基于轉(zhuǎn)錄組的蘋小卷葉蛾殺蟲(chóng)劑靶標(biāo)及解毒代謝相關(guān)基因分析
發(fā)布時(shí)間:2021-05-17 23:45
【目的】建立蘋小卷葉蛾Adoxophyes orana轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫(kù),挖掘殺蟲(chóng)劑靶標(biāo)及解毒代謝相關(guān)基因!痉椒ā坎捎肐llumina HiSeqTM 2000高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)蘋小卷葉蛾進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,挖掘并分析殺蟲(chóng)劑靶標(biāo)基因;利用qPCR檢測(cè)6個(gè)殺蟲(chóng)劑靶標(biāo)基因在蘋小卷葉蛾卵、幼蟲(chóng)、蛹和成蟲(chóng)各不同發(fā)育階段的表達(dá);挖掘并分析蘋小卷葉蛾轉(zhuǎn)錄組中解毒代謝相關(guān)基因的代謝通路及進(jìn)化關(guān)系!窘Y(jié)果】通過(guò)組裝有效序列共獲得48 610條unigene(GenBank登錄號(hào):GGMW00000000)。挖掘鑒定到155個(gè)殺蟲(chóng)劑靶標(biāo)unigene;qPCR結(jié)果顯示,1個(gè)蛻皮激素受體(ecdysone receptor, ECR)、2個(gè)乙酰膽堿酯酶(acetylcholinesterase, AChE)、1個(gè)氯離子通道蛋白(chloride channel, CLC)、1個(gè)幾丁質(zhì)酶(chitinase, CS)和1個(gè)魚(yú)尼丁受體(ryanodine receptor, RyR)基因在蘋小卷葉蛾不同發(fā)育階段均存在表達(dá)差異。挖掘鑒定到69個(gè)羧酸酯酶(carboxylesterase, CarE)...
【文章來(lái)源】:昆蟲(chóng)學(xué)報(bào). 2020,63(04)北大核心CSCD
【文章頁(yè)數(shù)】:12 頁(yè)
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 害蟲(chóng)飼養(yǎng)
1.2 cDNA文庫(kù)構(gòu)建和測(cè)序
1.3 生物信息學(xué)分析
1.4 殺蟲(chóng)劑靶標(biāo)基因的鑒定及表達(dá)模式分析
1.5 解毒代謝相關(guān)基因的挖掘及代謝通路、進(jìn)化關(guān)系分析
1.6 數(shù)據(jù)分析
2 結(jié)果
2.1 蘋小卷葉蛾轉(zhuǎn)錄組組裝結(jié)果
2.2 蘋小卷葉蛾轉(zhuǎn)錄組中unigenes的功能注釋及序列特征
2.3 蘋小卷葉蛾轉(zhuǎn)錄組中殺蟲(chóng)劑靶標(biāo)基因的預(yù)測(cè)及表達(dá)模式分析
2.4 蘋小卷葉蛾轉(zhuǎn)錄組中解毒代謝相關(guān)基因的挖掘、代謝通路及進(jìn)化關(guān)系分析
3 討論
本文編號(hào):3192687
【文章來(lái)源】:昆蟲(chóng)學(xué)報(bào). 2020,63(04)北大核心CSCD
【文章頁(yè)數(shù)】:12 頁(yè)
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 害蟲(chóng)飼養(yǎng)
1.2 cDNA文庫(kù)構(gòu)建和測(cè)序
1.3 生物信息學(xué)分析
1.4 殺蟲(chóng)劑靶標(biāo)基因的鑒定及表達(dá)模式分析
1.5 解毒代謝相關(guān)基因的挖掘及代謝通路、進(jìn)化關(guān)系分析
1.6 數(shù)據(jù)分析
2 結(jié)果
2.1 蘋小卷葉蛾轉(zhuǎn)錄組組裝結(jié)果
2.2 蘋小卷葉蛾轉(zhuǎn)錄組中unigenes的功能注釋及序列特征
2.3 蘋小卷葉蛾轉(zhuǎn)錄組中殺蟲(chóng)劑靶標(biāo)基因的預(yù)測(cè)及表達(dá)模式分析
2.4 蘋小卷葉蛾轉(zhuǎn)錄組中解毒代謝相關(guān)基因的挖掘、代謝通路及進(jìn)化關(guān)系分析
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