煙草青枯病抗病的動態(tài)QTL分析
發(fā)布時間:2021-05-17 01:48
為檢測控制煙草青枯病抗性動態(tài)變化的QTLs,以大葉密合×長脖黃建立的158份F6代重組自交系(RIL)群體為研究對象,利用SSR和InDel標記進行基因分型,并運用JoinMap 4構建一個含有24個連鎖群、覆蓋2269.3 cM的遺傳圖譜;該圖譜含有546個SSR和80個In Del標記,平均標記密度達到了3.63 cM/標記。結合2016和2017連續(xù)兩年不同調查期各株系的病情指數,使用Win QTLcart 2.5軟件的復合區(qū)間作圖法(CIM)進行QTL定位,在2016年的4個調查期中分別檢測到4、4、6和4個青枯病抗病QTLs,其表型變異解釋率在5.03%~13.07%之間;而在2017年的4個調查期分別定位到7、3、6和6個青枯病抗病QTLs,其表型變異解釋率在4.63%~18.18%之間。兩年共檢測到28個青枯病抗病QTLs,其中有7個QTLs在不同調查期中被重復定位,但沒有一個QTL可以在所有調查期中出現;另外,不同調查期檢測到QTL的數目與表達效應存在較大差異。這些結果表明煙草在發(fā)病的不同階段可能有不同的抗性基因發(fā)揮作用,且其表達具有一定的時序性。
【文章來源】:中國煙草科學. 2020,41(03)北大核心CSCD
【文章頁數】:8 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 群體構建及抗性鑒定
1.2 田間試驗
1.3 抗性鑒定
1.4 DNA提取與基因分型
1.5 遺傳圖譜的構建和QTL定位
2 結果
2.1 重組自交系群體的田間抗病性評價
2.2 遺傳連鎖圖譜構建
2.3 不同發(fā)病時期煙草青枯病抗性QTL的定位分析
3 討論
4 結論
【參考文獻】:
期刊論文
[1]連鎖與連鎖不平衡聯(lián)合作圖解析煙草青枯病抗性遺傳變異[J]. 賴瑞強,李榮華,夏巖石,郭培國,袁清華,趙偉才,張振臣. 中國煙草科學. 2019(06)
[2]基于RAD-seq數據開發(fā)煙草多態(tài)性SSR標記[J]. 李海洋,李榮華,夏巖石,袁清華,張振臣,趙偉才,郭培國. 中國煙草科學. 2018(01)
[3]煙草品種大葉密合抗青枯病相關QTL的檢測[J]. 袁清華,馬柱文,張振臣,李集勤,李淑玲,郭培國,邱妙文,李榮華,趙偉才,陳俊標. 中國煙草學報. 2018(03)
[4]一種快速有效檢測SSR標記的非變性聚丙烯酰胺凝膠的銀染方法[J]. 郭培國,劉文杰,李海洋,王直亮,夏巖石,李榮華. 廣州大學學報(自然科學版). 2016(04)
[5]InDel標記的研究和應用進展[J]. 楊潔,赫佳,王丹碧,施恩,楊文宇,耿其芳,王中生. 生物多樣性. 2016(02)
[6]小麥籽粒干物質積累的動態(tài)QTL定位[J]. 李美霞,沈瑋囡,楊睿,梁子英,孫風麗,奚亞軍,王竹林,劉曙東. 西北植物學報. 2014(06)
[7]廣東抗青枯病煙草資源篩選[J]. 張振臣,鄧海濱,劉瓊光,馬柱文,袁清華,謝銳鴻,李集勤,陳俊標. 廣東農業(yè)科學. 2014(07)
[8]小麥籽粒蛋白質含量的動態(tài)QTL定位[J]. 朱占玲,劉賓,田賓,謝全剛,李文福,田紀春. 中國農業(yè)科學. 2011(15)
[9]小麥株高發(fā)育動態(tài)QTL定位[J]. 劉賓,趙亮,張坤普,朱占玲,田賓,田紀春. 中國農業(yè)科學. 2010(22)
[10]改進的CTAB提取植物DNA方法[J]. 李榮華,夏巖石,劉順枝,孫莉麗,郭培國,繆紳裕,陳健輝. 實驗室研究與探索. 2009(09)
本文編號:3190830
【文章來源】:中國煙草科學. 2020,41(03)北大核心CSCD
【文章頁數】:8 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 群體構建及抗性鑒定
1.2 田間試驗
1.3 抗性鑒定
1.4 DNA提取與基因分型
1.5 遺傳圖譜的構建和QTL定位
2 結果
2.1 重組自交系群體的田間抗病性評價
2.2 遺傳連鎖圖譜構建
2.3 不同發(fā)病時期煙草青枯病抗性QTL的定位分析
3 討論
4 結論
【參考文獻】:
期刊論文
[1]連鎖與連鎖不平衡聯(lián)合作圖解析煙草青枯病抗性遺傳變異[J]. 賴瑞強,李榮華,夏巖石,郭培國,袁清華,趙偉才,張振臣. 中國煙草科學. 2019(06)
[2]基于RAD-seq數據開發(fā)煙草多態(tài)性SSR標記[J]. 李海洋,李榮華,夏巖石,袁清華,張振臣,趙偉才,郭培國. 中國煙草科學. 2018(01)
[3]煙草品種大葉密合抗青枯病相關QTL的檢測[J]. 袁清華,馬柱文,張振臣,李集勤,李淑玲,郭培國,邱妙文,李榮華,趙偉才,陳俊標. 中國煙草學報. 2018(03)
[4]一種快速有效檢測SSR標記的非變性聚丙烯酰胺凝膠的銀染方法[J]. 郭培國,劉文杰,李海洋,王直亮,夏巖石,李榮華. 廣州大學學報(自然科學版). 2016(04)
[5]InDel標記的研究和應用進展[J]. 楊潔,赫佳,王丹碧,施恩,楊文宇,耿其芳,王中生. 生物多樣性. 2016(02)
[6]小麥籽粒干物質積累的動態(tài)QTL定位[J]. 李美霞,沈瑋囡,楊睿,梁子英,孫風麗,奚亞軍,王竹林,劉曙東. 西北植物學報. 2014(06)
[7]廣東抗青枯病煙草資源篩選[J]. 張振臣,鄧海濱,劉瓊光,馬柱文,袁清華,謝銳鴻,李集勤,陳俊標. 廣東農業(yè)科學. 2014(07)
[8]小麥籽粒蛋白質含量的動態(tài)QTL定位[J]. 朱占玲,劉賓,田賓,謝全剛,李文福,田紀春. 中國農業(yè)科學. 2011(15)
[9]小麥株高發(fā)育動態(tài)QTL定位[J]. 劉賓,趙亮,張坤普,朱占玲,田賓,田紀春. 中國農業(yè)科學. 2010(22)
[10]改進的CTAB提取植物DNA方法[J]. 李榮華,夏巖石,劉順枝,孫莉麗,郭培國,繆紳裕,陳健輝. 實驗室研究與探索. 2009(09)
本文編號:3190830
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