓淵懷,張春來,孫文獻. 植物病理學(xué)報. 2019(03)
[2]基于轉(zhuǎn)錄組測序的異常漢遜酵母菌不同發(fā)酵時期差異表達基因功能分析[J]. 唐朝,張寒玉,王婷,馮光文,錢衛(wèi)東,蔡長龍,毛培宏. 食品與發(fā)酵工業(yè). 2019(04)
[3]78個水稻不育系對稻粒黑粉病的抗性評價[J]. 王愛軍,殷得所,富蓉,盤林秀,顧思思,江波,鄭愛萍. 植物病理學(xué)報. 2018(02)
[4]一種簡單高質(zhì)量的黃傘菌總RNA分離提取方法[J]. 郭陳剛,李順國,魏志敏,夏雪巖. 華北農(nóng)學(xué)報. 2016(S1)
[5]中國水稻高產(chǎn)栽培技術(shù)創(chuàng)新與實踐[J]. 朱德峰,張玉屏,陳惠哲,向鏡,張義凱. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2015(17)
[6]碳水化合物活性酶數(shù)據(jù)庫(CAZy)及其研究趨勢[J]. 王帥,陳冠軍,張懷強,王祿山. 生物加工過程. 2014(01)
[7]稻瘟菌P-ATPase基因MoCTA3的克隆及表達分析[J]. 彭陳,陳洪亮,王俊偉,郭士偉,張玉瓊,方先文. 江蘇農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2012(03)
[8]稻瘟病菌分泌蛋白質(zhì)在致病過程中的作用初探[J]. 劉永鋒,陳志誼,俞文淵,于俊杰,胡建坤,劉郵洲,聶亞鋒. 中國水稻科學(xué). 2011(04)
[9]稻粒黑粉菌冬孢子萌發(fā)影響因素及其產(chǎn)孢培養(yǎng)基的篩選[J]. 陳勝軍,王艷麗,張震,姜華,柴榮耀,毛雪琴,邱海萍,王教瑜,杜新法,孫國昌. 浙江農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2011(03)
[10]氮脅迫條件下稻瘟病菌分泌蛋白致病性分析[J]. 周曉罡,蘇源,李成云,丁玉梅,張紹松,孫茂林,李進斌. 植物病理學(xué)報. 2009(05)
碩士論文
[1]小麥條銹菌幾丁質(zhì)酶基因Pst23943的功能分析[D]. 林顥丞.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2019
本文編號:3266447
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