蕓薹根腫菌分泌蛋白PbSP1的克隆及表達特征分析
發(fā)布時間:2021-04-13 15:26
【目的】對蕓薹根腫菌PbSP1進行克隆和功能分析,豐富蕓薹根腫菌分泌蛋白的科學認知!痉椒ā客ㄟ^生物信息學分析、表達動態(tài)變化和異源表達對蕓薹根腫菌分泌蛋白PbSP1進行研究!窘Y果】通過測序分析發(fā)現(xiàn),PbSP1的序列與已經公布的蕓薹根腫菌e3菌株的參考基因組對應基因序列一致,且不存在內含子。生物信息學分析發(fā)現(xiàn)PbSP1氨基酸序列的氨基端存在一段信號肽序列,同時序列中存在4個Kazal結構域。通過酵母蔗糖酶分泌實驗進一步發(fā)現(xiàn),PbSP1編碼的信號肽序列具有活性。通過不同階段表達特征分析發(fā)現(xiàn),PbSP1在不同時期差異表達,其中在蕓薹根腫菌休眠孢子萌發(fā)期表達最為活躍。通過亞細胞定位實驗發(fā)現(xiàn)PbSP1定位在細胞質內!窘Y論】PbSP1可以被蕓薹根腫菌分泌到胞外,并在蕓薹根腫菌休眠孢子萌發(fā)過程中發(fā)揮重要功能。
【文章來源】:西南農業(yè)學報. 2020,33(10)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:5 頁
【部分圖文】:
PbSP1表達量分析
PbSP1的亞細胞定位
用SignalP 4.1和SMART分別對PbSP1的氨基酸序列進行分析(圖2-a)。PbSP1包含185個氨基酸殘基,在其氨基端(1~19 aa)存在1個信號肽,分別在20~57 aa, 58~97 aa,100~140 aa, 146~183 aa處均存在一個Kazal結構域。此外,通過TMHMM v2.0分析未發(fā)現(xiàn)PbSP1存在膜定位序列。因PbSP1存在一個氨基端信號肽,推測該蛋白可以被分泌到胞外。通過酵母蔗糖酶分泌實驗發(fā)現(xiàn)(圖 2-b),轉入PbSP1信號肽序列的YTK12能夠在YPRAA上正常生長,也能將TTC還原成紅色不溶物甲臜。上述結果表明PbSP1第1~19位的氨基酸序列(1~19)具有信號肽功能。2.3 PbSP1的表達特征
【參考文獻】:
期刊論文
[1]甘藍根腫病菌休眠孢子的生物學特性及侵染寄主的顯微觀察[J]. 杜艷,劉郵洲,劉永鋒,李建斌,喬俊卿,許凌宇. 西南農業(yè)學報. 2016(06)
[2]根腫病的研究進展[J]. 李壯,牛應澤,吳永成,郭世星. 西南農業(yè)學報. 2013(04)
[3]油菜根腫病癥狀、病原形態(tài)及產量損失研究[J]. 王靖,黃云,胡曉玲,牛應澤,李曉蘭,梁勇. 中國油料作物學報. 2008(01)
本文編號:3135552
【文章來源】:西南農業(yè)學報. 2020,33(10)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:5 頁
【部分圖文】:
PbSP1表達量分析
PbSP1的亞細胞定位
用SignalP 4.1和SMART分別對PbSP1的氨基酸序列進行分析(圖2-a)。PbSP1包含185個氨基酸殘基,在其氨基端(1~19 aa)存在1個信號肽,分別在20~57 aa, 58~97 aa,100~140 aa, 146~183 aa處均存在一個Kazal結構域。此外,通過TMHMM v2.0分析未發(fā)現(xiàn)PbSP1存在膜定位序列。因PbSP1存在一個氨基端信號肽,推測該蛋白可以被分泌到胞外。通過酵母蔗糖酶分泌實驗發(fā)現(xiàn)(圖 2-b),轉入PbSP1信號肽序列的YTK12能夠在YPRAA上正常生長,也能將TTC還原成紅色不溶物甲臜。上述結果表明PbSP1第1~19位的氨基酸序列(1~19)具有信號肽功能。2.3 PbSP1的表達特征
【參考文獻】:
期刊論文
[1]甘藍根腫病菌休眠孢子的生物學特性及侵染寄主的顯微觀察[J]. 杜艷,劉郵洲,劉永鋒,李建斌,喬俊卿,許凌宇. 西南農業(yè)學報. 2016(06)
[2]根腫病的研究進展[J]. 李壯,牛應澤,吳永成,郭世星. 西南農業(yè)學報. 2013(04)
[3]油菜根腫病癥狀、病原形態(tài)及產量損失研究[J]. 王靖,黃云,胡曉玲,牛應澤,李曉蘭,梁勇. 中國油料作物學報. 2008(01)
本文編號:3135552
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