褐飛虱和白背飛虱唾液腺轉(zhuǎn)錄組分析
發(fā)布時間:2021-04-18 20:34
褐飛虱Nilaparvata lugens(Stal)和白背飛虱Sogatella furcifera(Horvath)是兩種危害水稻的刺吸式害蟲,不僅刺吸寄主植物汁液還可傳播多種病毒病。有研究表明,其唾液在其危害過程中發(fā)揮著重要的作用。本研究從昆蟲分子生理角度入手,利用高通量測序的方法獲得褐飛虱和白背飛虱的唾液腺轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),通過生物信息學(xué)分析,篩選出了唾液腺中可能與昆蟲取食和抵御植物防御反應(yīng)等有關(guān)的重要基因。并利用qPCR分析了這些基因在稻飛虱不同組織部位的表達(dá)譜。另外,利用RNAi技術(shù)驗證了白背飛虱唾液腺特異表達(dá)基因——多銅氧化酶4(multicopper oxidase 4,MC04),為研究其在白背飛虱-水稻互作中的作用奠定了基礎(chǔ)。主要研究結(jié)果如下:(1)對褐飛虱的唾液腺轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行了高通量測序褐飛虱唾液腺轉(zhuǎn)錄組測序獲得了 55,913條序列,平均長度為751 bp,得到45,421條Unigene,平均長度為668 bp,16,210條序列在(占所有Unigene總數(shù)的35.68%)Nr數(shù)據(jù)庫中得到注釋,12,758條序列有GO注釋,KEGG通路中有6,917條unigene被...
【文章來源】:福建農(nóng)林大學(xué)福建省
【文章頁數(shù)】:89 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖2-2褐飛虱唾液腺基因GO功能分類圖??GO劃分為“參與生物過程”、“基因分子功能”、“細(xì)胞組成成分”三個本體,y軸表示各子條??目中Unigenc的數(shù)量
褐飛虱和白背飛虱唾液腺轉(zhuǎn)錄組分析??2.3.6候選內(nèi)參基因的穩(wěn)定性分析??2.3.6.1熒光定量引物擴(kuò)增效率??首先使用普通的RT-PCR對實驗引物進(jìn)行檢驗,得到單…擴(kuò)增、目的條帶清晰且??引物一.聚體較少的理想結(jié)果(圖2-4)。另外熒光定量PCR溶解丨丨1|線分析結(jié)果也顯示,??該實驗引物質(zhì)量高,1:1無非特異性擴(kuò)增。為丫獲得引物的擴(kuò)增效率,將模板cDNA做??了?6個5倍梯度稀釋(5°,?5'?5之5'?5'?5-5),以模板稀釋倍數(shù)的Log值為橫坐??標(biāo),Ct值為縱坐標(biāo)構(gòu)建標(biāo)準(zhǔn)曲線,標(biāo)準(zhǔn)曲線的相關(guān)系數(shù)R2>〇.98,結(jié)果可信度越高,根??據(jù)斜率計算擴(kuò)增效率,并將其列在表2-1中。??|^|??圖2-4熒光定量引物凝膠電泳圖??M?為?DL2000?Marker。??Figure?2-4?Agrose?gel?electrophoresis?of?the?primers?of?qPC'R.??M?indicates?the?DNA?marker?DL2000.??2.3.6.2候選內(nèi)參基因的表達(dá)水平??為了驗證候選內(nèi)參MW的表達(dá)水平,對7個候選MW在褐飛纟M織部位的循環(huán)??閾值(Ct)進(jìn)行了比較,并計算平均值繪制成閣。如圖2-5所示,所冇候選內(nèi)參基W??的平均Ct值介于15.53?(18S)至24.15?(RPS11)?,?18的Ct均值最。ū磉_(dá)水平??最高)和RPS11的Ct均值最大(表達(dá)水平最低)。7候選內(nèi)參基因Ct值變化范圍??較校??29??
