竹紋枯葉蛾和青黃枯葉蛾線粒體基因組特征及系統(tǒng)發(fā)育研究
發(fā)布時間:2021-03-31 06:58
竹紋枯葉蛾和青黃枯葉蛾是鱗翅目枯葉蛾科紋枯葉蛾屬和黃枯葉蛾屬昆蟲,其幼蟲取食重要經(jīng)濟(jì)植物,是重要的經(jīng)濟(jì)害蟲。目前有關(guān)兩種枯葉蛾的研究主要集中于形態(tài)學(xué)和生物學(xué)方面。本研究利用PCR和測序技術(shù)測得兩種枯葉蛾線粒體基因組全序列,分析其基因結(jié)構(gòu)、組成、排列等特征;基于竹紋枯葉蛾、青黃枯葉蛾以及35種現(xiàn)有鱗翅目昆蟲線粒體基因組蛋白質(zhì)編碼基因的氨基酸、核苷酸序列和2個r RNA基因序列建立系統(tǒng)樹。結(jié)論如下:1.竹紋枯葉蛾和青黃枯葉蛾的線粒體基因組全長分別為15,368bp和15,281bp,登錄號(GenBank accession number)為KU870700和KU884483,AT含量為80.19%和80.87%。兩者都具有37個基因(13個蛋白質(zhì)編碼基因、22個tRNA基因、2個rRNA基因)和1個AT富集區(qū)。兩種枯葉蛾的tRNA基因的前三個的排列方式典型tRNAMet-tRNAIle-tRNAGln位于AT富集區(qū)和ND2之間,剩余基因的排列則與其它昆蟲一致。兩種枯葉蛾線粒體基因組分別存在18和11個基因間隔區(qū)(總長為192bp和149bp),9和12個基因重疊區(qū)(總長為26bp和49b...
【文章來源】:南昌大學(xué)江西省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:75 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第1章 引言
1.1 枯葉蛾科研究概述
1.1.1 竹紋枯葉蛾概述
1.1.2 青黃枯葉蛾概述
1.2 線粒體概述
1.2.1 鱗翅目線粒體概述
1.2.1.1 鱗翅目線粒體特征
1.2.2 鱗翅目昆蟲線粒體DNA的應(yīng)用
1.2.2.1 生物分類學(xué)
1.2.2.2 物種起源與遺傳分化
1.2.2.3 性別比例
1.2.3 鱗翅目線粒體DNA研究現(xiàn)狀
1.3 系統(tǒng)發(fā)生樹的構(gòu)建
1.4 研究目的和意義
1.5 本文研究內(nèi)容
第2章 竹紋枯葉蛾和青黃枯葉蛾線粒體基因組序列的擴(kuò)增及分析
2.1 實驗材料與方法
2.1.1 樣品采集與保存
2.1.2 主要儀器和試劑
2.1.3 實驗方法
2.1.3.1 樣品處理
2.1.3.2 總DNA提取
2.1.3.3 PCR引物設(shè)計
2.1.3.4 序列擴(kuò)增
2.1.3.5 PCR產(chǎn)物的檢測與測序
2.1.3.6 線粒體基因組序列拼接、注釋和分析
2.2 結(jié)果與分析
2.2.1 竹紋枯葉蛾線粒體基因組
2.2.1.1 基因組結(jié)構(gòu)
2.2.1.2 堿基含量分析
2.2.1.3 蛋白質(zhì)編碼基因序列分析
2.2.1.4 t RNA和r RNA基因分析
2.2.1.5 AT富集區(qū)分析
2.2.1.6 基因間隔區(qū)和基因重疊區(qū)分析
2.2.2 青黃枯葉蛾線粒體基因組
2.2.2.1 基因組結(jié)構(gòu)
2.2.2.2 堿基含量分析
2.2.2.3 蛋白質(zhì)編碼基因序列分析
2.2.2.4t RNA和r RNA基因分析
2.2.2.5 AT富集區(qū)分析分析
2.2.2.6 基因間隔區(qū)和基因重疊區(qū)分析
2.2.3 同源性分析
2.3 小結(jié)與討論
2.3.1 兩種枯葉蛾線粒體基因組結(jié)構(gòu)與堿基含量分析
2.3.2 兩種枯葉蛾線粒體蛋白質(zhì)編碼基因分析
2.3.3 兩種枯葉蛾線粒體t RNA與r RNA基因分析
2.3.4 兩種枯葉蛾線粒體AT富集區(qū)分析
第3章 基于線粒體基因組序列對鱗翅目系統(tǒng)發(fā)育的研究
3.1 分析方法
3.1.1 物種選取
3.1.2 系統(tǒng)樹的構(gòu)建
3.2 結(jié)果和分析
3.2.1 NJ樹
3.2.2 MP樹
3.2.3 ML樹
3.2.4 BI樹
