水稻條紋葉枯病是由灰飛虱（Laodelphax striatellus）傳播的水稻條紋病毒（rice stripe virus,RSV）侵染所致,因其危害性嚴(yán)重被稱為水稻的“癌癥”。本文利用轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)（RNA-sequencing,RNA-Seq）分析了在RSV侵染后不同抗性水平水稻品種在轉(zhuǎn)錄水平上的差異,發(fā)現(xiàn)高抗品種鎮(zhèn)稻88在接種后2天共有1748個(gè)基因上調(diào)表達(dá),829個(gè)基因下調(diào)表達(dá);在接種后10天有1694個(gè)基因上調(diào)表達(dá),1148個(gè)基因下調(diào)表達(dá);而在接種后20天則有831個(gè)基因上調(diào)表達(dá),742個(gè)基因下調(diào)表達(dá)。高感品種武育粳3號(hào)在接種后2天共有1810個(gè)基因上調(diào)表達(dá),1445個(gè)基因下調(diào)表達(dá);在接種后10天1497個(gè)基因上調(diào)表達(dá),1697個(gè)基因下調(diào)表達(dá);在接種后20天則有2523個(gè)基因上調(diào)表達(dá),1981個(gè)基因下調(diào)表達(dá)。通過數(shù)據(jù)庫KEGG（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes）分析了抗、感品種特有差異基因的代謝通路,發(fā)現(xiàn)所涉及的代謝途徑差異較大,說明RSV侵染對(duì)抗、感品種的影響是不同的,其中感病品種特有的代謝途徑有抗壞血酸和醛酸代謝、卟啉和葉... 

【文章來源】：中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京市

【文章頁數(shù)】：70 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

水稻條紋葉枯病癥狀（馮耿，2016）

中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院碩士學(xué)位論文第一章緒論3病毒通過異沙葉蟬以持久非增殖方式傳播（VACKE1961;WANGetal.,2019a）。WDV屬于雙生病毒科的玉米線條病毒屬（Mastrevirus），其基因組由單鏈環(huán)狀DNA組成（GUTIERREZ,1999）。WDV的基因組可編碼四種蛋白質(zhì)：病毒有義鏈上的外殼蛋白（CP）和運(yùn)動(dòng)蛋白（MP），以及互補(bǔ)有義鏈上的兩種復(fù)制相關(guān)蛋白（Rep和RepA）（GUTIERREZ，1999）。Rep蛋白是一種RNA沉默抑制劑，也已被證明與致病性有關(guān)（LIUetal.,2014）。圖1-2小麥矮縮病癥狀aWDV發(fā)病小麥植株；b健康小麥植株Fig.1-2Symptomsofwheatdwarfdisease.aWDV-infectedwheatplant;bHealthywheatplant1.3植物抗病機(jī)制的研究進(jìn)展1.3.1植物的抗病性植物抗病性是指植物避免、中止或阻滯病原物侵入與擴(kuò)展，減輕發(fā)病和損失程度的一類特性。生長在大自然中的每種植物都會(huì)遭到病原物的侵襲而受到不同程度的危害，有的甚至是毀滅性的。盡管如此，許多植物仍能經(jīng)受住這些侵害而存活下來，并生長良好且得到可觀的產(chǎn)量，這說明植物存在不同程度的抗病性。抗病性是植物與病原物在長期的協(xié)同進(jìn)化中相互適應(yīng)，相互選擇的結(jié)果。研究植物抗病性的目的在于了解寄主植物、病原物在環(huán)境條件影響下的相互關(guān)系，以及寄主植物如何產(chǎn)生抗病現(xiàn)象的規(guī)律性。植物抗病性完全依賴于先天免疫和抗性基因（Resistancegene,Rgene）的信號(hào)通路網(wǎng)絡(luò)（DANGletal.,2001;AUSUBEL,2005;CHISHOLMetal.,2006）。植物的防御系統(tǒng)可以分為兩類，

中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院碩士學(xué)位論文第二章水稻條紋病毒侵染后水稻抗感品種的轉(zhuǎn)錄組差異分析13圖2-1抗病品種差異基因的途徑富集分析。差異表達(dá)基因前20個(gè)富集的KEGG通路。每個(gè)圓圈的大小代表在相應(yīng)通路中富集的差異表達(dá)基因數(shù)。使用富集基因的數(shù)量除以相應(yīng)途徑中背景基因的總數(shù)來計(jì)算富集因子。使用Benjamini-Hochberg校正計(jì)算p值。P<0.05的術(shù)語被認(rèn)為是豐富的。a,2dpi上調(diào)差異基因;b,2dpi時(shí)下調(diào)差異基因;C,10dpi上調(diào)差異基因;d,10dpi下調(diào)差異基因;E，20dpi上調(diào)差異基因;F,20dpi下調(diào)差異基因。Fig.2-2PathwayEnrichmentanalysisofDEGsforZD88.Top20KEGGtermsenrichedfordifferentiallyexpressedgenes.Thesizeofeachcirclerepresentsthenumberofsignificantlydifferentiallyexpressedgenesenrichedinthecorrespondingterm.Therichfactorwascalculatedusingthenumberofenrichedgenesdividedbythetotalnumberofbackgroundgenesinthecorrespondingpathway.Thep-valuewascalculatedusingtheBenjamini-Hochbergcorrection.a,Down-regulatedDEGsofZD88at2dpi.b,Up-regulatedDEGsofZD88at2dpi.c,Down-regulatedDEGsofZD88at10dpi.d,Up-regulatedDEGsofZD88at10dpi.e,Down-regulatedDEGsofZD88at20dpi.f,Up-regulatedDEGsofZD88at20dpi.

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]水稻條紋葉枯病[J]. 李繼紅.  農(nóng)業(yè)災(zāi)害研究. 2013(05)
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本文編號(hào)：3242380