小麥品種西農(nóng)979對(duì)赤霉病具有較好的抗性。為了發(fā)掘西農(nóng)979的抗赤霉病基因,本研究采用禾谷鐮刀菌菌株BN-8分別接種抗病品種西農(nóng)979與感病品種周麥18,取接種前西農(nóng)979穎殼及接種后12、24和96 h的西農(nóng)979與周麥18穎殼進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組分析,篩選抗感赤霉病差異表達(dá)基因,并對(duì)其進(jìn)行GO功能注釋及KEGG富集分析。結(jié)果表明,接種后12、24和96 h各出現(xiàn)14、1 978和142個(gè)差異表達(dá)基因,共計(jì)2 122個(gè)基因。這些基因經(jīng)GO功能注釋分類分成3大類43個(gè)亞類,主要涉及代謝過程、細(xì)胞過程、應(yīng)激反應(yīng)、生物調(diào)控、細(xì)胞部件、細(xì)胞、催化活性、結(jié)合、轉(zhuǎn)運(yùn)活性等。KEGG通路分析結(jié)果顯示,內(nèi)質(zhì)網(wǎng)中的蛋白質(zhì)加工通路中差異基因最多,有48個(gè);其次是光合作用—天線蛋白通路及淀粉和蔗糖代謝通路,各含41和30個(gè)差異基因;顯著富集的通路有光合作用—天線蛋白、內(nèi)質(zhì)網(wǎng)中的蛋白質(zhì)加工、萜骨架的生物合成等。植物激素信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路中發(fā)現(xiàn)27個(gè)差異基因,參與脫落酸和茉莉酸等路徑;植物-病原體互作通路中發(fā)現(xiàn)19個(gè)差異基因,編碼鈣結(jié)合蛋白、WRKY轉(zhuǎn)錄因子、抗病蛋白等。此外,還篩選到UDP-葡萄糖基轉(zhuǎn)移酶基因等脫毒相關(guān)蛋白... 

【文章來源】：麥類作物學(xué)報(bào). 2020,40(06)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：11 頁

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 供試材料
    1.2 赤霉病田間鑒定方法
    1.3 轉(zhuǎn)錄組測序樣品的準(zhǔn)備
    1.4 RNA提取和反轉(zhuǎn)錄
    1.5 轉(zhuǎn)錄組測序及基因表達(dá)定量分析
    1.6 差異表達(dá)基因的篩選和功能注釋
    1.7 熒光定量PCR驗(yàn)證差異表達(dá)基因
2 結(jié)果與分析
    2.1 西農(nóng)979和周麥18田間抗病性鑒定結(jié)果
    2.2 轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)及其質(zhì)量控制
    2.3 差異表達(dá)基因分析
    2.4 共同差異表達(dá)基因的GO功能注釋
    2.5 共同差異基因的KEGG通路富集分析
    2.6 共同差異表達(dá)基因的功能歸類及表達(dá)
    2.7 差異表達(dá)基因的熒光定量PCR驗(yàn)證
3 討 論


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]Characterization of a PDR type ABC transporter gene from wheat （Triticum aestivum L.）[J]. SHANG Yi1,2, XIAO Jin1, MA LuLin1, WANG HaiYan1, QI ZengJun1, CHEN PeiDu1, LIU DaJun1 & WANG XiuE11 State Key Laboratory of Crop Genetics and Germplasm Enhancement, Cytogenetics Institute, Nanjing Agricultural University, Nanjing 210095, China; 2 Institute of Crop Research and Nuclear Technique Utilization, Zhejiang Academy of Agricultural Science, Hangzhou 310021, China.  Chinese Science Bulletin. 2009(18)
[2]小麥抗赤霉病性田間自然鑒定與抗赤霉病育種中的問題[J]. 方毅敏,肖碧玉,黃繼平,許文真,朱涵.  植物保護(hù)學(xué)報(bào). 1999(04)
[3]我國小麥赤霉病穗部鐮刀菌種類、分布及致病性[J]. All China Corporation of Research on Wheat Scab.  上海師范學(xué)院學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 1984(03)

博士論文
[1]小麥抗赤霉病相關(guān)基因的克隆及功能分析[D]. 馬信.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014



本文編號(hào)：3152877