南方根結(jié)線蟲（Meloidogyne incognita）是一類重要的植物寄生線蟲。南方根結(jié)線蟲在寄生過程中,將其食道腺分泌的大量效應(yīng)蛋白注入植物細胞,其中類毒液過敏原蛋白（venom allergen-like proteins）在線蟲侵染早期階段起著重要的作用。本文通過轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)（RNAseq）對南方根結(jié)線蟲無毒群體和毒性群體侵入Mi-l番茄后的轉(zhuǎn)錄組進行分析,選取在毒性群體中表達顯著上調(diào)的類毒液過敏原Mi V901基因為研究對象,利用煙草瞬時表達以及擬南芥過表達等方法探索MiV901在根結(jié)線蟲寄生過程中的生物學功能。主要結(jié)果如下:1.南方根結(jié)線蟲無毒和毒性群體侵染Mi-1番茄的差異表達基因分析為了探究南方根結(jié)線蟲與Mi-1番茄親和與非親和互作過程中導(dǎo)致的基因表達差異,本文對南方根結(jié)線蟲無毒群體MIJS8-AV和毒性群體MIJS8-Ⅵ侵染Mi-1番茄’Tanaki,3 d后的轉(zhuǎn)錄組進行測序和生物信息學分析。結(jié)果表明,分別由MIJS8-AV和MIJS8-VI侵染的’Tanaki’根尖構(gòu)建的AVTL文庫和VITL文庫之間,共存在93個根結(jié)線蟲差異表達基因（DEGs）;與AVTL文庫... 

【文章來源】：南京農(nóng)業(yè)大學江蘇省 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：106 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖１．根結(jié)線蟲的生活史??Ｆｉｇ．?１?Ｒｏｏｔ－ｋｎｏｔ?ｎｅｍａｔｏｄｅ?ｌｉｆｅ?ｃｙｃｌｅ?（Ｊｏｎｅｓ?＆?Ｇｏｔｏ，?２０１１）??１．３根結(jié)線蟲的防治??

Ｕａ？＞?ｍ？ｒｅ??Ｅ?Ｆ?＿??＜Ｋ?ｔｆｏｎｓｃｅｒ?６？ｋ?？ｖ??ｙ＾＼?Ｘ．?？０？＊？？？？？？＜?ｒｓＭＵＳＨｚ?７＊＼?ｆｔＣ（？ｅ？ａ？Ｋ？＊??／／?＼＼?／〇．＼?？〇？＊＊？？??：：１：：Ａ??ｓ?ｒ；ｔＴ＞Ｔｉ＾Ｚｉ?ｔ）?ｗ?ａ?ｉ＊?：＊?ｉｉ?？?？?？ｔ?＜？?４９?ｖ?？?ｗ?？ｉ?ｔｓｂＴｆ；?Ｖ？?ｎｗｓｎ?ｎ?ｗＴ；?ｘ?ｍ?ｉ？?＜ｉ?？：？?＜？?ｖ?？?？?？；?？?ｗ?ｊ；?？ｓ?；５ｗ？?？ｖｖ？？?ｗ．??圖１－２?ＲＮＡｓｅｑ數(shù)據(jù)質(zhì)量檢測分析??Ｆｉｇ．?１－２?Ｑｕａｌｉｔｙ?ａｎａｌｙｓｉｓ?ｏｆ?ＲＮＡｓｅｑ?ｄａｔａ?ｄｅｔｅｃｔｉｏｎ??Ａ，Ｃ，Ｅ：?ＡＶＴＬ?文庫；Ｂ，Ｄ，Ｆ：?ＶＩＴＬ?文庫。??Ａ－Ｂ：每個堿基序列質(zhì)量；Ｃ－Ｄ：每條序列的質(zhì)量；Ｅ－Ｆ：每條序列ＧＣ含量。??Ａ，?Ｃ，?Ｅ：?ＲＮＡｓｅｑ?ｌｉｂｒａｒｙ?ＡＶＴＬ；?Ｂ，?Ｄ，?Ｆ：?ＲＮＡｓｅｑ?ｌｉｂｒａ＾?ＶＩＴＬ．??Ａ，?Ｂ：?Ｐｅｒ?ｂａｓｅ?ｓｅｑｕｅｎｃｅ?ｑｕａｌｉｔｙ；?Ｃ，?Ｄ：?Ｐｅｒ?ｓｅｑｕｅｎｃｅ?ｑｕａｌｉｔｙ?ｓｃｏｒｅｓ；?Ｅ，?Ｆ：?Ｐｅｒ?ｓｅｑｕｅｎｃｅ?ＧＣ?ｃｏｎｔｅｎｔ．??通過高通量測序得到ＡＶＴＬ文庫２２０１０６５５條ｒａｗ?ｒｅａｄｓ和ＶＩＴＬ文庫２２０４５３４８??條ｒａｗｒｅａｄｓ，去除低質(zhì)量、污染片段后，ＡＶＴＬ得到了?２１９７１０８６條ｃｌｅａｎｒｅａｄｓ，ＶＩＴＬ??文庫得到了?２２００８５７１條ｄｅａｎ?ｒｅａｄｓ，分別占其ｒａｗ?ｒｅａｄｓ總數(shù)的９９．８２％和９９．８３％。表??明文庫構(gòu)建質(zhì)量較好，獲