3.3 小結(jié)和討論
第4章 結(jié)論與展望
4.1 結(jié)論
4.2 本研究的不足之處
4.3 展望
致謝
參考文獻(xiàn)
碩士期間科研成果和獲獎
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]家蠶的變態(tài)發(fā)育過程及其激素調(diào)控[J]. 李瓊艷. 現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科技. 2015(18)
[2]線粒體形態(tài)的動態(tài)變化及其生物學(xué)意義[J]. 李佳. 中學(xué)生物教學(xué). 2014(06)
[3]基于昆蟲共生菌沃爾巴克氏體的蚊媒和蚊媒病控制研究進(jìn)展[J]. 潘曉玲,劉起勇,奚志勇. 中國媒介生物學(xué)及控制雜志. 2014(01)
[4]鱗翅目昆蟲比較線粒體基因組學(xué)研究進(jìn)展[J]. 王維,孟智啟,石放雄,李風(fēng)波. 科學(xué)通報. 2013(30)
[5]昆蟲誘食劑與農(nóng)藥混用防治小菜蛾的效果[J]. 李芳功,楊芳,馮振群. 中國植保導(dǎo)刊. 2013(07)
[6]基于線粒體COⅠ基因的齒小蠹屬昆蟲DNA條形碼研究[J]. 常虹,郝德君,肖榮堂,劉勇,錢路,安榆林,楊曉軍. 昆蟲學(xué)報. 2012(09)
[7]櫟黃枯葉蛾生物學(xué)特性研究[J]. 王世飛,宗世祥,張金桐,齊忠,張永飛. 山西農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2012(03)
[8]無瓣海桑主要害蟲綠黃枯葉蛾的取食行為研究[J]. 鄧艷,吳耀軍,張文英,楊振德,李德偉. 中國森林病蟲. 2012(01)
[9]鱗翅目簡介[J]. 盧榮俊. 硅谷. 2010(04)
[10]DNA條形碼與生物分類學(xué)研究[J]. 葛家文,王好轉(zhuǎn). 畜牧與飼料科學(xué). 2009(05)
博士論文
[1]鱗翅目線粒體基因組分析及部分蛾類DNA條形碼鑒定[D]. 武宇鵬.山西大學(xué) 2013
碩士論文
[1]櫟黃枯葉蛾空間分布與防控技術(shù)初探[D]. 章一巧.北京林業(yè)大學(xué) 2013
[2]五種灰蝶線粒體基因組比較研究及其系統(tǒng)發(fā)生分析[D]. 張?zhí)m蘭.安徽師范大學(xué) 2013
[3]六種粉蝶線粒體基因組比較研究及其系統(tǒng)發(fā)生分析[D]. 郝娟娟.安徽師范大學(xué) 2013
[4]中國野桑蠶線粒體基因組研究[D]. 夏玉玲.西南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2003
本文編號:3111012
【文章來源】:南昌大學(xué)江西省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:75 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第1章 引言
1.1 枯葉蛾科研究概述
1.1.1 竹紋枯葉蛾概述
1.1.2 青黃枯葉蛾概述
1.2 線粒體概述
1.2.1 鱗翅目線粒體概述
1.2.1.1 鱗翅目線粒體特征
1.2.2 鱗翅目昆蟲線粒體DNA的應(yīng)用
1.2.2.1 生物分類學(xué)
1.2.2.2 物種起源與遺傳分化
1.2.2.3 性別比例
1.2.3 鱗翅目線粒體DNA研究現(xiàn)狀
1.3 系統(tǒng)發(fā)生樹的構(gòu)建
1.4 研究目的和意義
1.5 本文研究內(nèi)容
第2章 竹紋枯葉蛾和青黃枯葉蛾線粒體基因組序列的擴(kuò)增及分析
2.1 實驗材料與方法
2.1.1 樣品采集與保存
2.1.2 主要儀器和試劑
2.1.3 實驗方法
2.1.3.1 樣品處理
2.1.3.2 總DNA提取
2.1.3.3 PCR引物設(shè)計
2.1.3.4 序列擴(kuò)增
2.1.3.5 PCR產(chǎn)物的檢測與測序
2.1.3.6 線粒體基因組序列拼接、注釋和分析
2.2 結(jié)果與分析
2.2.1 竹紋枯葉蛾線粒體基因組
