菜粉蝶顆粒體病毒(PrGV)基因組轉(zhuǎn)錄與蛋白表達(dá)分析
發(fā)布時(shí)間:2021-06-25 01:46
菜粉蝶顆粒體病毒(Pieris rapae Granulovirus,PrGV)屬于桿狀病毒科、顆粒體病毒屬,是一類特異感染菜粉蝶幼蟲的GV病毒。本論文通過基因組測序解析了 PrGV基因組結(jié)構(gòu),對其編碼的120個(gè)蛋白進(jìn)行了預(yù)測。同時(shí),利用現(xiàn)代分子生物學(xué)方法對PrGV 一些基因進(jìn)行表達(dá)模式分析和定位研究,并結(jié)合基因組、轉(zhuǎn)錄組和蛋白組等數(shù)據(jù)探討了 PrGV與宿主的相互關(guān)系。所取得的主要結(jié)論如下:1)PrGV基因組大小為108,592bp,編碼120個(gè)ORF,有62個(gè)ORF在其它GV基因組中均有同源基因,可能是GV核心基因;有5個(gè)ORF與其它GV基因同源性很低,可能是PrGV特有的。PrGV與ErelGV親緣關(guān)系最近,基因組ORFs共線性程度也很高;與HearGV親緣關(guān)系較遠(yuǎn),共線性程度次之;與AcMNPV基因組無明顯的共線性關(guān)系。2)利用高通量測序技術(shù)建立了菜青蟲感染PrGV后的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫(包括未感毒對照、感毒6h組和感毒72h組的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫),共鑒定到103個(gè)PrGV基因的表達(dá)。通過比較宿主基因在各轉(zhuǎn)錄組之間的表達(dá)水平變化,分別篩選到1,224個(gè)(未感毒:感毒6h)、1,638個(gè)(未...
【文章來源】:浙江大學(xué)浙江省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:119 頁
【學(xué)位級別】:博士
【部分圖文】:
圖1.1桿狀病毒的包涵體形態(tài)(vanOersetal.,2007)??Figure?1.1?The?morphology?of?occlusion-derived?virion?of?baculovirus?(van?Oers?et?al.,and??Vlak,?2007)??
?第二章顆粒體病毒(GV)基因組比較分析??其囊膜含有一個(gè)或者多個(gè)核衣殼(圖1.2),ODV表面被多角體或顆粒體蛋白包??裹,能夠通過其它昆蟲取食從而侵染下一個(gè)宿主。??兩種時(shí)相的桿狀病毒粒子外層均有囊膜包被,但它們的來源不盡相同。BV粒??子的核衣殼在穿越核膜的時(shí)候獲得一層脂囊膜,但這層膜在隨后病毒粒子穿越細(xì)??胞質(zhì)的時(shí)候消失,病毒粒子在繼續(xù)穿越細(xì)胞質(zhì)膜的時(shí)候再次獲得囊膜,這層囊膜??使BV粒子更容易吸附其它易感細(xì)胞,從而引發(fā)二次感染。桿狀病毒在第二時(shí)相??期間,其病毒粒子直接被包埋進(jìn)核內(nèi)新裝配的囊膜中,含有囊膜的病毒粒子隨后??被包埋進(jìn)多角體(或顆粒體)的蛋白基質(zhì)中,從而形成多角體(或顆粒體)。包??被BV和ODV的囊膜性質(zhì)和功能亦存在差異
PrGV感染初期(3-4天),菜青蟲生長狀態(tài)較差,無法正常蛻皮,影響??昆蟲的正常生長;6天以后,昆蟲的取食量下降,行動(dòng)遲緩;感毒后第9-12天,??菜青蟲最終死亡,整個(gè)蟲體開始液化(圖1.3)。??自上世紀(jì)五十年代起,國外就開展了對PrGV的研究;七十年代,前蘇聯(lián)即??開始利用PrGV防控菜青蟲。我國對PrGV的研究起步較晚,于1972年在廣州??第一次分離到此病毒(全國蔬菜害蟲病毒科研協(xié)作組,1982)。目前,先后由20多??個(gè)省、市、自治區(qū)利用PrGV防治農(nóng)業(yè)害蟲。??4?i?一??圖1.3感染PrGV后的菜青蟲形態(tài)(王曉鋒等,2011)??Figure?1.3?The?symptom?of?P.?rapae?infected?with?PrGV?(Wang?et?al.,?2011)??-7-??
