基于轉(zhuǎn)錄組測(cè)序開發(fā)的一個(gè)小麥葉銹菌特異分子標(biāo)記
發(fā)布時(shí)間:2021-04-11 16:17
小麥葉銹菌毒性變異頻繁,新的毒性小種不斷出現(xiàn),往往導(dǎo)致小麥抗葉銹病品種在推廣種植幾年后的抗性喪失。因此,開發(fā)用于田間小麥葉銹病的診斷與預(yù)測(cè)預(yù)報(bào)的特異性分子標(biāo)記具有重要意義。在前期已經(jīng)完成小麥葉銹菌PHNT轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的基礎(chǔ)上,本研究擬在數(shù)據(jù)庫(kù)中挑選候選效應(yīng)蛋白,利用實(shí)時(shí)熒光定量PCR明確其在葉銹菌侵染小麥后不同時(shí)間點(diǎn)的表達(dá)模式,根據(jù)差異表達(dá)分析篩選出候選效應(yīng)蛋白,再根據(jù)編碼候選效應(yīng)蛋白的基因序列設(shè)計(jì)引物,對(duì)小麥葉銹菌PHNT基因組DNA進(jìn)行PCR擴(kuò)增,旨在開發(fā)小麥葉銹菌特異性分子標(biāo)記。結(jié)果在轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫(kù)中篩選出24個(gè)候選效應(yīng)蛋白,qPCR檢測(cè)明確其中17個(gè)具有明顯的表達(dá)差異。PCR擴(kuò)增結(jié)果表明,基于候選效應(yīng)蛋白基因PTTG-05290設(shè)計(jì)的引物在小麥葉銹菌PHNT中獲得一條920 bp的條帶,且在檢測(cè)的25種葉銹菌生理小種中均穩(wěn)定存在,而在小麥條銹菌、菜豆銹菌、棗樹銹菌、柳樹銹菌、蘋果樹銹菌及蘆葦銹菌6種銹菌中不能獲得有效擴(kuò)增,表明該引物在小麥葉銹菌中具有特異性。qPCR結(jié)果表明,PTTG-05290在葉銹菌侵染小麥4 d時(shí)達(dá)到表達(dá)高峰,表達(dá)量為0 d的218倍,而0.5 d時(shí)便大量檢測(cè)...
【文章來(lái)源】:植物遺傳資源學(xué)報(bào). 2020,21(05)北大核心CSCD
【文章頁(yè)數(shù)】:9 頁(yè)
【部分圖文】:
部分候選效應(yīng)蛋白的表達(dá)模式
為了明確PTTG-05290基因在小麥葉銹菌不同生理小種中的分布情況,提取25個(gè)不同小麥葉銹菌生理小種夏孢子基因組DNA,利用特異性引物進(jìn)行擴(kuò)增。經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),結(jié)果表明,在檢測(cè)的25個(gè)生理小種中均能獲得同樣大小的擴(kuò)增條帶,說(shuō)明該引物不僅適用于葉銹菌生理小種PHNT,而且適用于所有葉銹菌生理小種(圖3)。圖3 PTTG-05290在葉銹菌不同生理小種中的部分?jǐn)U增結(jié)果
PTTG-05290在葉銹菌不同生理小種中的部分?jǐn)U增結(jié)果
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]小麥粒重相關(guān)基因的遺傳定位和分子標(biāo)記輔助育種進(jìn)展[J]. 張福彥,范家霖,陳曉杰,陳鋒,齊紅志,王嘉歡,程仲杰,楊保安,張建偉. 植物遺傳資源學(xué)報(bào). 2020(03)
[2]小麥F-box/Kelch類基因TaFKOR23的抗逆相關(guān)表達(dá)模式及分子互作蛋白鑒定[J]. 魏春茹,孟鈺玉,范潤(rùn)僑,趙夢(mèng)伊,于秀梅,趙偉全,康振生,劉大群. 植物遺傳資源學(xué)報(bào). 2020(03)
[3]15個(gè)小麥農(nóng)家品種抗葉銹基因分析[J]. 徐新玉,段振盈,張曉玲,姚占軍. 植物遺傳資源學(xué)報(bào). 2020(02)
[4]分子標(biāo)記在小麥抗條銹病遺傳育種中的應(yīng)用研究進(jìn)展[J]. 張羽,張先平,李小鵬,李云. 分子植物育種. 2018(18)
[5]小麥葉銹菌特異分子標(biāo)記建立[J]. 康健,張林,張夢(mèng)雅,閆紅飛,劉大群. 河北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2016(04)
[6]不同殺菌劑對(duì)小麥葉銹病的防治效果[J]. 夏得壯,劉太國(guó),劉博,高利,李寧?kù)o,朱映峰,劉立新,陳萬(wàn)權(quán). 植物保護(hù). 2016(02)
[7]小麥品種濰麥8號(hào)成株抗葉銹QTL定位[J]. 王佳真,師令智,朱琳,任志寬,康占海,李星,劉大群. 植物遺傳資源學(xué)報(bào). 2015(04)
[8]基于葉片液泡膜電位的黃瓜鉀脅迫早期診斷技術(shù)[J]. 胡靜,毛罕平,左志宇,李青林. 農(nóng)業(yè)機(jī)械學(xué)報(bào). 2015(03)
[9]隱匿柄銹菌(小麥葉銹病菌)UP-PCR遺傳多樣性分析[J]. 張林亞,孟慶芳,康健,楊文香,閆紅飛,劉大群. 菌物學(xué)報(bào). 2015(02)