2.2.1.1 基因組結(jié)構(gòu)
2.2.1.2 堿基含量分析
2.2.1.3 蛋白質(zhì)編碼基因序列分析
2.2.1.4 t RNA和r RNA基因分析
2.2.1.5 AT富集區(qū)分析
2.2.1.6 基因間隔區(qū)和基因重疊區(qū)分析
2.2.2 青黃枯葉蛾線粒體基因組
2.2.2.1 基因組結(jié)構(gòu)
2.2.2.2 堿基含量分析
2.2.2.3 蛋白質(zhì)編碼基因序列分析
2.2.2.4t RNA和r RNA基因分析
2.2.2.5 AT富集區(qū)分析分析
2.2.2.6 基因間隔區(qū)和基因重疊區(qū)分析
2.2.3 同源性分析
2.3 小結(jié)與討論
2.3.1 兩種枯葉蛾線粒體基因組結(jié)構(gòu)與堿基含量分析
2.3.2 兩種枯葉蛾線粒體蛋白質(zhì)編碼基因分析
2.3.3 兩種枯葉蛾線粒體t RNA與r RNA基因分析
2.3.4 兩種枯葉蛾線粒體AT富集區(qū)分析
第3章 基于線粒體基因組序列對鱗翅目系統(tǒng)發(fā)育的研究
3.1 分析方法
3.1.1 物種選取
3.1.2 系統(tǒng)樹的構(gòu)建
3.2 結(jié)果和分析
3.2.1 NJ樹
3.2.2 MP樹
3.2.3 ML樹
3.2.4 BI樹
3.3 小結(jié)和討論
第4章 結(jié)論與展望
4.1 結(jié)論
4.2 本研究的不足之處
4.3 展望
致謝
參考文獻(xiàn)
碩士期間科研成果和獲獎
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]家蠶的變態(tài)發(fā)育過程及其激素調(diào)控[J]. 李瓊艷. 現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科技. 2015(18)
[2]線粒體形態(tài)的動態(tài)變化及其生物學(xué)意義[J]. 李佳. 中學(xué)生物教學(xué). 2014(06)
[3]基于昆蟲共生菌沃爾巴克氏體的蚊媒和蚊媒病控制研究進(jìn)展[J]. 潘曉玲,劉起勇,奚志勇. 中國媒介生物學(xué)及控制雜志. 2014(01)
[4]鱗翅目昆蟲比較線粒體基因組學(xué)研究進(jìn)展[J]. 王維,孟智啟,石放雄,李風(fēng)波. 科學(xué)通報. 2013(30)
[5]昆蟲誘食劑與農(nóng)藥混用防治小菜蛾的效果[J]. 李芳功,楊芳,馮振群. 中國植保導(dǎo)刊. 2013(07)
[6]基于線粒體COⅠ基因的齒小蠹屬昆蟲DNA條形碼研究[J]. 常虹,郝德君,肖榮堂,劉勇,錢路,安榆林,楊曉軍. 昆蟲學(xué)報. 2012(09)
[7]櫟黃枯葉蛾生物學(xué)特性研究[J]. 王世飛,宗世祥,張金桐,齊忠,張永飛. 山西農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2012(03)
[8]無瓣海桑主要害蟲綠黃枯葉蛾的取食行為研究[J]. 鄧艷,吳耀軍,張文英,楊振德,李德偉. 中國森林病蟲. 2012(01)
[9]鱗翅目簡介[J]. 盧榮俊. 硅谷. 2010(04)
[10]DNA條形碼與生物分類學(xué)研究[J]. 葛家文,王好轉(zhuǎn). 畜牧與飼料科學(xué). 2009(05)
博士論文
[1]鱗翅目線粒體基因組分析及部分蛾類DNA條形碼鑒定[D]. 武宇鵬.山西大學(xué) 2013
碩士論文
[1]櫟黃枯葉蛾空間分布與防控技術(shù)初探[D]. 章一巧.北京林業(yè)大學(xué) 2013
[2]五種灰蝶線粒體基因組比較研究及其系統(tǒng)發(fā)生分析[D]. 張?zhí)m蘭.安徽師范大學(xué) 2013
[3]六種粉蝶線粒體基因組比較研究及其系統(tǒng)發(fā)生分析[D]. 郝娟娟.安徽師范大學(xué) 2013
[4]中國野桑蠶線粒體基因組研究[D]. 夏玉玲.西南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2003
本文編號:3111012
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