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]桿狀病毒-昆蟲細(xì)胞技術(shù)在人用重組蛋白疫苗生產(chǎn)中的應(yīng)用[J]. 王偉善,吳浩飛,申碩,楊曉明. 中國生物制品學(xué)雜志. 2013(12)
[2]細(xì)胞凋亡研究進(jìn)展[J]. 閻海. 中山大學(xué)研究生學(xué)刊(自然科學(xué).醫(yī)學(xué)版). 2012(03)
[3]水稻齒葉矮縮病毒的研究進(jìn)展[J]. 鄭璐平,謝荔巖,連玲麗,謝聯(lián)輝. 中國農(nóng)業(yè)科技導(dǎo)報(bào). 2008(05)
[4]線粒體——抗病毒感染的重要細(xì)胞器[J]. 侯寧波,鐘輝,馬清鈞. 生物技術(shù)通訊. 2008(05)
[5]果蠅熱激蛋白的研究進(jìn)展[J]. 王秋香,李宗蕓,謝艷,曹慧. 昆蟲知識. 2008(05)
[6]柞蠶NPV多角體膜蛋白類似基因的克隆和序列分析[J]. 王利群,沈衛(wèi)德,李兵. 蠶業(yè)科學(xué). 2006(04)
[7]缺失p10基因的重組棉鈴蟲病毒導(dǎo)致多角體囊膜包裝不完整[J]. 董春升,鄧菲,袁麗,潘小玉,王華林,胡志紅. Virologica Sinica. 2006(06)
[8]昆蟲桿狀病毒殺蟲劑研制與應(yīng)用進(jìn)展[J]. 劉永平,王方海,蘇志堅(jiān),李廣宏. 中國生物防治. 2006(01)
[9]小菜粉蝶顆粒體病毒顆粒體蛋白基因的序列測定及在大腸桿菌中的表達(dá)[J]. 陳可,張珈敏,胡遠(yuǎn)揚(yáng),劉傳鳳. 中國病毒學(xué). 2004(05)
[10]昆蟲桿狀病毒表達(dá)系統(tǒng)的研究與應(yīng)用進(jìn)展[J]. 劉高強(qiáng),章克昌,王曉玲,魏美才. 中國生物工程雜志. 2004(07)
博士論文
[1]家蠶表皮蛋白基因的表達(dá)譜分析及表皮蛋白BmorCPT1的功能研究[D]. 梁九波.西南大學(xué) 2012
[2]菜粉蝶顆粒體病毒基因組和ODV蛋白組研究[D]. 王曉鋒.浙江大學(xué) 2012
[3]家蠶感染質(zhì)型多角體病毒差異表達(dá)基因研究[D]. 吳萍.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2010
[4]東方粘蟲顆粒體病毒和斜紋夜蛾核型多角體病毒Ⅱ基因組全序列分析[D]. 李軼女.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2008
[5]菜粉蝶顆粒體病毒的分子生物學(xué)研究[D]. 溫榮輝.廣西大學(xué) 2007
[6]BmNPV三個(gè)桿狀病毒核心基因分析[D]. 徐海君.浙江大學(xué) 2006
碩士論文
[1]家蠶桿狀病毒IAP蛋白功能的研究[D]. 陳濱.浙江理工大學(xué) 2015
[2]桿狀病毒誘導(dǎo)的斜紋蛾細(xì)胞凋亡及其機(jī)制的初步研究[D]. 杜昌升.華中師范大學(xué) 2002
本文編號:3248246
【文章來源】:浙江大學(xué)浙江省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:119 頁
【學(xué)位級別】:博士
【部分圖文】:
圖1.1桿狀病毒的包涵體形態(tài)(vanOersetal.,2007)??Figure?1.1?The?morphology?of?occlusion-derived?virion?of?baculovirus?(van?Oers?et?al.,and??Vlak,?2007)??