[10]我國(guó)部分地區(qū)小麥葉銹菌遺傳多樣性的SSR分析[J]. 許敏青,王珅,孟慶芳,劉大群. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2013(01)
博士論文
[1]番茄病害早期快速診斷與生理信息快速檢測(cè)方法研究[D]. 鮑一丹.浙江大學(xué) 2013
碩士論文
[1]小麥條銹菌效應(yīng)蛋白Hasp190調(diào)控寄主免疫的分子機(jī)理研究[D]. 龐麗靜.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2019
[2]小麥葉銹菌(Puccinia recondita f.sp.tritici)毒性及AFLP分析[D]. 高軍.河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2003
本文編號(hào):3131574
【文章來(lái)源】:植物遺傳資源學(xué)報(bào). 2020,21(05)北大核心CSCD
【文章頁(yè)數(shù)】:9 頁(yè)
【部分圖文】:
部分候選效應(yīng)蛋白的表達(dá)模式
為了明確PTTG-05290基因在小麥葉銹菌不同生理小種中的分布情況,提取25個(gè)不同小麥葉銹菌生理小種夏孢子基因組DNA,利用特異性引物進(jìn)行擴(kuò)增。經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),結(jié)果表明,在檢測(cè)的25個(gè)生理小種中均能獲得同樣大小的擴(kuò)增條帶,說(shuō)明該引物不僅適用于葉銹菌生理小種PHNT,而且適用于所有葉銹菌生理小種(圖3)。圖3 PTTG-05290在葉銹菌不同生理小種中的部分?jǐn)U增結(jié)果
PTTG-05290在葉銹菌不同生理小種中的部分?jǐn)U增結(jié)果
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]小麥粒重相關(guān)基因的遺傳定位和分子標(biāo)記輔助育種進(jìn)展[J]. 張福彥,范家霖,陳曉杰,陳鋒,齊紅志,王嘉歡,程仲杰,楊保安,張建偉. 植物遺傳資源學(xué)報(bào). 2020(03)
[2]小麥F-box/Kelch類基因TaFKOR23的抗逆相關(guān)表達(dá)模式及分子互作蛋白鑒定[J]. 魏春茹,孟鈺玉,范潤(rùn)僑,趙夢(mèng)伊,于秀梅,趙偉全,康振生,劉大群. 植物遺傳資源學(xué)報(bào). 2020(03)
[3]15個(gè)小麥農(nóng)家品種抗葉銹基因分析[J]. 徐新玉,段振盈,張曉玲,姚占軍. 植物遺傳資源學(xué)報(bào). 2020(02)
[4]分子標(biāo)記在小麥抗條銹病遺傳育種中的應(yīng)用研究進(jìn)展[J]. 張羽,張先平,李小鵬,李云. 分子植物育種. 2018(18)
[5]小麥葉銹菌特異分子標(biāo)記建立[J]. 康健,張林,張夢(mèng)雅,閆紅飛,劉大群. 河北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2016(04)
[6]不同殺菌劑對(duì)小麥葉銹病的防治效果[J]. 夏得壯,劉太國(guó),劉博,高利,李寧?kù)o,朱映峰,劉立新,陳萬(wàn)權(quán). 植物保護(hù). 2016(02)
[7]小麥品種濰麥8號(hào)成株抗葉銹QTL定位[J]. 王佳真,師令智,朱琳,任志寬,康占海,李星,劉大群. 植物遺傳資源學(xué)報(bào). 2015(04)
[8]基于葉片液泡膜電位的黃瓜鉀脅迫早期診斷技術(shù)[J]. 胡靜,毛罕平,左志宇,李青林. 農(nóng)業(yè)機(jī)械學(xué)報(bào). 2015(03)
[9]隱匿柄銹菌(小麥葉銹病菌)UP-PCR遺傳多樣性分析[J]. 張林亞,孟慶芳,康健,楊文香,閆紅飛,劉大群. 菌物學(xué)報(bào). 2015(02)
[10]我國(guó)部分地區(qū)小麥葉銹菌遺傳多樣性的SSR分析[J]. 許敏青,王珅,孟慶芳,劉大群. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2013(01)
博士論文
[1]番茄病害早期快速診斷與生理信息快速檢測(cè)方法研究[D]. 鮑一丹.浙江大學(xué) 2013
碩士論文
[1]小麥條銹菌效應(yīng)蛋白Hasp190調(diào)控寄主免疫的分子機(jī)理研究[D]. 龐麗靜.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2019
[2]小麥葉銹菌(Puccinia recondita f.sp.tritici)毒性及AFLP分析[D]. 高軍.河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2003
本文編號(hào):3131574
本文鏈接:http://sikaile.net/nykjlw/dzwbhlw/3131574.html
最近更新
教材專著