高效、快速提取高質(zhì)量稻曲病菌基因組DNA方法
發(fā)布時(shí)間:2021-05-11 03:30
稻曲病菌[Ustilaginoidea virens (Cooke) Takahashi]培養(yǎng)期間菌絲生長(zhǎng)緩慢,且產(chǎn)生大量次生代謝產(chǎn)物,嚴(yán)重影響提取稻曲病菌基因組DNA質(zhì)量與效率。將一步式提取法(Rapid one-step extraction,ROSE)增加異丙醇、NaAc冷凍沉淀DNA和70%無水乙醇漂洗DNA兩個(gè)步驟,建立一種高效、快速提取高質(zhì)量稻曲病菌基因組DNA的方法,即改良ROSE法,并將該方法與稻曲病菌基因組DNA傳統(tǒng)提取方法(CTAB法、SDS法、試劑盒法和改良脲素法)在提取步驟、DNA純度與得率、PCR反應(yīng)和酶切效率等方面加以比較。結(jié)果表明,5種方法均得到稻曲病菌基因組DNA,但改良ROSE法同時(shí)具有無毒、環(huán)保、低成本、快速獲取高質(zhì)量DNA的優(yōu)點(diǎn)。改良ROSE法s可用于稻曲病菌分子標(biāo)記、遺傳圖譜構(gòu)建等需短時(shí)間內(nèi)快速獲取DNA的分子試驗(yàn)研究,也適用于稻曲病菌基因精細(xì)定位、克隆和測(cè)序等需高質(zhì)量DNA的分子試驗(yàn)。
【文章來源】:東北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2020,51(03)北大核心CSCD
【文章頁(yè)數(shù)】:7 頁(yè)
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 材料
1.1.1 供試菌株
1.1.2 供試藥劑
1.1.3 供試培養(yǎng)基
1.2 方法
1.2.1 菌絲收集
1.2.2 稻曲病菌DNA提取方法
1.2.2. 1 CTAB法
1.2.2. 2 SDS法
1.2.2. 3 試劑盒法
1.2.2. 4 改良脲素法
1.2.2. 5 改良ROSE法
1.2.3 紫外光分光光度計(jì)檢測(cè)
1.2.4 DNA瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)
1.2.5 PCR檢測(cè)
1.2.6 Eco RⅠ限制性內(nèi)切酶酶切反應(yīng)
2 結(jié)果與分析
2.1 不同方法提取步驟、成本、毒性、耗時(shí)比較
2.2 不同方法提取DNA質(zhì)量比較
2.3 DNA瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)
2.4 PCR檢測(cè)
2.5 Eco RⅠ限制性內(nèi)切酶酶切檢測(cè)
3 討論與結(jié)論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Ustilaginoidea virens: A Fungus Infects Rice Flower and Threats World Rice Production[J]. QIU Jiehua,MENG Shuai,DENG Yizhen,HUANG Shiwen,KOU Yanjun. Rice Science. 2019(04)
[2]稻曲病菌基因組DNA提取方法比較與小文庫(kù)構(gòu)建[J]. 伏榮桃,王劍,陳誠(chéng),龔學(xué)書,盧代華,羅曦,鄭愛萍. 生物技術(shù)通報(bào). 2018(04)
[3]不同方法對(duì)甜菜葉片基因組DNA提取效果比較與適用性探討[J]. 王希,陳麗,趙春雷,李彥麗,丁廣洲,賈海倫,徐杰,廖鵬. 中國(guó)糖料. 2015(05)
[4]三種DNA提取方法對(duì)檢測(cè)草莓鑲脈病毒穩(wěn)定性的研究[J]. 冉策,陳柳,陸家蘭,劉正坪,魏艷敏,趙曉燕,尚巧霞. 華北農(nóng)學(xué)報(bào). 2015(03)
[5]秈粳交超級(jí)晚粳稻稻曲病藥劑控制時(shí)機(jī)的探討[J]. 陳月娣,王超,徐鐵平,周宇杰,徐越堅(jiān),蔡國(guó)梁. 浙江農(nóng)業(yè)科學(xué). 2013(11)
[6]蘋果球殼孢腐爛病菌DNA不同提取方法的比較[J]. 賀羽,李鑫,王有福,趙前程. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2012(06)
[7]大豆種子DNA快速提取方法的改良及應(yīng)用[J]. 朱振雷,束永俊,李勇,柏錫,才華,紀(jì)巍,朱延明. 東北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2009(10)
