浙江省馬鈴薯病毒病檢測(cè)分析
發(fā)布時(shí)間：2021-06-27 14:23
馬鈴薯病毒病是影響馬鈴薯產(chǎn)量和品質(zhì)的主要因素之一,其癥狀表現(xiàn)為花葉、黃化和卷曲等。2019年4月-5月,在浙江省湖州、杭州、紹興、寧波、金華、臺(tái)州和麗水等7個(gè)地市的主要馬鈴薯產(chǎn)區(qū)采集了具有典型病毒病癥狀的馬鈴薯樣品,采用轉(zhuǎn)錄組測(cè)序和RT-PCR驗(yàn)證的方法進(jìn)行病毒檢測(cè),共篩查并驗(yàn)證出6種馬鈴薯病毒,包括馬鈴薯X病毒Potato virus X（PVX）、馬鈴薯Y病毒Potato virus Y（PVY）、馬鈴薯S病毒Potato virus S（PVS）、馬鈴薯H病毒Potato virus H（PVH）、馬鈴薯M病毒Potato virus M（PVM）以及馬鈴薯奧古巴花葉病毒Potato aucuba mosaic virus（PAMV）。檢測(cè)結(jié)果表明,在調(diào)查的這7個(gè)地市中每個(gè)地市都具有2種以上的病毒發(fā)生,其中PVH作為一種新鑒定的麝香石竹潛隱病毒屬成員在除寧波以外的各地區(qū)都有發(fā)生;此外杭州市、湖州市以及紹興市均檢測(cè)出了PAMV。對(duì)檢測(cè)到的PVS、PVH、PVM和PAMV外殼蛋白（coat protein,CP）序列進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育分析表明,這些病毒均存在地域差異性。本研究為浙江省馬鈴薯...
【文章來(lái)源】：植物保護(hù). 2020,46(05)北大核心CSCD
【文章頁(yè)數(shù)】：7 頁(yè)
【部分圖文】：
浙江省馬鈴薯病毒病的典型癥狀
我們將代表7個(gè)地市的混池馬鈴薯樣品送往諾禾致源公司進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析,共檢測(cè)到6種馬鈴薯病毒,分別為PVX、PVY、PVS、PVH、PVM以及PAMV。根據(jù)轉(zhuǎn)錄組獲得的CP序列設(shè)計(jì)引物進(jìn)行PCR驗(yàn)證,各病毒CP引物都能擴(kuò)增出相應(yīng)的條帶(圖2)。根據(jù)轉(zhuǎn)錄組檢測(cè)結(jié)果,結(jié)合RT-PCR驗(yàn)證,該7個(gè)地市馬鈴薯種植區(qū)中發(fā)生的病毒種類情況如表2。表2 浙江省7個(gè)地市馬鈴薯病毒病的病原檢測(cè)情況1)Table 2 Pathogen detection of potato virus diseases in various cities of Zhejiang province 采集地 Location PVX PVY PVS PVH PVM PAMV 杭州 Hangzhou - + + + + + 寧波 Ningbo - + - - + - 紹興 Shaoxing - - + + - + 湖州 Huzhou + - - + - + 金華 Jinhua + - - + + - 麗水 Lishui + - - + + - 臺(tái)州 Taizhou + + + + - - 1) “+”表示在該地區(qū)檢測(cè)到此種病毒;“-”表示在該地區(qū)未檢測(cè)到此種病毒。“+”indicates that the virus is detected in the area; “-” indicates that the virus is not detected in the area.
