三種煙草病毒在煙田土壤中的分布動態(tài)及在煙草中的互作
發(fā)布時間:2021-03-26 19:53
煙草(Nicotiana tabacum L)是一種重要經(jīng)濟作物。病毒病給煙草產(chǎn)業(yè)帶來嚴(yán)重的經(jīng)濟損失。其中,煙草花葉病毒(Tobacco mosaic virus,TMV)、黃瓜花葉病毒(Cucumber mosaic virus,CMV)、馬鈴薯Y病毒(Potato virus Y,PVY)的危害最為嚴(yán)重。近年來,煙田中兩種或者多種病毒復(fù)合侵染的比例日益增高。煙田土壤帶有TMV、CMV、PVY是導(dǎo)致煙株帶毒的重要因素。為了建立高效的煙田土壤病毒檢測方法,搞清煙草中多重病毒互作的機理,本文展開了系列研究,主要結(jié)果如下:1本研究建立了完善的煙田土壤攜帶病毒的檢測方法。分別利用ELISA、RT-PCR、熒光定量RT-PCR和RT-LAMP的方法均可以對煙田土壤中的TMV、CMV、PVY進行有效檢測。四種方法檢測TMV靈敏度分別為10-3g土/mL、10-3、10-5和10-6;檢測CMV的靈敏度分別是10-1g土/mL、10-1、10-3...
【文章來源】:華南農(nóng)業(yè)大學(xué)廣東省
【文章頁數(shù)】:124 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
TMV病毒粒子結(jié)構(gòu)組成圖(周鵬,2014)
圖 1.1 TMV 病毒粒子結(jié)構(gòu)組成圖(周鵬,2014)TMV 基因組的 5‘端和 3‘端為非翻譯區(qū),它含有 5 個部分重疊的開放閱讀框(OpenReading Frame,ORF1、ORF2、ORF3、ORF4 和 ORF5),編碼 4 個蛋白,分別為 126 kD 蛋白、183 kD 蛋白、30 kD 蛋白和 17.5 kD 蛋白。5‘端 ORF1編碼 126KD 蛋白,ORF1 與 ORF2 重疊,編碼 183 kD 蛋白,183 kD 蛋白是 126kD 蛋白 ORF 終止子通讀產(chǎn)生的,其中通讀部分蛋白大小為 54 kD(又稱 54 kD蛋白),含有復(fù)制酶保守序列。126 ku和 183 ku蛋白參與病毒的復(fù)制,又稱 RNA依賴性 RNA 聚合酶(RNAdependent RNApolymerase,RdRp)蛋白,其中 126 ku是 TMV 病毒的沉默抑制子。ORF4 編碼 30 kD 蛋白,30 kD 蛋白參與病毒在細胞間的移動,又稱運動蛋白(Movement protein,MP)。ORF5 編碼 17.5 kD 蛋白,17.5 kD 蛋白為病毒的外殼蛋白(Coat protein,CP)(張寧,2014;陳偉,2008)。
圖 1.3 黃瓜花葉病毒粒子結(jié)構(gòu)示意圖(李喜英,2009)注:圖左為 CMV 病毒粒 外部 構(gòu),圖右為 CMV 病毒粒 內(nèi)部 構(gòu)CMV 是一種三分體正義單鏈 RNA(positive single strand RNA,+ssRNA)病毒,它由三條基因組 RNA(RNA1、RNA2、RNA3)和兩條亞基因組(RNA4、RNA4A)組成,有的還含有衛(wèi)星 RNA(SatelliteRNA)。其中 RNA4 是 RNA3 的亞基因組,RNA4A 是 RNA2 的亞基因組,分別編碼 5 種病毒必需蛋白,因此在寄主體內(nèi)每種蛋白的含量都單獨由一條基因組/亞基因組的表達量決定(Sivakumaranralet al.,2000;Sivakumaranralet al.,2002,曾蓉,2007)。CMV 基因組的每個 RNA 片段的 5`端為甲基化的帽子結(jié)構(gòu)(m7GS`ppps'Gp),3'端有一個約 200nt(nucleotide,nt)的高度同源保守區(qū)域, 無 Poly(A)結(jié)構(gòu)及相應(yīng)功能,但能折疊成 tRNA 狀結(jié)構(gòu),可以結(jié)合酪氨酸,促進負義 RNA 鏈的合成。CMV 基因組由 5 個開放的閱讀框架(open reading frame,ORF)組成。RNAI
本文編號:3102155
【文章來源】:華南農(nóng)業(yè)大學(xué)廣東省
【文章頁數(shù)】:124 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
TMV病毒粒子結(jié)構(gòu)組成圖(周鵬,2014)
圖 1.1 TMV 病毒粒子結(jié)構(gòu)組成圖(周鵬,2014)TMV 基因組的 5‘端和 3‘端為非翻譯區(qū),它含有 5 個部分重疊的開放閱讀框(OpenReading Frame,ORF1、ORF2、ORF3、ORF4 和 ORF5),編碼 4 個蛋白,分別為 126 kD 蛋白、183 kD 蛋白、30 kD 蛋白和 17.5 kD 蛋白。5‘端 ORF1編碼 126KD 蛋白,ORF1 與 ORF2 重疊,編碼 183 kD 蛋白,183 kD 蛋白是 126kD 蛋白 ORF 終止子通讀產(chǎn)生的,其中通讀部分蛋白大小為 54 kD(又稱 54 kD蛋白),含有復(fù)制酶保守序列。126 ku和 183 ku蛋白參與病毒的復(fù)制,又稱 RNA依賴性 RNA 聚合酶(RNAdependent RNApolymerase,RdRp)蛋白,其中 126 ku是 TMV 病毒的沉默抑制子。ORF4 編碼 30 kD 蛋白,30 kD 蛋白參與病毒在細胞間的移動,又稱運動蛋白(Movement protein,MP)。ORF5 編碼 17.5 kD 蛋白,17.5 kD 蛋白為病毒的外殼蛋白(Coat protein,CP)(張寧,2014;陳偉,2008)。
圖 1.3 黃瓜花葉病毒粒子結(jié)構(gòu)示意圖(李喜英,2009)注:圖左為 CMV 病毒粒 外部 構(gòu),圖右為 CMV 病毒粒 內(nèi)部 構(gòu)CMV 是一種三分體正義單鏈 RNA(positive single strand RNA,+ssRNA)病毒,它由三條基因組 RNA(RNA1、RNA2、RNA3)和兩條亞基因組(RNA4、RNA4A)組成,有的還含有衛(wèi)星 RNA(SatelliteRNA)。其中 RNA4 是 RNA3 的亞基因組,RNA4A 是 RNA2 的亞基因組,分別編碼 5 種病毒必需蛋白,因此在寄主體內(nèi)每種蛋白的含量都單獨由一條基因組/亞基因組的表達量決定(Sivakumaranralet al.,2000;Sivakumaranralet al.,2002,曾蓉,2007)。CMV 基因組的每個 RNA 片段的 5`端為甲基化的帽子結(jié)構(gòu)(m7GS`ppps'Gp),3'端有一個約 200nt(nucleotide,nt)的高度同源保守區(qū)域, 無 Poly(A)結(jié)構(gòu)及相應(yīng)功能,但能折疊成 tRNA 狀結(jié)構(gòu),可以結(jié)合酪氨酸,促進負義 RNA 鏈的合成。CMV 基因組由 5 個開放的閱讀框架(open reading frame,ORF)組成。RNAI
本文編號:3102155
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