小麥赤霉病主要是由禾谷鐮孢菌和亞洲鐮孢菌引起的一種真菌性病害,在世界溫帶小麥種植區(qū)發(fā)病普遍。隨著全球氣候變暖及秸稈還田等耕作方式的改變,小麥赤霉病在我國的發(fā)生范圍逐漸由長江中下游向北向西擴展,流行頻率有逐漸增高態(tài)勢。赤霉病不僅造成嚴重的產(chǎn)量損失,病菌產(chǎn)生的脫氧雪腐鐮孢菌烯醇等毒素還會影響人畜健康�；瘜W防治是目前主要的防治措施,但面臨病菌易產(chǎn)生抗藥性及環(huán)境污染等問題。低毒真菌病毒能夠降低寄主真菌的致病力,是一種潛在的生防資源。前期從亞洲鐮孢菌菌株F16176中報道了一種新的維多利亞病毒Fa VV1（Fusarium asiaticum victorivirus 1）,本研究從同一個菌株中又發(fā)現(xiàn)了另外一個維多利亞病毒,命名為Fa VV2（Fusarium asiaticum victorivirus 2）。根據(jù)Rd Rp的氨基酸序列進行的系統(tǒng)發(fā)育分析表明這兩種ds RNA病毒是維多利亞病毒屬的2個新成員。另外,從禾谷鐮孢菌菌株CF16158中檢測到一種新的正義單鏈RNA病毒,對病毒編碼的Hel和Rd Rp的氨基酸序列進行的系統(tǒng)發(fā)育分析表明,該（+）ss RNA真菌病毒是alphavirus... 

【文章來源】：長江大學湖北省

【文章頁數(shù)】：78 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

鐮孢菌中dsRNA電泳圖

20重疊在一起，即UAAUG。FaVV2的基因組結(jié)構(gòu)與FaVV1相似；此外，F(xiàn)aVV2的CP和RdRp與FaVV1最相似（圖2.3a）。通過保守域數(shù)據(jù)庫搜索和多重蛋白比對，在RdRp-4區(qū)域檢測到8個保守基序（I-VIII）（圖2.3b）。但根據(jù)系統(tǒng)發(fā)育樹的拓撲結(jié)構(gòu)，F(xiàn)aVV2和MoV1聚成一個單獨的分支，RdRp結(jié)構(gòu)域相似度達到95%（圖2.4）。圖2.3FaVV2、FaVV1和RnVV1基因組結(jié)構(gòu)及RdRp蛋白序列的多重對比Figure2.3FaVV2,FaVV1andRnVV1genomestructureandmultiplecomparisonofRdRpproteinsequences注：圖a表示FaVV2與FaVV1、RnVV1的基因結(jié)構(gòu)，長方形框表示CP和RdRp的ORF，該蛋白的氨基酸數(shù)在方框上比奧是，起始密碼子和終止密碼子的核苷酸位置在方框上顯示，圖中顯示了重疊的五個核苷酸UAAUG的位置。圖b表示FaVV2的RdRp基序與維多利亞病毒屬中選定病毒的多重序列比對。序列上方的水平線表示八個基序，括號中的數(shù)字表示保守基序之間的殘基數(shù)。FaVV1、RnVV1、MoV1、AfV-S1、BbVV-N22/1980、SnV1、SsRV1和UvRV1的GenBank的登錄號顯示在圖2.4

21圖2.4FaVV2在Victoriviurs中RdRp區(qū)域的氨基酸序列構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹Figure2.4PhylogenetictreeconstructedbytheaminoacidsequenceoftheRdRpregionofFaVV2inVictoriviurs注：利用全病毒科病毒RdRp區(qū)域的氨基酸序列，采用鄰接法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹。在節(jié)點上顯示百分比引導值（1000次重復），GenBank登錄號放在病毒名稱之前。2.3.4禾谷鐮孢菌中FgALV1病毒的基因組結(jié)構(gòu)及系統(tǒng)進化分析CF16158中大部分病毒基因組序列是從CF16158轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)中發(fā)現(xiàn)的（未發(fā)表的數(shù)據(jù)，在GenepioneerBiotech公司IlluminaHiSeqXTen平臺上測序）。對菌株CF16158的7500bp左右的條帶進行了克隆測序，獲取序列在Geneious11.1.4軟件上進行拼接組裝，并根據(jù)拼接獲得的序列再設(shè)計特異性引物補充Gap。從CF16158菌株中獲取一條序列，大小為7501bp。利用Geneious11.1.4軟件對該病毒的cDNA序列進行ORF翻譯，并進行了保守結(jié)構(gòu)域預測，發(fā)現(xiàn)該病毒有四個ORF，ORF2預測編碼Hel和RdRp，根據(jù)預測的保守結(jié)構(gòu)域進行BLAST搜索。FgALV1病毒基因組全長為7501bp（登錄號：MN400076），5′和3′非翻譯區(qū)（UTR）分別為70和245個核苷酸長，在3′UTR中有一個Poly(A)尾巴。ORF1（71-436nt）的長度為366nt，編碼一個假定的121aa蛋白，其分子量為13.76kDa。ORF2（424-6387nt）長5964nt，與ORF1的3′端13nt重疊。ORF2被預測編碼一個1987aa蛋白，分子量為223.54kDa，包含一個Hel(3652-4425nt)和一個RdRp(4987-6066nt)保

【參考文獻】：
期刊論文
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博士論文
[1]禾谷鐮刀菌中SR蛋白FgSrp1和FgSrp2的功能研究[D]. 張藝美.西北農(nóng)林科技大學 2017
[2]禾谷鐮刀菌細胞壁形成相關(guān)基因及其 RNAi 片段功能鑒定[D]. 宋修仕.華中農(nóng)業(yè)大學 2015

碩士論文
[1]亞洲鐮孢菌（Fusarium asiaticum）對氰烯菌酯的抗藥性遺傳多樣性及其適合度研究[D]. 李斌.南京農(nóng)業(yè)大學 2017
[2]禾谷鐮刀菌病毒FgHV2/JS16和FgMTV1/SX64的功能鑒定[D]. 李鵬飛.中國農(nóng)業(yè)科學院 2016



本文編號：3106443