[8]甜菜基因組DNA的提取及Southern雜交分析[J]. 侯靜,馬鳳鳴,陳勝勇,丁廣洲,李彩鳳. 東北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2008(12)
碩士論文
[1]四川省秈稻區(qū)水稻稻曲病菌遺傳多樣性分析及稻曲病防治技術(shù)研究[D]. 李競(jìng)生.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009
本文編號(hào):3180630
【文章來源】:東北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2020,51(03)北大核心CSCD
【文章頁(yè)數(shù)】:7 頁(yè)
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 材料
1.1.1 供試菌株
1.1.2 供試藥劑
1.1.3 供試培養(yǎng)基
1.2 方法
1.2.1 菌絲收集
1.2.2 稻曲病菌DNA提取方法
1.2.2. 1 CTAB法
1.2.2. 2 SDS法
1.2.2. 3 試劑盒法
1.2.2. 4 改良脲素法
1.2.2. 5 改良ROSE法
1.2.3 紫外光分光光度計(jì)檢測(cè)
1.2.4 DNA瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)
1.2.5 PCR檢測(cè)
1.2.6 Eco RⅠ限制性內(nèi)切酶酶切反應(yīng)
2 結(jié)果與分析
2.1 不同方法提取步驟、成本、毒性、耗時(shí)比較
2.2 不同方法提取DNA質(zhì)量比較
2.3 DNA瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)
2.4 PCR檢測(cè)
2.5 Eco RⅠ限制性內(nèi)切酶酶切檢測(cè)
3 討論與結(jié)論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Ustilaginoidea virens: A Fungus Infects Rice Flower and Threats World Rice Production[J]. QIU Jiehua,MENG Shuai,DENG Yizhen,HUANG Shiwen,KOU Yanjun. Rice Science. 2019(04)
[2]稻曲病菌基因組DNA提取方法比較與小文庫(kù)構(gòu)建[J]. 伏榮桃,王劍,陳誠(chéng),龔學(xué)書,盧代華,羅曦,鄭愛萍. 生物技術(shù)通報(bào). 2018(04)
[3]不同方法對(duì)甜菜葉片基因組DNA提取效果比較與適用性探討[J]. 王希,陳麗,趙春雷,李彥麗,丁廣洲,賈海倫,徐杰,廖鵬. 中國(guó)糖料. 2015(05)
[4]三種DNA提取方法對(duì)檢測(cè)草莓鑲脈病毒穩(wěn)定性的研究[J]. 冉策,陳柳,陸家蘭,劉正坪,魏艷敏,趙曉燕,尚巧霞. 華北農(nóng)學(xué)報(bào). 2015(03)
[5]秈粳交超級(jí)晚粳稻稻曲病藥劑控制時(shí)機(jī)的探討[J]. 陳月娣,王超,徐鐵平,周宇杰,徐越堅(jiān),蔡國(guó)梁. 浙江農(nóng)業(yè)科學(xué). 2013(11)
[6]蘋果球殼孢腐爛病菌DNA不同提取方法的比較[J]. 賀羽,李鑫,王有福,趙前程. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2012(06)
[7]大豆種子DNA快速提取方法的改良及應(yīng)用[J]. 朱振雷,束永俊,李勇,柏錫,才華,紀(jì)巍,朱延明. 東北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2009(10)
[8]甜菜基因組DNA的提取及Southern雜交分析[J]. 侯靜,馬鳳鳴,陳勝勇,丁廣洲,李彩鳳. 東北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2008(12)
碩士論文
[1]四川省秈稻區(qū)水稻稻曲病菌遺傳多樣性分析及稻曲病防治技術(shù)研究[D]. 李競(jìng)生.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009
本文編號(hào):3180630
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