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【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]唾液成分在刺吸式昆蟲與植物關(guān)系中的作用[J]. 嚴(yán)盈,劉萬學(xué),萬方浩. 昆蟲學(xué)報. 2008(05)
[2]水稻品種抗稻褐飛虱育種的研究進(jìn)展[J]. 王傳之,于潔,裴慶利,劉丕慶,蔡中全,張磊,吳世民. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2008(08)
[3]白背飛虱的生物學(xué)特性[J]. 王毅. 農(nóng)技服務(wù). 2007(01)
[4]中國的白背飛虱研究概況[J]. 沈君輝,尚金梅,劉光杰. 中國水稻科學(xué). 2003(S1)
[5]我國褐飛虱不同地理種群的生物學(xué)比較[J]. 鄧望喜,周小尼,李紹勤,仇嘯云. 植物保護(hù)學(xué)報. 2000(02)
[6]白背飛虱的寄主和耐饑力[J]. 黃次偉,馮炳燦,王煥弟,姚靜,宋麗君. 昆蟲知識. 1985(05)
[7]雜交水稻白背飛虱發(fā)生特點的觀察[J]. 黃次偉,馮炳燦,王煥弟,姚靜,宋麗君. 浙江農(nóng)業(yè)科學(xué). 1985(04)
博士論文
[1]褐飛虱致害性變異相關(guān)機(jī)理研究[D]. 禹海鑫.浙江大學(xué) 2013
碩士論文
[1]南方水稻黑條矮縮病毒對白背飛虱唾液腺轉(zhuǎn)錄組影響的研究[D]. 安興奎.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2015
本文編號:3146132
【文章來源】:福建農(nóng)林大學(xué)福建省
【文章頁數(shù)】:89 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖2-2褐飛虱唾液腺基因GO功能分類圖??GO劃分為“參與生物過程”、“基因分子功能”、“細(xì)胞組成成分”三個本體,y軸表示各子條??目中Unigenc的數(shù)量
褐飛虱和白背飛虱唾液腺轉(zhuǎn)錄組分析??2.3.6候選內(nèi)參基因的穩(wěn)定性分析??2.3.6.1熒光定量引物擴(kuò)增效率??首先使用普通的RT-PCR對實驗引物進(jìn)行檢驗,得到單…擴(kuò)增、目的條帶清晰且??引物一.聚體較少的理想結(jié)果(圖2-4)。另外熒光定量PCR溶解丨丨1|線分析結(jié)果也顯示,??該實驗引物質(zhì)量高,1:1無非特異性擴(kuò)增。為丫獲得引物的擴(kuò)增效率,將模板cDNA做??了?6個5倍梯度稀釋(5°,?5'?5之5'?5'?5-5),以模板稀釋倍數(shù)的Log值為橫坐??標(biāo),Ct值為縱坐標(biāo)構(gòu)建標(biāo)準(zhǔn)曲線,標(biāo)準(zhǔn)曲線的相關(guān)系數(shù)R2>〇.98,結(jié)果可信度越高,根??據(jù)斜率計算擴(kuò)增效率,并將其列在表2-1中。??|^|??圖2-4熒光定量引物凝膠電泳圖??M?為?DL2000?Marker。??Figure?2-4?Agrose?gel?electrophoresis?of?the?primers?of?qPC'R.??M?indicates?the?DNA?marker?DL2000.??2.3.6.2候選內(nèi)參基因的表達(dá)水平??為了驗證候選內(nèi)參MW的表達(dá)水平,對7個候選MW在褐飛纟M織部位的循環(huán)??閾值(Ct)進(jìn)行了比較,并計算平均值繪制成閣。如圖2-5所示,所冇候選內(nèi)參基W??的平均Ct值介于15.53?(18S)至24.15?(RPS11)?,?18的Ct均值最。ū磉_(dá)水平??最高)和RPS11的Ct均值最大(表達(dá)水平最低)。7候選內(nèi)參基因Ct值變化范圍??較校??29??
2褐飛虱唾液腺轉(zhuǎn)錄組分析??26?p??24?-?T??|?■?^??二?22?■??3?T???」I??TO?一I??|?20?-?丄丄?「1^?一??〇?.?I?——?L_J?——??8?18?-I?[?一?一?丄一??|?16?'?II??^14-?^??I?I???I?I?I?I???RPL9?RPS11?RPS15?ACT?MACT?TUB?18S??圖2-5候選基因的表達(dá)水平??根據(jù)褐飛虱的候選基因的循環(huán)閾值(Ct值)來表示他們的表達(dá)水平。這些是以數(shù)據(jù)箱須圖表示的;??方塊代表25%和75%的值,Ct值平均值是通過箱體中間的粗線表示的,兩個“盒須”分別代表最大??值和最小值。??Fig?2-5?Expression?levels?of?candidate?reference?genes??The?expression?level?of?candidate?Nilaparvata?lugens?reference?gene?in?the?total?samples?is?shown?in?terms??of?the?cycle?threshold?number?(Ct-value).?The?data?are?expressed?as?whisker?box?plots;?the?box?represents??the?25th-75th?percentiles,?the?average?value?of?Ct-value?is?indicated?by?a?bar?across?the?box,?the?whiskers??on?each?box?repre
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]唾液成分在刺吸式昆蟲與植物關(guān)系中的作用[J]. 嚴(yán)盈,劉萬學(xué),萬方浩. 昆蟲學(xué)報. 2008(05)
[2]水稻品種抗稻褐飛虱育種的研究進(jìn)展[J]. 王傳之,于潔,裴慶利,劉丕慶,蔡中全,張磊,吳世民. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2008(08)
[3]白背飛虱的生物學(xué)特性[J]. 王毅. 農(nóng)技服務(wù). 2007(01)
[4]中國的白背飛虱研究概況[J]. 沈君輝,尚金梅,劉光杰. 中國水稻科學(xué). 2003(S1)
[5]我國褐飛虱不同地理種群的生物學(xué)比較[J]. 鄧望喜,周小尼,李紹勤,仇嘯云. 植物保護(hù)學(xué)報. 2000(02)
[6]白背飛虱的寄主和耐饑力[J]. 黃次偉,馮炳燦,王煥弟,姚靜,宋麗君. 昆蟲知識. 1985(05)
[7]雜交水稻白背飛虱發(fā)生特點的觀察[J]. 黃次偉,馮炳燦,王煥弟,姚靜,宋麗君. 浙江農(nóng)業(yè)科學(xué). 1985(04)
博士論文
[1]褐飛虱致害性變異相關(guān)機(jī)理研究[D]. 禹海鑫.浙江大學(xué) 2013
碩士論文
[1]南方水稻黑條矮縮病毒對白背飛虱唾液腺轉(zhuǎn)錄組影響的研究[D]. 安興奎.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2015
本文編號:3146132
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