我們將在各地檢測(cè)到的以及NCBI上所報(bào)道的PAMV CP序列的氨基酸進(jìn)行進(jìn)化樹(shù)構(gòu)建分析,結(jié)果如圖3。圖3顯示湖州市所發(fā)生的PAMV與孟加拉國(guó)所發(fā)生的PAMV(MG356505.1、MG356506.1)相似度最高,親緣關(guān)系最近。本次杭州地區(qū)檢測(cè)到的PAMV分離物和曾經(jīng)在杭州檢測(cè)的序列號(hào)為MH379106.1的PAMV親緣關(guān)系最近,表明在杭州地區(qū)PAMV的發(fā)生并沒(méi)有較大的差異。然而發(fā)生在紹興的PAMV與已報(bào)道的S73580.1和NC 003632.1相似度最高,具有最近的親緣關(guān)系。但是通過(guò)分支情況來(lái)看,紹興市與湖州、杭州兩市處于兩個(gè)不同的分支,因此杭州市和湖州市的PAMV親緣關(guān)系相對(duì)紹興市則更近一些。2.3.2 PVH的系統(tǒng)發(fā)育分析
【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]甘肅省馬鈴薯主要病毒病發(fā)生情況調(diào)查[J]. 齊恩芳,劉石,賈小霞,文國(guó)宏,呂和平,黃偉,高彥萍. 植物保護(hù). 2018(04)
[2]浙江省鮮食馬鈴薯春、秋季高效栽培技術(shù)[J]. 蔡仁祥. 浙江農(nóng)業(yè)科學(xué). 2015(06)
[3]馬鈴薯不同級(jí)別脫毒種薯病毒再侵染情況及產(chǎn)量變化[J]. 黃萍,何慶才,顏謙. 貴州農(nóng)業(yè)科學(xué). 2008(04)
碩士論文
[1]山西省馬鈴薯病毒病區(qū)系分布及綜合防治的研究[D]. 郭喜文.山西農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
本文編號(hào)：3253017
【文章來(lái)源】：植物保護(hù). 2020,46(05)北大核心CSCD
【文章頁(yè)數(shù)】：7 頁(yè)
【部分圖文】：
浙江省馬鈴薯病毒病的典型癥狀
我們將代表7個(gè)地市的混池馬鈴薯樣品送往諾禾致源公司進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析,共檢測(cè)到6種馬鈴薯病毒,分別為PVX、PVY、PVS、PVH、PVM以及PAMV。根據(jù)轉(zhuǎn)錄組獲得的CP序列設(shè)計(jì)引物進(jìn)行PCR驗(yàn)證,各病毒CP引物都能擴(kuò)增出相應(yīng)的條帶(圖2)。根據(jù)轉(zhuǎn)錄組檢測(cè)結(jié)果,結(jié)合RT-PCR驗(yàn)證,該7個(gè)地市馬鈴薯種植區(qū)中發(fā)生的病毒種類情況如表2。表2 浙江省7個(gè)地市馬鈴薯病毒病的病原檢測(cè)情況1)Table 2 Pathogen detection of potato virus diseases in various cities of Zhejiang province 采集地 Location PVX PVY PVS PVH PVM PAMV 杭州 Hangzhou - + + + + + 寧波 Ningbo - + - - + - 紹興 Shaoxing - - + + - + 湖州 Huzhou + - - + - + 金華 Jinhua + - - + + - 麗水 Lishui + - - + + - 臺(tái)州 Taizhou + + + + - - 1) “+”表示在該地區(qū)檢測(cè)到此種病毒;“-”表示在該地區(qū)未檢測(cè)到此種病毒。“+”indicates that the virus is detected in the area; “-” indicates that the virus is not detected in the area.
我們將在各地檢測(cè)到的以及NCBI上所報(bào)道的PAMV CP序列的氨基酸進(jìn)行進(jìn)化樹(shù)構(gòu)建分析,結(jié)果如圖3。圖3顯示湖州市所發(fā)生的PAMV與孟加拉國(guó)所發(fā)生的PAMV(MG356505.1、MG356506.1)相似度最高,親緣關(guān)系最近。本次杭州地區(qū)檢測(cè)到的PAMV分離物和曾經(jīng)在杭州檢測(cè)的序列號(hào)為MH379106.1的PAMV親緣關(guān)系最近,表明在杭州地區(qū)PAMV的發(fā)生并沒(méi)有較大的差異。然而發(fā)生在紹興的PAMV與已報(bào)道的S73580.1和NC 003632.1相似度最高,具有最近的親緣關(guān)系。但是通過(guò)分支情況來(lái)看,紹興市與湖州、杭州兩市處于兩個(gè)不同的分支,因此杭州市和湖州市的PAMV親緣關(guān)系相對(duì)紹興市則更近一些。2.3.2 PVH的系統(tǒng)發(fā)育分析
【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]甘肅省馬鈴薯主要病毒病發(fā)生情況調(diào)查[J]. 齊恩芳,劉石,賈小霞,文國(guó)宏,呂和平,黃偉,高彥萍. 植物保護(hù). 2018(04)
[2]浙江省鮮食馬鈴薯春、秋季高效栽培技術(shù)[J]. 蔡仁祥. 浙江農(nóng)業(yè)科學(xué). 2015(06)
[3]馬鈴薯不同級(jí)別脫毒種薯病毒再侵染情況及產(chǎn)量變化[J]. 黃萍,何慶才,顏謙. 貴州農(nóng)業(yè)科學(xué). 2008(04)
碩士論文
[1]山西省馬鈴薯病毒病區(qū)系分布及綜合防治的研究[D]. 郭喜文.山西農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
本文編號(hào)：3253017
本文鏈接：http://sikaile.net/nykjlw/dzwbhlw/3253017.html
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