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喜旱蓮子草萜類合成酶基因生物信息學(xué)分析及橙花叔醇合酶基因的克隆

發(fā)布時間:2021-07-05 12:04
  植物揮發(fā)出的萜類物質(zhì)能夠影響昆蟲的寄主選擇行為,其中專食性昆蟲識別寄主植物的主要因素是植物的某些揮發(fā)物的質(zhì)和量的不同。蓮草直胸跳甲是入侵植物喜旱蓮子草的專食性天敵。前期研究表明寄主植物萜類物質(zhì)DMNT在該昆蟲的專性識別中起關(guān)鍵作用。為進(jìn)一步探究其作用的分子機(jī)理,本文主要研究了喜旱蓮子草萜類合成酶基因及產(chǎn)生DMNT的關(guān)鍵酶——橙花叔醇合酶基因。1、采用RNA-seq技術(shù),借助Illumina HiSeq2500TM平臺對喜旱蓮子草進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序,共獲得9.91 Gb reads,經(jīng)組裝拼接得到Transcript 182318條以及83179條Unigene。與Nr、Swiss-Prot、GO、COG、KOG、KEGG蛋白數(shù)據(jù)庫進(jìn)行同源性比對后,獲得63536條有注釋信息的Unigene,構(gòu)建了喜旱蓮子草Unigene數(shù)據(jù)庫,測序結(jié)果良好。2、篩選出32條喜旱蓮子草萜類合成酶基因,其同源性與藜科甜菜屬甜菜基因的同源性較高。參考已報道的萜類合酶基因的家族分類標(biāo)準(zhǔn),對具有完整開放閱讀框的7條序列進(jìn)行了系統(tǒng)進(jìn)化分析,其中ApTP7S9、ApTPS17、ApTPS18和ApTPS21分入TPS-... 

【文章來源】:山西農(nóng)業(yè)大學(xué)山西省

【文章頁數(shù)】:63 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

喜旱蓮子草萜類合成酶基因生物信息學(xué)分析及橙花叔醇合酶基因的克隆


圖1-1多樣萜類合成酶合成萜類物質(zhì)[46]??Figure.?1-1?The?formation?of?terpenoids?catalyzed?by?various?types?of?terpene??

物種分布,轉(zhuǎn)錄組,喜旱蓮子草,物種分布


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【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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博士論文
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[2]利馬豆和水稻DMNT/TMTT合成通路關(guān)鍵基因的鑒定與功能研究[D]. 李峰奇.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2015
[3]入侵種喜旱蓮子草表型可塑性變異和快速適應(yīng)的分子基礎(chǔ)[D]. 高樂旋.復(fù)旦大學(xué) 2012
[4]入侵雜草的物種分化與局域適應(yīng)研究[D]. 予茜.武漢大學(xué) 2011



本文編號:3266040

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