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40株尖鐮孢菌SRAP遺傳多樣性分析

發(fā)布時間:2021-04-28 21:59
  [目的]明確尖鐮孢菌種內(nèi)遺傳多樣性與親緣關(guān)系為尖鐮孢菌的分類鑒定及該類病害綜合防控提供理論依據(jù)。[方法]本試驗利用篩選出的12對SRAP引物,對40株尖鐮孢菌進行PCR擴增,用POPGENE Version 1.32軟件計算遺傳多樣性參數(shù),用NTSYS-pc Version 2.10s軟件對供試菌株進行聚類分析與主成分分析。[結(jié)果]共擴增出125個譜帶,多態(tài)性位點比例達100%,平均每對引物產(chǎn)生多態(tài)性條帶10.4條。供試菌株的平均Nei’s基因多樣性指數(shù)(H)和Shannon信息指數(shù)(I)分別為0.1 876和0.3 139。晉中地區(qū)菌株的Nei’s基因多樣性指數(shù)和Shannon’s指數(shù)均最大(0.172,0.2876),遺傳分化水平最高,多樣性最豐富。地理群體間遺傳分化系數(shù)(Gst)和基因流(Nm)分別為0.3 106、1.1 098,省內(nèi)3個居群間的遺傳距離較其與河北居群間的遺傳距離近,表明4個尖鐮孢菌群體間存在一定的遺傳分化,群體內(nèi)遺傳多樣性大于群體間的多樣性。地理群體間遺傳距離與地理距離存在一定的相關(guān)性。聚類與主成分分析結(jié)果表明,菌株SRAP類群劃分與其寄主和地理來源沒有明顯相... 

【文章來源】:山西農(nóng)業(yè)大學學報(自然科學版). 2020,40(05)北大核心

【文章頁數(shù)】:9 頁

【文章目錄】:
1 材料與方法
    1.1 試驗材料
        1.1.1 供試菌株
    1.2 試驗方法
        1.2.1 供試菌株培養(yǎng)與菌株DNA提取
        1.2.2 供試菌株的SRAP-PCR擴增
    1.3 數(shù)據(jù)分析
2 結(jié)果與分析
    2.1 引物篩選與供試菌株的遺傳多樣性分析
    2.2 不同地理來源尖鐮孢菌遺傳多樣性分析
    2.3 不同地理來源尖鐮孢菌的遺傳一致度和遺傳距離分析
    2.4 晉中地區(qū)不同寄主來源尖鐮孢菌遺傳多樣性分析
    2.5 供試尖鐮孢菌遺傳相似性與聚類分析
    2.6 供試尖鐮孢菌主成分分析(PCA)
3 結(jié)論與討論


【參考文獻】:
期刊論文
[1]基于SRAP分子標記的24個黑木耳栽培菌株遺傳分析[J]. 史靈燕,張云龍,劉保衛(wèi),鄭素月.  食用菌. 2019(06)
[2]西瓜枯萎病菌遺傳多樣性的相關(guān)序列擴增多態(tài)性分析[J]. 劉麗芳,肖姬玲,張屹,朱菲瑩,魏林,梁志懷.  植物保護. 2018(05)
[3]四川省不同地域的核盤菌遺傳多樣性分析[J]. 楊瀟湘,梁潔,黃小琴,張蕾,伍文憲,周西全,劉勇.  植物病理學報. 2019(02)
[4]基于SRAP標記的黃瓜霜霉菌遺傳多樣性分析[J]. 白玲玲,劉行風,陳政瑜,周瑩瑩,劉麗,張艷菊,張奧,楊森.  植物保護. 2017(04)
[5]瓜類枯萎病菌遺傳多樣性和親緣關(guān)系的SRAP分析[J]. 田葉韓,侯圓圓,彭彩云,王永陽,何邦令,高克祥.  應用生態(tài)學報. 2017(03)
[6]尖鐮孢菌EST-SSR遺傳多樣性分析及通用性評價[J]. 李新鳳,王建明,張作剛,郝曉娟,張祖維,田宏先.  植物保護學報. 2015(05)
[7]四川西南部小麥白粉菌群體毒性及遺傳多樣性分析[J]. 雷雨,劉娜,龔國淑,張敏,王旭,祁小波,周游,陳華保,楊繼芝,游琴,劉燁玨.  植物病理學報. 2015(05)
[8]水稻茄絲核菌SRAP引物篩選與體系優(yōu)化[J]. 劉志恒,胡積祥,侯悅,黃欣陽,魏松紅.  植物保護學報. 2013(05)
[9]33株尖孢鐮刀菌遺傳多樣性的ISSR分析[J]. 張述義,李新鳳,韋曉艷,王建明.  生態(tài)學雜志. 2013(05)
[10]遼寧省辣椒疫病菌多態(tài)性及致病力分化研究初探[J]. 王輝,劉長遠,趙奎華,孫軍德.  微生物學通報. 2012(02)

博士論文
[1]山西鐮刀菌種類鑒定及遺傳多樣性分析研究[D]. 李新鳳.山西農(nóng)業(yè)大學 2013



本文編號:3166247

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