?第二章顆粒體病毒(GV)基因組比較分析??其囊膜含有一個(gè)或者多個(gè)核衣殼(圖1.2),ODV表面被多角體或顆粒體蛋白包??裹,能夠通過其它昆蟲取食從而侵染下一個(gè)宿主。??兩種時(shí)相的桿狀病毒粒子外層均有囊膜包被,但它們的來源不盡相同。BV粒??子的核衣殼在穿越核膜的時(shí)候獲得一層脂囊膜,但這層膜在隨后病毒粒子穿越細(xì)??胞質(zhì)的時(shí)候消失,病毒粒子在繼續(xù)穿越細(xì)胞質(zhì)膜的時(shí)候再次獲得囊膜,這層囊膜??使BV粒子更容易吸附其它易感細(xì)胞,從而引發(fā)二次感染。桿狀病毒在第二時(shí)相??期間,其病毒粒子直接被包埋進(jìn)核內(nèi)新裝配的囊膜中,含有囊膜的病毒粒子隨后??被包埋進(jìn)多角體(或顆粒體)的蛋白基質(zhì)中,從而形成多角體(或顆粒體)。包??被BV和ODV的囊膜性質(zhì)和功能亦存在差異
PrGV感染初期(3-4天),菜青蟲生長狀態(tài)較差,無法正常蛻皮,影響??昆蟲的正常生長;6天以后,昆蟲的取食量下降,行動(dòng)遲緩;感毒后第9-12天,??菜青蟲最終死亡,整個(gè)蟲體開始液化(圖1.3)。??自上世紀(jì)五十年代起,國外就開展了對PrGV的研究;七十年代,前蘇聯(lián)即??開始利用PrGV防控菜青蟲。我國對PrGV的研究起步較晚,于1972年在廣州??第一次分離到此病毒(全國蔬菜害蟲病毒科研協(xié)作組,1982)。目前,先后由20多??個(gè)省、市、自治區(qū)利用PrGV防治農(nóng)業(yè)害蟲。??4?i?一??圖1.3感染PrGV后的菜青蟲形態(tài)(王曉鋒等,2011)??Figure?1.3?The?symptom?of?P.?rapae?infected?with?PrGV?(Wang?et?al.,?2011)??-7-??
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]桿狀病毒-昆蟲細(xì)胞技術(shù)在人用重組蛋白疫苗生產(chǎn)中的應(yīng)用[J]. 王偉善,吳浩飛,申碩,楊曉明. 中國生物制品學(xué)雜志. 2013(12)
[2]細(xì)胞凋亡研究進(jìn)展[J]. 閻海. 中山大學(xué)研究生學(xué)刊(自然科學(xué).醫(yī)學(xué)版). 2012(03)
[3]水稻齒葉矮縮病毒的研究進(jìn)展[J]. 鄭璐平,謝荔巖,連玲麗,謝聯(lián)輝. 中國農(nóng)業(yè)科技導(dǎo)報(bào). 2008(05)
[4]線粒體——抗病毒感染的重要細(xì)胞器[J]. 侯寧波,鐘輝,馬清鈞. 生物技術(shù)通訊. 2008(05)
[5]果蠅熱激蛋白的研究進(jìn)展[J]. 王秋香,李宗蕓,謝艷,曹慧. 昆蟲知識. 2008(05)
[6]柞蠶NPV多角體膜蛋白類似基因的克隆和序列分析[J]. 王利群,沈衛(wèi)德,李兵. 蠶業(yè)科學(xué). 2006(04)
[7]缺失p10基因的重組棉鈴蟲病毒導(dǎo)致多角體囊膜包裝不完整[J]. 董春升,鄧菲,袁麗,潘小玉,王華林,胡志紅. Virologica Sinica. 2006(06)
[8]昆蟲桿狀病毒殺蟲劑研制與應(yīng)用進(jìn)展[J]. 劉永平,王方海,蘇志堅(jiān),李廣宏. 中國生物防治. 2006(01)
[9]小菜粉蝶顆粒體病毒顆粒體蛋白基因的序列測定及在大腸桿菌中的表達(dá)[J]. 陳可,張珈敏,胡遠(yuǎn)揚(yáng),劉傳鳳. 中國病毒學(xué). 2004(05)
[10]昆蟲桿狀病毒表達(dá)系統(tǒng)的研究與應(yīng)用進(jìn)展[J]. 劉高強(qiáng),章克昌,王曉玲,魏美才. 中國生物工程雜志. 2004(07)
博士論文
[1]家蠶表皮蛋白基因的表達(dá)譜分析及表皮蛋白BmorCPT1的功能研究[D]. 梁九波.西南大學(xué) 2012
[2]菜粉蝶顆粒體病毒基因組和ODV蛋白組研究[D]. 王曉鋒.浙江大學(xué) 2012
[3]家蠶感染質(zhì)型多角體病毒差異表達(dá)基因研究[D]. 吳萍.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2010
[4]東方粘蟲顆粒體病毒和斜紋夜蛾核型多角體病毒Ⅱ基因組全序列分析[D]. 李軼女.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2008
[5]菜粉蝶顆粒體病毒的分子生物學(xué)研究[D]. 溫榮輝.廣西大學(xué) 2007
[6]BmNPV三個(gè)桿狀病毒核心基因分析[D]. 徐海君.浙江大學(xué) 2006
碩士論文
[1]家蠶桿狀病毒IAP蛋白功能的研究[D]. 陳濱.浙江理工大學(xué) 2015
[2]桿狀病毒誘導(dǎo)的斜紋蛾細(xì)胞凋亡及其機(jī)制的初步研究[D]. 杜昌升.華中師范大學(xué) 2002
本文編號:3248246
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