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水稻自然群體苗瘟和穗瘟抗性的全基因組關(guān)聯(lián)分析

發(fā)布時間:2021-04-27 19:09
  水稻(Oryza sativa L.)是世界上主要糧食作物之一,稻瘟病是由真菌Magnaporthe oryzea引起的水稻重要病害之一。在水稻整個生長周期中都有發(fā)生,其中以苗瘟和穗瘟的發(fā)生更加普遍。實踐證明,挖掘和鑒定廣譜、高抗稻瘟病基因,培育、推廣抗稻瘟病水稻品種是防控稻瘟病最為經(jīng)濟有效的措施。然而,稻瘟病菌的致病性極易變異,攜帶單個抗性基因的水稻品種在推廣種植3-5年后便失效,其抗瘟性會下降甚至喪失。因此,需要鑒定和挖掘新的抗稻瘟病基因,尤其是具有持久抗病性的基因,培育和推廣具有持久抗病性的水稻品種,對于控制稻瘟病的發(fā)生、穩(wěn)定水稻產(chǎn)量具有很重要的意義。全基因組關(guān)聯(lián)分析(Genome-Wide Association Study,GWAS)方法以大量表型數(shù)據(jù)和分子標記數(shù)據(jù)作為支撐,找到與性狀相關(guān)聯(lián)的SNP(Single Nucleotide Polymorphisms)位點,進一步對SNP位點內(nèi)的候選基因進行預(yù)測和分析,找到相關(guān)性狀控制的關(guān)鍵基因,具有省時且效率高的特點,在有利基因發(fā)掘和鑒定研究中有很好地應(yīng)用前景。本研究對201份已測序的水稻自然群體材料的苗瘟抗性進行全基因組關(guān)聯(lián)分... 

【文章來源】:南京農(nóng)業(yè)大學(xué)江蘇省 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】:80 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第一部分 文獻綜述
    第一章 水稻抗稻瘟病研究進展
        1.1 稻瘟病的發(fā)生與危害
        1.2 水稻抗稻瘟病基因的鑒定
        1.3 水稻抗稻瘟病基因的克隆和功能研究
    第二章 水稻全基因組關(guān)聯(lián)分析研究
        2.1 全基因關(guān)聯(lián)分析方法及試驗設(shè)計
        2.2 全基因組關(guān)聯(lián)分析的一般步驟
            2.2.1 種質(zhì)材料的選擇
            2.2.2 目標性狀選擇
            2.2.3 群體結(jié)構(gòu)分析
            2.2.4 表型性狀鑒定
            2.2.5 基因型測定
        2.3 水稻全基因關(guān)聯(lián)分析的研究進展
第二部分 研究報告
    第三章 水稻苗瘟抗性的全基因組關(guān)聯(lián)分析
        3.1 材料與方法
            3.1.1 供試品種
            3.1.2 供試菌株
            3.1.3 稻瘟病菌的培養(yǎng)
            3.1.4 幼苗培育
            3.1.5 接種
            3.1.6 病情調(diào)查
            3.1.7 群體材料分析
            3.1.8 全基因組關(guān)聯(lián)分析
            3.1.9 關(guān)聯(lián)SNP位點、候選基因
        3.2 結(jié)果與分析
            3.2.1 苗瘟抗性表型數(shù)據(jù)分析
            3.2.2 苗期稻瘟病抗性的全基因組關(guān)聯(lián)分析
        3.3 討論
    第四章 水稻穗瘟抗性的全基因組關(guān)聯(lián)分析
        4.1 材料與方法
            4.1.1 供試品種
            4.1.2 供試菌株
            4.1.3 稻瘟病菌的培養(yǎng)
            4.1.4 幼苗培育
            4.1.5 接種
            4.1.6 穗瘟表型鑒定
            4.1.7 群體材料分析
            4.1.8 全基因組關(guān)聯(lián)分析
            4.1.9 關(guān)聯(lián)SNP位點、候選基因
        4.2 結(jié)果與分析
            4.2.1 穗瘟抗性表型數(shù)據(jù)分析
            4.2.2 穗瘟數(shù)據(jù)表型-SNP標記的全基因組關(guān)聯(lián)分析
        4.3 討論
全文結(jié)論
創(chuàng)新之處
參考文獻
附表1
附表2
致謝


【參考文獻】:
期刊論文
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[7]關(guān)聯(lián)分析在作物種質(zhì)資源分子評價中的應(yīng)用[J]. 王榮煥,王天宇,黎裕.  植物遺傳資源學(xué)報. 2007(03)
[8]水稻稻瘟病抗性基因定位與克隆研究進展[J]. 劉占領(lǐng),雷財林,程治軍,李偉,王久林,時克.  作物雜志. 2007(03)
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[10]水稻稻瘟病菌有性世代形成條件的優(yōu)化[J]. 張國珍,馬秋娟,彭友良.  植物病理學(xué)報. 2002(02)



本文編號:3164005

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