?２?５６％?￣￣￣?四?０－１０％?（３０４３）??ｋ?―）?—５２）??／?０?２〇％－３〇％（４〇８）?９．００％?＾?０２〇％－３〇％?（４７８）??＊３０％－４０％（１９５）?？?３０％－概（２５５）??？４０％－５０％（１２８）?擎變＿?０４Ｏ％－５Ｏ％（１３７）??＼ｙ?＃－＝：：；；：?／?５７＇３０％－０：：：：：：；??口?８０％－９０％（１３＞?口８０％－９０％（２７＞??Ｅ?９０％－１００％?⑶?■?９０％－１００％?（１７）??圖１－３映射到的南方根結(jié)線蟲基因數(shù)據(jù)統(tǒng)計??Ｆｉｇ．?１－３?Ｓｔａｔｉｓｔｉｃ?ａｎａｌｙｓｅｓ?ｏｆ?Ｍ?ｉｎｃｏｇｎｉｔａ?ｇｅｎｅｓ?ｍａｐｐｅｄ?ｂｙ?ｃｌｅａｎ?ｒｅａｄｓ??Ａ，?Ｃ，?Ｅ：?ＡＶＴＬ?文庫；Ｂ，?Ｄ，?Ｆ：?ＶＩＴＬ?文庫??Ａ，?Ｂ：映射到某個基因次數(shù)的分布；Ｃ，?Ｄ：映射到某個基因總ｃｌｅａｎ?ｒｅａｄｓ數(shù)量的分布；Ｅ，?Ｆ：??基因覆蓋度??Ａ，?Ｃ，?Ｅ：?ＲＮＡｓｅｑ?ｌｉｂｒａｒｙ?ＡＶＴＬ；?Ｂ，?Ｄ，?Ｆ：?ＲＮＡｓｅｑ?ｌｉｂｒａｉｙ?ＶＩＴＬ??Ａ，?Ｂ：?Ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ?ｏｆ?ｍａｐｐｅｄ?ｇｅｎｅｓ；?Ｃ，?Ｄ：?Ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ?ｏｆ?ｃｌｅａｎ?ｒｅａｄｓ；?Ｅ，?Ｆ：?Ｇｅｎｅ?ｃｏｖｅｒａｇｅ??注：Ａ－Ｄ中“１－５”指基因被映射到１－５次，Ａ，?Ｂ括號中為基因數(shù)量；Ｃ，?Ｄ括號中為ｃｌｅａｎｒｅａｄｓ數(shù)??量；Ｅ，?Ｆ中“０－１０％”指基因覆蓋度，括號中為基因數(shù)量。??Ｎｏｔｅ：?“１－５”?ｉｎ?Ａ－Ｄ?ｍｅａｎｓ?ｔｈｅ?ｇｅｎｅ?ｏｒ?ｃｌｅａｎ?ｒｅａｄｓ?

【參考文獻】：
期刊論文
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本文編號：3130207