狗獾（Meles meles）屬于鼬科（Mustelidae）,狗獾屬（Meles）,為中小型穴居動(dòng)物。該物種廣泛分布于歐亞大陸,具有極強(qiáng)的環(huán)境適應(yīng)能力。先前的研究已經(jīng)表明了狗獾在野生環(huán)境和圈養(yǎng)環(huán)境下生理活動(dòng)均存在明顯的季節(jié)性差異。為了從基因表達(dá)層面了解圈養(yǎng)狗獾不同時(shí)期的差異,我們對(duì)夏季（8月）和冬季（2月）狗獾的肝臟和白色脂肪組織進(jìn)行了轉(zhuǎn)錄組測(cè)序。主要結(jié)果如下:（1）我們使用RNA-seq技術(shù)對(duì)夏季和冬季各3只圈養(yǎng)狗獾的肝臟和白色脂肪組織進(jìn)行了測(cè)序。在對(duì)原始數(shù)據(jù)進(jìn)行過(guò)濾之后,每個(gè)樣本得到了6.19Gb到8.63Gb的clean reads。我們對(duì)所有樣品進(jìn)行De nove組裝,一共得到了254659條unigenes,N50和平均長(zhǎng)度分別為2617bp和1115bp。之后對(duì)unigenes進(jìn)行功能注釋和分析,有117165個(gè)unigenes在Nr數(shù)據(jù)庫(kù)中注釋成功,占總unigenes數(shù)目的46%,有28428個(gè)（11.16%）unigenes在所有數(shù)據(jù)庫(kù)中都得到了注釋。GO注釋結(jié)果顯示,87358條unigenes被分類到生物學(xué)過(guò)程、細(xì)胞組分和分子功能三大類中。KEGG分析結(jié)果顯示6... 

【文章來(lái)源】：曲阜師范大學(xué)山東省

【文章頁(yè)數(shù)】：61 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

狗獾（引自：李健[4]

RNA表達(dá)分析技術(shù)（引自：Chaussabeletal.,2010[52]

文庫(kù)構(gòu)建流程圖

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]EYA 3和TSH β在季節(jié)性發(fā)情和常年發(fā)情綿羊中的表達(dá)模式[J]. 夏青,張效生,劉秋月,王翔宇,賀小云,郭曉飛,胡文萍,張金龍,儲(chǔ)明星,狄冉.  畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2018(02)
[2]狗獾東北亞種冬眠期與非冬眠期血液生化指標(biāo)的對(duì)比研究[J]. 馮成武,李彥東,王冬梅,鄒愛(ài)紅,劉玉堂.  野生動(dòng)物學(xué)報(bào). 2017(04)
[3]冬眠期和非冬眠期狗獾體內(nèi)脂肪酸組成檢測(cè)與比較[J]. 厲威池,王素,馮成武,施銀,全瑩瑩,姜楠,劉玉堂.  黑龍江畜牧獸醫(yī). 2017(05)
[4]冬眠期狗獾油脂肪酸組成分析及安全性動(dòng)物試驗(yàn)[J]. 施銀,陳若晞,全瑩瑩,姜楠,厲威池,劉玉堂.  中國(guó)油脂. 2015(05)
[5]RNA測(cè)序的研究進(jìn)展[J]. 王康宇,王義,孫春玉,蔣世翠,張美萍.  江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2014(10)
[6]非模式生物轉(zhuǎn)錄組研究[J]. 劉紅亮,鄭麗明,劉青青,權(quán)富生,張涌.  遺傳. 2013(08)
[7]轉(zhuǎn)錄組與RNA-Seq技術(shù)[J]. 張春蘭,秦孜娟,王桂芝,紀(jì)志賓,王建民.  生物技術(shù)通報(bào). 2012(12)
[8]基因表達(dá)系列分析技術(shù)在動(dòng)物科學(xué)中的研究進(jìn)展[J]. 田勇,盧立志.  生命科學(xué). 2012(10)
[9]第三代測(cè)序基本原理[J]. 李明爽,趙敏.  現(xiàn)代生物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2012(10)
[10]轉(zhuǎn)錄組研究新技術(shù):RNA-Seq及其應(yīng)用[J]. 祁云霞,劉永斌,榮威恒.  遺傳. 2011(11)

博士論文
[1]基于轉(zhuǎn)錄組和蛋白組數(shù)據(jù)鑒定豬肌肉生長(zhǎng)和脂肪沉積相關(guān)的基因[D]. 王志秀.中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[2]基于血液轉(zhuǎn)錄組分析的狼（Canis lupus）免疫系統(tǒng)和高原適應(yīng)研究[D]. 劉廣帥.東北林業(yè)大學(xué) 2017

碩士論文
[1]張廣才嶺狗獾食性的研究[D]. 陳耕.東北林業(yè)大學(xué) 2015
[2]引入狗獾（Meles meles）活動(dòng)規(guī)律及行為的研究[D]. 崔勇勇.華東師范大學(xué) 2013
[3]張廣才嶺狗獾生境選擇[D]. 楊會(huì)濤.東北林業(yè)大學(xué) 2010



本文編號(hào)：3226277